ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gigaspora rosea mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016985	CTT	4	554	565	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016985	GCAA	3	1510	1520	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016985	CTCTT	3	2626	2640	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016985	AAAGG	5	4048	4072	25	60 %	0 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016985	GGAA	3	4117	4128	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016985	TCAT	3	4697	4707	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016985	AAG	4	5371	5381	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016985	AGCAT	3	5874	5887	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016985	CAGG	3	7910	7921	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016985	GCGG	3	8796	8806	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016985	TACT	3	9529	9539	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016985	GTTAA	3	9856	9869	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016985	AAGA	3	10823	10834	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016985	TACCA	3	11510	11523	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016985	CT	6	12633	12643	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016985	CTTAT	3	12979	12992	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016985	TTCC	3	13684	13695	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016985	TCCC	3	13764	13774	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016985	CCCG	3	14113	14123	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016985	TTCGA	4	17429	17448	20	20 %	40 %	20 %	20 %	10 %	38050883
21	NC_016985	CTT	4	17975	17986	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38050883
22	NC_016985	AAGGG	3	21093	21107	15	40 %	0 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016985	CT	6	22158	22168	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016985	GCCC	3	23616	23627	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016985	TAGC	3	23723	23734	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016985	GTA	4	23735	23747	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016985	ATC	4	24786	24796	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016985	TTGG	3	25952	25964	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016985	CTTT	3	27260	27271	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38050885
30	NC_016985	GA	6	28561	28571	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	38050885
31	NC_016985	ATC	4	29545	29555	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	38050885
32	NC_016985	GTAA	3	30511	30521	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38050885
33	NC_016985	TA	6	32521	32531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38050885
34	NC_016985	TTG	5	34545	34558	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	38050885
35	NC_016985	CTTT	3	36363	36374	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	38050885
36	NC_016985	CTTA	3	39176	39187	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38050885
37	NC_016985	GAA	4	44890	44902	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	38050885
38	NC_016985	AGA	4	46153	46163	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38050885
39	NC_016985	GGAT	3	46571	46582	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	38050885
40	NC_016985	TC	6	50063	50073	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	38050885
41	NC_016985	AAGAG	3	50656	50669	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	38050885
42	NC_016985	GGGC	3	51257	51267	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	38050885
43	NC_016985	GCCG	3	52119	52129	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	38050885
44	NC_016985	CCTT	3	52205	52217	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38050885
45	NC_016985	AAGT	3	52265	52276	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38050885
46	NC_016985	TCT	4	52659	52669	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38050885
47	NC_016985	CT	6	53775	53787	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	38050885
48	NC_016985	GGTT	3	55791	55801	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	38050885
49	NC_016985	AAGG	3	56059	56071	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	38050885
50	NC_016985	TTGG	3	56275	56287	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	38050885
51	NC_016985	TAG	4	57287	57297	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	38050885
52	NC_016985	AGA	4	58300	58311	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38050885
53	NC_016985	GCCC	3	59419	59430	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	38050885
54	NC_016985	AGTA	3	60682	60692	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38050885
55	NC_016985	AAGG	3	60815	60826	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	38050885
56	NC_016985	CCAT	3	63993	64003	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	38050885
57	NC_016985	TAGCA	3	65148	65161	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	38050885
58	NC_016985	GAA	4	67358	67369	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	38050885
59	NC_016985	AGA	4	67529	67541	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	38050885
60	NC_016985	TAAAC	3	71858	71872	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	38050885
61	NC_016985	GGGC	3	73016	73026	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	38050885
62	NC_016985	GGAAG	5	73455	73479	25	40 %	0 %	60 %	0 %	8 %	38050885
63	NC_016985	TACC	3	73901	73911	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	38050885
64	NC_016985	G	13	76718	76730	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	38050885
65	NC_016985	TCA	4	76838	76849	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	38050885
66	NC_016985	CTTC	3	77984	77995	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38050885
67	NC_016985	GAGT	3	78736	78746	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	38050885
68	NC_016985	TTGG	3	79533	79545	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	38050885
69	NC_016985	AAG	4	81069	81079	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	38050885
70	NC_016985	TTAAGG	3	82169	82187	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	38050885
71	NC_016985	CCAA	3	84717	84729	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	38050885
72	NC_016985	CTT	4	86209	86219	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	38050885
73	NC_016985	GCC	4	90622	90632	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	38050885
74	NC_016985	CTAG	3	90938	90948	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	38050885
75	NC_016985	GCAA	3	93832	93842	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016985	AGGGA	4	94053	94073	21	40 %	0 %	60 %	0 %	4 %	Non-Coding
77	NC_016985	CCT	4	94440	94450	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gigaspora rosea mitochondrion