ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Peltigera malacea mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016955	ATAA	3	253	263	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016955	T	15	876	890	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016955	TACT	3	1634	1644	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016955	ATT	4	1702	1713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016955	TTA	4	1858	1868	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016955	TAGA	3	1925	1936	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016955	TA	6	2319	2330	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016955	TAA	4	3205	3216	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882917
9	NC_016955	AAG	4	3286	3296	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37882917
10	NC_016955	TCTT	3	3558	3568	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37882917
11	NC_016955	TTA	4	3579	3589	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882917
12	NC_016955	TTTA	3	3817	3828	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37882917
13	NC_016955	TAA	4	5122	5133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016955	GTTACC	4	5690	5713	24	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	4 %	Non-Coding
15	NC_016955	AAAC	3	5810	5821	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016955	TA	8	5829	5843	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016955	AT	6	5859	5869	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016955	ATA	4	6557	6568	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016955	AAAC	3	6665	6677	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016955	TTG	4	7137	7148	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016955	TAT	4	7304	7314	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016955	TAA	5	8410	8423	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37882917
23	NC_016955	TAA	4	8441	8452	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882917
24	NC_016955	ATA	5	8533	8546	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37882917
25	NC_016955	AACA	3	9185	9196	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	37882917
26	NC_016955	AT	8	9574	9589	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016955	GTA	4	9772	9782	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016955	GCAA	3	10101	10112	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016955	GCAA	3	10775	10786	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016955	TTTA	3	10803	10814	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016955	T	14	10846	10859	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016955	TATT	3	10900	10911	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016955	TGTT	3	11024	11034	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016955	TA	9	11447	11463	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016955	TTAT	3	11486	11497	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016955	AATAA	3	11745	11759	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016955	ATA	4	11818	11830	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016955	TATT	3	11921	11933	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016955	TA	9	12424	12440	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	37882917
40	NC_016955	A	12	12788	12799	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	37882917
41	NC_016955	TTTA	3	13031	13043	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37882917
42	NC_016955	AGGGAA	5	13081	13110	30	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	37882917
43	NC_016955	TTA	4	13520	13530	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016955	TA	6	13760	13770	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016955	ATTAA	3	14350	14364	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016955	TAT	4	14376	14387	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016955	TAT	4	15507	15518	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016955	TAA	5	15516	15530	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016955	TTA	4	16324	16334	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016955	ATT	4	17456	17467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016955	TA	6	17675	17686	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016955	ACCAGC	4	17840	17863	24	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016955	AT	6	17996	18006	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016955	ATT	4	18009	18020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016955	TTAT	3	19055	19066	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37882917
56	NC_016955	TTA	4	19962	19972	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882917
57	NC_016955	TAT	5	20576	20591	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016955	AAATA	3	21048	21062	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	37882917
59	NC_016955	TAA	4	21067	21078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016955	AT	7	21136	21148	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016955	AAAT	3	22977	22988	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37882917
62	NC_016955	CTA	4	23892	23903	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37882918
63	NC_016955	TCAG	3	24216	24227	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37882918
64	NC_016955	AATTA	3	24270	24284	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	37882918
65	NC_016955	ATTT	3	24976	24986	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37882918
66	NC_016955	AATT	3	24999	25010	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37882918
67	NC_016955	GTTT	5	26226	26246	21	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37882918
68	NC_016955	TTATAT	3	26400	26417	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016955	TAT	4	26427	26438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016955	ATTT	3	26544	26555	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016955	ATT	4	26773	26784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882918
72	NC_016955	TTATTT	3	26841	26858	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	37882918
73	NC_016955	ATT	5	27147	27161	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37882918
74	NC_016955	ATT	4	27243	27254	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882918
75	NC_016955	TTTA	3	28112	28122	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016955	TA	6	28276	28289	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016955	TA	6	28388	28398	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37882918
78	NC_016955	TAA	6	29035	29051	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37882918
79	NC_016955	TAT	4	29573	29584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882918
80	NC_016955	TGA	5	30076	30090	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	37882918
81	NC_016955	AAGTTA	3	30380	30398	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	37882918
82	NC_016955	AAAT	3	30612	30623	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016955	ATA	4	30922	30932	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016955	TAA	4	31471	31481	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016955	AAAT	3	31627	31638	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016955	TA	6	31717	31728	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016955	TTATC	3	32048	32061	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016955	TTA	4	32816	32826	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882918
89	NC_016955	GTTT	3	33117	33127	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37882918
90	NC_016955	TAT	4	33567	33579	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016955	TAAAAA	3	33589	33606	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_016955	TTA	4	33634	33645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016955	AT	7	33659	33671	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016955	ATTCTG	3	34014	34030	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
95	NC_016955	ATCG	3	34245	34255	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016955	ATCG	3	34270	34280	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016955	ATCG	3	34310	34320	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016955	TA	6	34467	34478	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016955	TAA	4	34640	34650	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016955	ATTA	3	34886	34897	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37882918
101	NC_016955	TAA	4	35236	35247	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882918
102	NC_016955	ATGT	3	35865	35876	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37882918
103	NC_016955	TTA	4	37449	37460	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882918
104	NC_016955	TAA	4	37834	37844	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37882918
105	NC_016955	TAT	7	39287	39307	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37882918
106	NC_016955	TGG	4	39378	39389	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37882918
107	NC_016955	TTTA	3	40110	40120	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37882918
108	NC_016955	AAAG	3	42584	42596	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	37882918
109	NC_016955	TGGT	3	42767	42778	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	37882918
110	NC_016955	TAA	5	43761	43774	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37882918
111	NC_016955	TA	7	43890	43902	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37882918
112	NC_016955	GTA	4	44072	44082	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37882918
113	NC_016955	ATAA	3	44498	44510	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	37882918
114	NC_016955	T	17	44943	44959	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	37882918
115	NC_016955	ATA	4	46601	46611	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37882918
116	NC_016955	TGAA	3	46968	46979	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37882918
117	NC_016955	TTA	4	48078	48089	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016955	AAT	4	48495	48507	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016955	T	12	48781	48792	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	37882919
120	NC_016955	AGTA	3	49335	49346	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37882919
121	NC_016955	TATATT	3	52222	52239	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37882919
122	NC_016955	TAA	4	52448	52458	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37882919
123	NC_016955	TAT	4	52891	52902	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37882919
124	NC_016955	ACACTA	4	53784	53807	24	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	4 %	37882919
125	NC_016955	TAA	4	54124	54135	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37882919
126	NC_016955	TTTA	3	55864	55874	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37882919
127	NC_016955	TAA	4	56174	56186	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37882919
128	NC_016955	TAT	26	56970	57047	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	1 %	Non-Coding
129	NC_016955	TA	6	57699	57710	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016955	TA	7	58273	58285	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016955	A	18	58371	58388	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	37882919
132	NC_016955	ATA	4	59387	59398	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016955	ACA	4	59506	59516	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016955	TA	7	59968	59980	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016955	ATA	4	60361	60372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016955	AAATTA	3	60461	60479	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
137	NC_016955	TA	6	61137	61148	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37882919
138	NC_016955	TAG	5	61374	61388	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016955	TAT	4	61486	61496	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016955	GTA	4	61609	61620	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016955	ATT	4	62355	62366	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016955	GTTT	3	63028	63039	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016955	TTTATT	3	63297	63315	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Peltigera malacea mitochondrion