ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nitella hyalina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017598	AT	6	1721	1732	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_017598	AT	8	1735	1749	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_017598	ATGG	3	3223	3233	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_017598	TGGA	3	4402	4412	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_017598	CT	6	4497	4507	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_017598	CTTC	4	5392	5407	16	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017598	ACGC	4	5533	5548	16	25 %	0 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
8	NC_017598	AATG	3	7456	7467	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_017598	GAAA	3	8553	8565	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	38515344
10	NC_017598	TGCT	3	10998	11008	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_017598	AAG	4	14400	14411	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38515344
12	NC_017598	TATT	3	14569	14579	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_017598	GTTT	3	15077	15089	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_017598	AG	6	16333	16343	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_017598	TTGA	4	16532	16551	20	25 %	50 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_017598	CACG	3	17335	17345	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_017598	AGC	4	17674	17684	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_017598	CCAC	3	17701	17712	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017598	TAA	4	18093	18104	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38515340
20	NC_017598	GTTT	3	18275	18286	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38515340
21	NC_017598	TTGT	3	19698	19708	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_017598	AGT	4	21989	22000	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38515340
23	NC_017598	ATCA	3	24193	24207	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
24	NC_017598	TTCA	3	24699	24709	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_017598	TGTT	5	27014	27033	20	0 %	75 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_017598	TTTCCT	3	27209	27226	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	38515340
27	NC_017598	ATA	4	28218	28228	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38515341
28	NC_017598	GC	6	29185	29195	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	38515341
29	NC_017598	TTCTT	3	30068	30082	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	38515341
30	NC_017598	TTTG	3	30877	30888	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38515341
31	NC_017598	TTC	4	31843	31854	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	38515341
32	NC_017598	ATTT	3	32386	32396	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38515341
33	NC_017598	AT	7	32418	32431	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_017598	TTG	4	32639	32651	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_017598	TAAAA	3	32901	32914	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	38515341
36	NC_017598	ATCT	3	34283	34293	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38515341
37	NC_017598	TTGT	3	36079	36089	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38515341
38	NC_017598	AAC	4	36200	36211	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	38515341
39	NC_017598	CTTT	3	38169	38180	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_017598	T	12	38708	38719	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_017598	CTAT	3	39722	39733	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38515341
42	NC_017598	GAT	4	40830	40840	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38515341
43	NC_017598	TA	6	42316	42326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38515341
44	NC_017598	GTAT	3	43540	43550	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38515341
45	NC_017598	AT	7	43693	43707	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38515341
46	NC_017598	CTTA	3	44130	44141	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38515341
47	NC_017598	ATT	4	45787	45797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38515341
48	NC_017598	TA	6	46753	46763	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_017598	TA	6	46774	46785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_017598	TTTG	3	47750	47760	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_017598	T	13	49946	49958	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_017598	TATTG	3	53677	53691	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	38515342
53	NC_017598	ATA	5	57697	57710	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_017598	A	12	58220	58231	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	38515342
55	NC_017598	TAA	4	58440	58451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	38515342
56	NC_017598	T	12	58926	58937	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_017598	GGGT	3	59084	59095	12	0 %	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017598	TTCCA	3	61510	61524	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	38515342
59	NC_017598	TAA	4	62269	62279	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38515342
60	NC_017598	TTTC	3	62488	62499	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38515342
61	NC_017598	AAC	4	64189	64199	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	38515342
62	NC_017598	AACC	3	64986	64996	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	38515342
63	NC_017598	A	13	65677	65689	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38515342
64	NC_017598	ACAT	3	65757	65768	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	38515342
65	NC_017598	AGAAA	3	66085	66099	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	38515342
66	NC_017598	TAAA	3	66112	66123	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38515342
67	NC_017598	A	13	66596	66608	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38515343
68	NC_017598	CTA	4	66797	66807	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38515343
69	NC_017598	ACA	5	67112	67126	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	38515343
70	NC_017598	GAAA	3	68106	68116	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38515343
71	NC_017598	TGG	4	68225	68236	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	38515343
72	NC_017598	TAAA	3	68364	68375	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38515343
73	NC_017598	AAAG	3	69160	69170	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38515343
74	NC_017598	ACT	4	73797	73808	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38515343
75	NC_017598	AAG	4	73991	74002	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38515343
76	NC_017598	CTA	4	74361	74372	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	38515343
77	NC_017598	AGG	4	74831	74842	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	38515343
78	NC_017598	GGAT	3	75668	75679	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	38515343
79	NC_017598	TTGG	3	75680	75691	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	38515343
80	NC_017598	GA	6	75801	75811	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38515343
81	NC_017598	TAT	4	79322	79333	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38515343
82	NC_017598	AATGAA	3	79760	79778	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	38515343

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