ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mankyua chejuensis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_017006	ATTT	3	97	107	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_017006	AGT	4	1604	1614	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38393055
3	NC_017006	ATA	4	2521	2533	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38393055
4	NC_017006	AATT	3	2569	2580	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393055
5	NC_017006	AGG	4	2813	2823	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	38393055
6	NC_017006	AAAAG	3	3781	3795	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	38393055
7	NC_017006	AGAA	4	3812	3827	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	38393055
8	NC_017006	AAAG	3	3854	3865	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38393055
9	NC_017006	GAAT	3	3882	3894	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	38393055
10	NC_017006	AGAA	3	5041	5052	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38393055
11	NC_017006	TTTA	4	7240	7255	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	38393055
12	NC_017006	TCTA	3	7330	7341	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38393055
13	NC_017006	ATT	4	7946	7956	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
14	NC_017006	T	13	8804	8816	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38393055
15	NC_017006	CATT	3	10462	10472	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38393055
16	NC_017006	CCTT	3	10856	10868	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38393055
17	NC_017006	ATTG	3	11001	11012	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	38393055
18	NC_017006	TC	7	11125	11137	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38393055
19	NC_017006	ATT	4	12812	12823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
20	NC_017006	TATT	3	16688	16699	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393055
21	NC_017006	T	27	17711	17737	27	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38393055
22	NC_017006	CAG	4	18769	18780	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38393055
23	NC_017006	GAAT	3	20681	20691	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38393055
24	NC_017006	TCCA	3	22365	22375	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	38393055
25	NC_017006	TTTTCT	3	22590	22607	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	38393055
26	NC_017006	TTTC	6	22633	22657	25	0 %	75 %	0 %	25 %	4 %	38393055
27	NC_017006	CATT	3	24081	24092	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38393055
28	NC_017006	TC	7	24405	24418	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38393055
29	NC_017006	AG	6	26177	26187	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38393055
30	NC_017006	AT	6	26372	26383	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393055
31	NC_017006	AGAAA	6	26923	26951	29	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	38393055
32	NC_017006	A	18	26949	26966	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	38393055
33	NC_017006	TAA	4	27410	27420	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38393055
34	NC_017006	AATC	3	28323	28333	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38393055
35	NC_017006	CAAT	3	29447	29457	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38393055
36	NC_017006	T	14	30753	30766	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38393055
37	NC_017006	ATCTGA	3	31223	31240	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	38393055
38	NC_017006	CAG	4	31724	31735	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	38393055
39	NC_017006	GGAA	3	31942	31953	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	38393055
40	NC_017006	A	14	32103	32116	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38393055
41	NC_017006	ATT	4	32207	32218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
42	NC_017006	GAAAA	3	32248	32262	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	38393055
43	NC_017006	TTCC	3	34080	34090	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38393055
44	NC_017006	TGAT	3	35447	35458	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	38393055
45	NC_017006	CTT	4	36154	36166	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	38393055
46	NC_017006	T	12	36254	36265	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38393055
47	NC_017006	AT	6	37914	37924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393055
48	NC_017006	ATT	4	38414	38424	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
49	NC_017006	AATT	3	40812	40822	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393055
50	NC_017006	AT	6	42249	42260	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393055
51	NC_017006	ACC	4	42325	42336	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	38393055
52	NC_017006	GTTT	3	43869	43879	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393055
53	NC_017006	AATA	3	44761	44771	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393055
54	NC_017006	A	14	44817	44830	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38393055
55	NC_017006	TTCAA	3	44963	44978	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	38393055
56	NC_017006	TAT	4	46498	46509	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
57	NC_017006	TGCAA	3	47637	47650	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	38393055
58	NC_017006	TC	6	48106	48117	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38393055
59	NC_017006	AAAG	3	48833	48844	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38393055
60	NC_017006	TTCC	3	50775	50787	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38393055
61	NC_017006	AGT	4	50925	50935	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38393055
62	NC_017006	AC	6	52170	52181	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	38393055
63	NC_017006	TAT	4	53916	53927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393055
64	NC_017006	ATG	4	54598	54608	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38393055
65	NC_017006	TC	6	57713	57723	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38393055
66	NC_017006	GGAACA	3	57724	57742	19	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10 %	38393055
67	NC_017006	T	13	57931	57943	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38393055
68	NC_017006	ACTA	3	58384	58395	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38393055
69	NC_017006	T	13	58594	58606	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38393055
