ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Peltigera membranacea mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016957	TAAA	3	5	15	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016957	T	15	634	648	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016957	TAT	5	1456	1470	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016957	TTA	4	1620	1631	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016957	TA	7	2083	2096	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016957	ATTT	3	3792	3803	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016957	TA	7	3815	3828	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016957	AT	9	4108	4125	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016957	AAAC	3	4394	4404	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016957	TA	6	4412	4422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016957	AT	6	4441	4453	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016957	ATA	4	5137	5148	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016957	AAAC	3	5245	5257	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016957	ATT	4	5751	5763	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016957	TAT	4	5842	5852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016957	TTG	4	7256	7267	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016957	TAT	4	7423	7433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016957	TTTAT	3	7549	7563	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016957	AAAT	11	7944	7988	45	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016957	AT	8	8521	8536	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016957	GTA	4	8719	8729	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016957	AAAT	3	8744	8756	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016957	GCAA	3	9046	9057	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016957	AT	7	9725	9738	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016957	TATT	3	9844	9855	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016957	TATAA	4	9932	9950	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
27	NC_016957	TGTT	3	9962	9972	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016957	ATT	4	10019	10029	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016957	TA	7	10385	10400	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016957	TTAT	3	10426	10437	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016957	A	13	10651	10663	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016957	ATA	4	10754	10766	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016957	TAA	4	10885	10896	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016957	TAAA	3	10976	10987	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016957	A	12	11723	11734	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	37882921
36	NC_016957	AGGGAA	3	12004	12021	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	37882921
37	NC_016957	TA	6	12688	12698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016957	TAA	4	14328	14339	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016957	T	12	14440	14451	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016957	TTA	4	15126	15136	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016957	TATT	3	15747	15757	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016957	AATA	3	15966	15977	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016957	TA	10	16106	16124	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
44	NC_016957	ATT	4	16262	16273	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016957	TA	7	16482	16494	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016957	TAT	5	16757	16770	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016957	TTAT	3	17845	17856	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37882922
48	NC_016957	TTA	4	18752	18762	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882922
49	NC_016957	TAT	5	19366	19381	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016957	AAATA	3	19838	19852	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	37882922
51	NC_016957	CGTA	3	20392	20402	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37882922
52	NC_016957	AAAT	3	21777	21788	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37882922
53	NC_016957	TTA	4	22348	22358	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882922
54	NC_016957	ATA	4	22710	22720	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37882922
55	NC_016957	TA	6	23011	23022	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37882922
56	NC_016957	TA	8	23408	23423	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37882922
57	NC_016957	TA	6	23463	23473	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37882922
58	NC_016957	ATTTAT	3	24277	24294	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37882922
59	NC_016957	TAAA	3	24553	24563	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37882922
60	NC_016957	TAT	4	25045	25056	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882922
61	NC_016957	TA	7	25243	25256	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37882922
62	NC_016957	AT	8	25792	25806	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37882922
63	NC_016957	CTA	4	25953	25964	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37882922
64	NC_016957	TTA	4	27023	27034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	37882922
65	NC_016957	GTTT	5	27040	27060	21	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37882922
66	NC_016957	TTATAT	3	27214	27231	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_016957	ATT	4	27587	27598	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882922
68	NC_016957	TTATTT	3	27655	27672	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	37882922
69	NC_016957	ATT	4	28057	28068	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882922
70	NC_016957	TTTA	3	28926	28936	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016957	T	12	29263	29274	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016957	TA	6	29470	29480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016957	AAC	4	29518	29528	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016957	ATT	4	29854	29865	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016957	AG	6	29929	29939	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016957	TAT	4	31076	31087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016957	CTAT	3	31699	31709	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016957	TAT	4	32177	32188	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016957	AAT	4	32648	32658	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016957	AT	7	32868	32881	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016957	TAC	4	33028	33039	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016957	TGT	4	33262	33272	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016957	TTA	4	34034	34044	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882922
84	NC_016957	GTTT	3	34335	34345	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37882922
85	NC_016957	AATAT	3	34717	34731	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016957	TAAA	3	34803	34813	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016957	TAT	4	34814	34824	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016957	TTA	6	34842	34860	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
89	NC_016957	AT	6	34871	34881	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016957	CGCT	3	35303	35314	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016957	AT	6	36149	36160	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016957	A	12	36235	36246	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016957	TAA	4	36355	36365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016957	TAAA	3	36871	36881	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37882922
95	NC_016957	TAA	4	36953	36964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882922
96	NC_016957	AT	6	37236	37246	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37882922
97	NC_016957	ATGT	3	37582	37593	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37882922
98	NC_016957	TAA	4	38240	38250	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37882922
99	NC_016957	AATT	3	38407	38417	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37882922
100	NC_016957	AAAG	3	38919	38929	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37882922
101	NC_016957	ATATAA	3	39170	39187	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37882922
102	NC_016957	TAT	6	39689	39706	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37882922
103	NC_016957	TGG	4	39780	39791	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37882922
104	NC_016957	TTTA	3	40512	40522	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37882922
105	NC_016957	AACAA	3	43094	43108	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	37882922
106	NC_016957	AAAT	3	43303	43313	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37882922
107	NC_016957	AAT	4	43517	43528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882922
108	NC_016957	TATTTT	8	43721	43769	49	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	37882922
109	NC_016957	TA	7	44148	44160	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37882922
110	NC_016957	TAT	4	44412	44423	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882922
111	NC_016957	TAT	4	44999	45009	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882922
112	NC_016957	TTTA	3	45427	45437	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37882922
113	NC_016957	ATA	4	45493	45504	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	37882922
114	NC_016957	TAA	4	46209	46220	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882922
115	NC_016957	AATG	3	47373	47383	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016957	AT	6	47479	47490	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016957	TTA	4	47524	47534	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016957	AAT	4	47943	47955	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016957	T	12	48229	48240	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	37882923
120	NC_016957	TAA	5	50766	50780	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37882923
121	NC_016957	TATATT	3	51562	51579	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37882923
122	NC_016957	TTATGG	4	52096	52119	24	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	8 %	37882923
123	NC_016957	TAT	4	52258	52269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882923
124	NC_016957	TAA	4	53476	53487	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882924
125	NC_016957	AT	6	54327	54338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016957	TTTTTA	3	54658	54676	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
127	NC_016957	TTTAT	3	54719	54732	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016957	AT	7	54951	54964	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016957	TTATA	3	54966	54979	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016957	ATAA	3	55556	55566	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016957	TA	7	55840	55852	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016957	A	23	55935	55957	23	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	37882923
133	NC_016957	AGGTGT	3	56016	56033	18	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	5 %	37882923
134	NC_016957	AAT	4	56309	56320	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016957	TTTA	3	56865	56876	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016957	ATTA	4	57777	57791	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016957	AATT	3	58038	58049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016957	TTTA	3	58354	58364	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016957	AAC	4	58610	58621	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016957	TAT	4	58735	58745	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016957	TAT	4	58856	58866	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016957	TA	7	59150	59162	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016957	T	13	59197	59209	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016957	TAAA	3	59435	59447	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016957	AAATTA	3	59641	59659	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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147	NC_016957	TTTAT	3	60480	60494	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016957	TAG	5	60553	60567	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
149	NC_016957	GTA	4	60788	60799	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016957	ATT	4	61534	61545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016957	T	14	61541	61554	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016957	GTTT	3	62210	62221	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Peltigera membranacea mitochondrion