ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Athyma sulpitia mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017744	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_017744	ATTCTT	3	240	258	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	10 %	38509960
3	NC_017744	TTTTA	3	287	300	14	20 %	80 %	0 %	7 %	38509960
4	NC_017744	TAT	4	534	545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509960
5	NC_017744	TTA	4	678	688	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	38509960
6	NC_017744	AATT	3	789	799	11	50 %	50 %	0 %	9 %	38509960
7	NC_017744	ATT	4	820	831	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509960
8	NC_017744	TAT	4	900	911	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509960
9	NC_017744	TTTA	3	1219	1230	12	25 %	75 %	0 %	8 %	38509960
10	NC_017744	TTAA	3	1268	1280	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_017744	TAT	4	2026	2037	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509961
12	NC_017744	ATTT	4	2474	2489	16	25 %	75 %	0 %	6 %	38509961
13	NC_017744	ATA	5	2838	2852	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	38509961
14	NC_017744	AATT	3	3716	3726	11	50 %	50 %	0 %	9 %	38509960
15	NC_017744	ATT	4	3948	3958	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	38509961
16	NC_017744	AAAT	3	3991	4001	11	75 %	25 %	0 %	9 %	38509961
17	NC_017744	ATT	4	4110	4122	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	38509960
18	NC_017744	TAATTT	3	4822	4839	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	38509961
19	NC_017744	ATT	4	4859	4869	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	38509961
20	NC_017744	TTTC	3	4990	5001	12	0 %	75 %	25 %	8 %	38509961
21	NC_017744	TATTTA	3	5502	5520	19	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_017744	ATA	4	5578	5589	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38509961
23	NC_017744	ATT	5	5596	5610	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	38509961
24	NC_017744	ATTT	3	5634	5644	11	25 %	75 %	0 %	9 %	38509961
25	NC_017744	TAT	4	5856	5867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509961
26	NC_017744	TA	21	6172	6212	41	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_017744	TA	7	6214	6228	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_017744	TAAA	3	6468	6479	12	75 %	25 %	0 %	0 %	38509961
29	NC_017744	ATT	4	6770	6781	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509961
30	NC_017744	AAAT	3	7014	7025	12	75 %	25 %	0 %	8 %	38509961
31	NC_017744	ATT	4	7180	7192	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	38509961
32	NC_017744	TTA	4	7293	7304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38509961
33	NC_017744	ATA	4	7401	7412	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38509961
34	NC_017744	AATT	3	7432	7443	12	50 %	50 %	0 %	8 %	38509961
35	NC_017744	TAA	4	7836	7848	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	38509961
36	NC_017744	AAAAAT	3	8108	8125	18	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	38509961
37	NC_017744	ATC	4	8520	8531	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38509961
38	NC_017744	AATT	3	8797	8809	13	50 %	50 %	0 %	7 %	38509961
39	NC_017744	TAAA	3	9043	9053	11	75 %	25 %	0 %	9 %	38509961
40	NC_017744	AAAT	3	9127	9137	11	75 %	25 %	0 %	9 %	38509961
41	NC_017744	AAAAT	3	9216	9229	14	80 %	20 %	0 %	7 %	38509961
42	NC_017744	ATA	4	9455	9467	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	38509961
43	NC_017744	ATTAA	3	9560	9574	15	60 %	40 %	0 %	0 %	38509961
44	NC_017744	ATA	4	9707	9718	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38509961
45	NC_017744	ATA	5	9814	9828	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	38509961
46	NC_017744	ATT	4	9957	9968	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_017744	AATTTC	3	10015	10032	18	33.33 %	50 %	16.67 %	5 %	38509961
48	NC_017744	ATT	5	10168	10182	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	38509961
49	NC_017744	TAA	5	10419	10433	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	38509961
50	NC_017744	TTAT	5	10430	10449	20	25 %	75 %	0 %	5 %	38509961
51	NC_017744	TTAA	3	10506	10516	11	50 %	50 %	0 %	9 %	38509961
52	NC_017744	TA	6	10683	10693	11	50 %	50 %	0 %	9 %	38509961
53	NC_017744	TTA	7	10877	10896	20	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	38509961
54	NC_017744	ATTT	3	11072	11082	11	25 %	75 %	0 %	9 %	38509961
55	NC_017744	ATTT	3	11114	11124	11	25 %	75 %	0 %	9 %	38509961
56	NC_017744	TTA	4	11565	11575	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	38509961
57	NC_017744	AAAT	3	11777	11787	11	75 %	25 %	0 %	9 %	38509961
58	NC_017744	A	12	11876	11887	12	100 %	0 %	0 %	8 %	38509961
59	NC_017744	TAT	5	12128	12145	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	38509961
60	NC_017744	TTAA	3	12174	12186	13	50 %	50 %	0 %	7 %	38509961
61	NC_017744	AAT	4	12454	12465	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	38509961
62	NC_017744	TTAA	3	12784	12794	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_017744	T	14	12964	12977	14	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_017744	TAA	4	13027	13038	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_017744	ATCA	3	13043	13054	12	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_017744	TA	6	13139	13149	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_017744	ATA	4	13471	13481	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_017744	TTA	4	13488	13499	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_017744	T	16	13504	13519	16	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_017744	ATT	4	13520	13530	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_017744	ATTA	3	14078	14089	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017744	TTTA	5	14677	14695	19	25 %	75 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_017744	TAATT	3	14709	14723	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017744	ATT	4	14823	14835	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_017744	T	23	14939	14961	23	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_017744	TAT	4	15016	15027	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_017744	AT	9	15115	15132	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_017744	TAAT	4	15149	15165	17	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_017744	TA	12	15193	15216	24	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Athyma sulpitia mitochondrion