70	NC_017006	TCTTT	3	59920	59934	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	38393055
71	NC_017006	TTTC	4	59948	59962	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	38393055
72	NC_017006	CT	6	59973	59984	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38393055
73	NC_017006	T	13	60138	60150	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38393055
74	NC_017006	ACAA	3	60847	60858	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38393055
75	NC_017006	A	13	62976	62988	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	38393055
76	NC_017006	ATG	4	65166	65177	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	38393055
77	NC_017006	TAAT	3	65209	65220	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393055
78	NC_017006	AAGA	3	66741	66752	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38393055
79	NC_017006	TGAA	3	69110	69120	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38393055
80	NC_017006	AGAA	3	69239	69250	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	38393055
81	NC_017006	GAAATG	3	69581	69599	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	38393055
82	NC_017006	TTA	4	70082	70092	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
83	NC_017006	TTTC	3	70832	70842	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393055
84	NC_017006	CAGA	3	71106	71116	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38393055
85	NC_017006	TTTC	3	73949	73960	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38393055
86	NC_017006	AAAG	3	75747	75758	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	38393055
87	NC_017006	GA	6	77879	77892	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	38393055
88	NC_017006	TC	6	77905	77916	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38393055
89	NC_017006	AAAG	3	78225	78235	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38393055
90	NC_017006	AAGG	3	80119	80129	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38393055
91	NC_017006	ATTC	3	81200	81211	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38393055
92	NC_017006	A	12	83834	83845	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38393055
93	NC_017006	TAAA	3	83898	83908	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393055
94	NC_017006	AAT	4	84575	84587	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	38393055
95	NC_017006	TTA	4	85310	85320	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	38393055
96	NC_017006	TTTA	3	86297	86308	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393055
97	NC_017006	T	14	86413	86426	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	38393055
98	NC_017006	AGC	4	87679	87689	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	38393055
99	NC_017006	TC	6	88432	88443	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38393055
100	NC_017006	T	13	89166	89178	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	38393055
101	NC_017006	TAGA	3	89422	89432	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38393055
102	NC_017006	GAAT	3	91503	91514	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38393060
103	NC_017006	AGAA	5	91943	91962	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
104	NC_017006	ATTC	3	92656	92667	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38393060
105	NC_017006	TCT	4	93617	93627	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38393060
106	NC_017006	TTCA	3	93908	93919	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017006	ATTC	3	95074	95085	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_017006	AT	29	95298	95351	54	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_017006	A	12	96767	96778	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	38393061
110	NC_017006	TACA	3	98869	98880	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_017006	TA	7	99615	99627	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_017006	TAG	5	100301	100315	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	38393061
113	NC_017006	CATC	4	100473	100488	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
114	NC_017006	T	18	100600	100617	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_017006	TC	6	100619	100629	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
116	NC_017006	T	12	102084	102095	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	38393061
117	NC_017006	TAAA	3	102172	102183	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393061
118	NC_017006	ATCT	3	105409	105420	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38393062
119	NC_017006	ATTC	3	105782	105792	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	38393062
120	NC_017006	TCTCT	3	106631	106644	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
121	NC_017006	ATCC	3	109989	110000	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_017006	CGG	4	110366	110377	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_017006	TGGT	3	110938	110949	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_017006	AGGT	4	113367	113382	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_017006	TCTT	3	115802	115812	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_017006	GATC	3	116013	116024	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	38393062
127	NC_017006	AAAT	3	116662	116672	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393062
128	NC_017006	ATT	5	119156	119170	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_017006	TTTTC	3	119411	119425	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
130	NC_017006	AATT	3	119673	119684	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_017006	ATT	5	120675	120688	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	38393062
132	NC_017006	ATTT	3	120733	120744	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38393062
133	NC_017006	CCA	4	121311	121322	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
134	NC_017006	TAT	4	121689	121700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	38393062
135	NC_017006	ATGG	3	126443	126453	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	38393063
136	NC_017006	ATA	4	133097	133108	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_017006	AAT	5	136342	136355	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_017006	CTAC	3	138938	138949	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017006	CTAA	3	141366	141377	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
140	NC_017006	CCG	4	141941	141952	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
141	NC_017006	GGAT	3	142318	142329	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Mankyua chejuensis chloroplast