ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Mankyua chejuensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017006	AGT	4	1604	1614	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38393055
2	NC_017006	ATA	4	2521	2533	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38393055
3	NC_017006	AGG	4	2813	2823	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	38393055
4	NC_017006	ATT	4	7946	7956	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
5	NC_017006	ATT	4	12812	12823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
6	NC_017006	CAG	4	18769	18780	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38393055
7	NC_017006	TAA	4	27410	27420	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38393055
8	NC_017006	CAG	4	31724	31735	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38393055
9	NC_017006	ATT	4	32207	32218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
10	NC_017006	CTT	4	36154	36166	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	38393055
11	NC_017006	ATT	4	38414	38424	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
12	NC_017006	ACC	4	42325	42336	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	38393055
13	NC_017006	TAT	4	46498	46509	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
14	NC_017006	AGT	4	50925	50935	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38393055
15	NC_017006	TAT	4	53916	53927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
16	NC_017006	ATG	4	54598	54608	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38393055
17	NC_017006	ATG	4	65166	65177	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38393055
18	NC_017006	TTA	4	70082	70092	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
19	NC_017006	AAT	4	84575	84587	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38393055
20	NC_017006	TTA	4	85310	85320	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
21	NC_017006	AGC	4	87679	87689	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	38393055
22	NC_017006	TCT	4	93617	93627	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38393060
23	NC_017006	TAG	5	100301	100315	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	38393061
24	NC_017006	CGG	4	110366	110377	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_017006	ATT	5	119156	119170	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_017006	ATT	5	120675	120688	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38393062
27	NC_017006	CCA	4	121311	121322	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
28	NC_017006	TAT	4	121689	121700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393062
29	NC_017006	ATA	4	133097	133108	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_017006	AAT	5	136342	136355	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_017006	CCG	4	141941	141952	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Mankyua chejuensis chloroplast