ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pentactina rupicola chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016921CAG49889991233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37782985
2NC_016921TAA4515951701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_016921ATT4659466051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016921TAT5993999521433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_016921TAA410483104941266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016921TAA410631106421266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_016921TAT513647136611533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016921TTA417041170521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_016921CTT42328723298120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37782986
10NC_016921GTT42427624287120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37782986
11NC_016921ATT429918299281133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_016921TAA731405314242066.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
13NC_016921TCT43856138571110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37782987
14NC_016921ATG440105401151133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37782987
15NC_016921GCA442003420141233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37782987
16NC_016921ATA443872438841366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
17NC_016921ATA445110451241566.67 %33.33 %0 %0 %6 %37782987
18NC_016921CAA452415524251166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
19NC_016921TTA452836528471233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016921ATA455868558781166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37782988
21NC_016921TTG45824758257110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
22NC_016921ATA460586605981366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016921AAT460604606161366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_016921TTA461264612741133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_016921TTC46614566155110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
26NC_016921ATA566570665851666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_016921AGA469888698991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
28NC_016921TAT472803728131133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37782993
29NC_016921TCT47455874569120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37782993
30NC_016921TCT47897478985120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37782993
31NC_016921CTT48524585256120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37782993
32NC_016921GAT485713857231133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37782993
33NC_016921GAT487099871091133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37782993
34NC_016921CTT48862188631110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37782993
35NC_016921GAT490138901491233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37782993
36NC_016921TAT995363953882633.33 %66.67 %0 %0 %7 %37782993
37NC_016921AAG41009761009871266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37782993
38NC_016921GAA51104141104281566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37782993
39NC_016921AAG41127051127161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37782993
40NC_016921TTG4113454113465120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37782993
41NC_016921AAT41142011142111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37782993
42NC_016921AAG41150601150701166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37782993
43NC_016921TTC5121871121885150 %66.67 %0 %33.33 %6 %37782993
44NC_016921TAT41221471221571133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37782993
45NC_016921TAA41222671222791366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37782993
46NC_016921TTA41253411253511133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37782993
47NC_016921TTA41254231254341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37782993
48NC_016921TCT4128918128929120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37782993
49NC_016921TAA41296751296861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37782993
50NC_016921TTC6131151131169190 %66.67 %0 %33.33 %10 %37782993
51NC_016921CTT4140596140607120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37782993
52NC_016921ATA41461781461881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_016921ATA81461931462162466.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_016921ACC41499581499681133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37782993
55NC_016921ATC41514341514451233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37782993
56NC_016921GAA41529511529611166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37782993
57NC_016921ATC41544741544841133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
58NC_016921ATC41558601558701133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37782993
59NC_016921GAA51563261563401566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37782993