ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sepiella japonica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017749	TTTTA	4	122	141	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	38513704
2	NC_017749	CTCA	3	434	444	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	38513704
3	NC_017749	GTAA	3	989	999	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_017749	ATATTA	3	1469	1486	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38513704
5	NC_017749	TAT	5	1504	1518	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38513704
6	NC_017749	TAT	4	1670	1680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38513704
7	NC_017749	ATT	4	1761	1771	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38513704
8	NC_017749	TAA	4	1848	1859	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38513704
9	NC_017749	ATT	4	1876	1887	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38513704
10	NC_017749	TTAT	3	1907	1918	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38513704
11	NC_017749	GAG	4	2719	2730	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	38513704
12	NC_017749	TAT	4	3682	3693	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38513704
13	NC_017749	AT	6	3710	3722	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38513704
14	NC_017749	TAT	5	3805	3818	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38513704
15	NC_017749	ATTT	5	4362	4380	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	38513704
16	NC_017749	CTA	4	5295	5306	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38513705
17	NC_017749	CAAA	3	5402	5413	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38513705
18	NC_017749	AT	8	5452	5467	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38513705
19	NC_017749	CTAA	3	5489	5499	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38513705
20	NC_017749	TAA	4	5659	5669	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38513705
21	NC_017749	ATA	4	5895	5905	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38513705
22	NC_017749	ATTTT	3	6407	6420	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_017749	TAT	4	6646	6656	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_017749	ATTT	3	7143	7154	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_017749	TTA	4	7224	7235	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_017749	AATA	3	7305	7316	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_017749	TAA	4	7386	7397	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_017749	TACA	3	7543	7555	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
29	NC_017749	TAA	4	8263	8274	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_017749	ATA	4	8449	8461	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_017749	TATAT	4	8670	8688	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_017749	TA	6	9010	9020	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_017749	TTA	4	9066	9076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_017749	AT	7	9185	9200	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_017749	TA	6	9230	9240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_017749	ATT	4	9579	9590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_017749	ATT	4	9877	9887	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38513705
38	NC_017749	TA	7	10116	10129	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38513705
39	NC_017749	TAAA	3	10315	10326	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38513705
40	NC_017749	TAA	4	10426	10436	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38513705
41	NC_017749	AAATA	3	10486	10499	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38513705
42	NC_017749	TAT	4	10966	10977	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38513705
43	NC_017749	AT	6	11072	11082	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38513705
44	NC_017749	ATTT	3	11412	11422	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38513705
45	NC_017749	AATA	3	11736	11747	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38513705
46	NC_017749	AT	6	11887	11897	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38513705
47	NC_017749	ATA	4	11958	11970	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38513705
48	NC_017749	TAAAT	3	12036	12050	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	38513705
49	NC_017749	ATT	5	12320	12334	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38513705
50	NC_017749	ATAA	3	12471	12482	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38513705
51	NC_017749	TAAA	3	12514	12524	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38513705
52	NC_017749	AT	6	12754	12764	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38513705
53	NC_017749	AAT	4	12890	12901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38513705
54	NC_017749	TA	6	13033	13043	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38513705
55	NC_017749	TAA	4	13210	13221	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38513705
56	NC_017749	AAT	4	13350	13361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38513705
57	NC_017749	TTA	4	13548	13559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_017749	AATAA	4	14118	14137	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	38513705
59	NC_017749	AAAC	3	14280	14291	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38513705
60	NC_017749	AAT	4	14463	14473	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38513705
61	NC_017749	A	13	14549	14561	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38513705
62	NC_017749	ATAA	3	15028	15039	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38513705
63	NC_017749	AT	6	15124	15134	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38513705
64	NC_017749	AAAT	3	15168	15178	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38513705
65	NC_017749	TAA	4	15312	15323	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	38513705
66	NC_017749	TTTAA	3	15377	15391	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_017749	TA	6	15648	15658	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_017749	TTA	4	15704	15714	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_017749	AT	7	15823	15838	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_017749	TA	6	15868	15878	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sepiella japonica mitochondrion