ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Amblyomma sphenodonti mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017745	TATAAT	3	95	112	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38509964
2	NC_017745	TTTA	3	257	267	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38509964
3	NC_017745	ATT	5	312	326	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	38509964
4	NC_017745	ATT	4	734	746	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509964
5	NC_017745	TTA	4	913	924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509964
6	NC_017745	TAT	4	2810	2821	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509962
7	NC_017745	TTTAAT	3	3101	3119	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	38509962
8	NC_017745	TAA	4	3615	3626	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509963
9	NC_017745	TCT	4	3672	3683	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38509963
10	NC_017745	A	12	3832	3843	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38509963
11	NC_017745	CTTTA	3	4373	4388	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	38509963
12	NC_017745	TAT	4	4549	4561	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38509963
13	NC_017745	T	15	4573	4587	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	38509963
14	NC_017745	TTTC	3	4951	4962	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38509963
15	NC_017745	ATTT	3	5079	5090	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38509963
16	NC_017745	TAGTA	3	5094	5108	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_017745	ATT	6	5186	5202	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	38509963
18	NC_017745	TAT	4	5900	5911	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509963
19	NC_017745	ATT	4	6525	6535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509963
20	NC_017745	AAAGT	3	6703	6717	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	38509963
21	NC_017745	TAA	4	6831	6842	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_017745	AATT	3	7688	7698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_017745	ATT	4	7780	7791	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_017745	TAA	5	8292	8306	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_017745	ATT	4	8307	8318	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_017745	TTTA	3	8505	8515	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_017745	TTAA	3	8577	8588	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_017745	AATTT	3	8764	8778	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017745	TAA	4	9321	9331	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509963
30	NC_017745	TAA	4	9600	9611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509963
31	NC_017745	AAAT	3	9672	9682	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509963
32	NC_017745	A	12	9873	9884	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38509963
33	NC_017745	TAAA	4	10271	10286	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38509963
34	NC_017745	ATT	4	10507	10518	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509963
35	NC_017745	AT	6	10706	10717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38509963
36	NC_017745	CTAT	3	10730	10741	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38509963
37	NC_017745	TAAA	3	10812	10822	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509963
38	NC_017745	TTA	4	10922	10933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509963
39	NC_017745	AAT	4	11212	11223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38509963
40	NC_017745	A	15	12004	12018	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	38509963
41	NC_017745	AAATAA	3	12045	12063	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	38509963
42	NC_017745	TAAA	3	12077	12087	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509963
43	NC_017745	TTA	4	12908	12919	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509963
44	NC_017745	AAAT	3	12942	12953	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38509963
45	NC_017745	ATT	4	12979	12990	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38509963
46	NC_017745	T	14	13415	13428	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38509963
47	NC_017745	ATA	4	13659	13669	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38509963
48	NC_017745	TAT	4	13867	13877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38509963
49	NC_017745	AATA	3	14070	14080	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38509963
50	NC_017745	T	16	14413	14428	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Amblyomma sphenodonti mitochondrion