ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Corcyra cephalonica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016866	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016866	ATT	4	223	234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016866	TAT	5	696	709	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37526710
4	NC_016866	AATT	3	943	954	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37526710
5	NC_016866	TTTA	3	1056	1066	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37526710
6	NC_016866	AAAT	3	1159	1170	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37526710
7	NC_016866	ATA	4	1192	1203	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37526710
8	NC_016866	ATT	4	2021	2032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37526710
9	NC_016866	AGG	4	2114	2125	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	37526710
10	NC_016866	TTTG	3	2298	2308	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37526710
11	NC_016866	ATT	4	2886	2896	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37526710
12	NC_016866	ATT	4	3298	3308	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37526711
13	NC_016866	TTAA	3	3332	3344	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37526711
14	NC_016866	AATT	3	3718	3728	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37526711
15	NC_016866	AATA	3	3827	3839	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016866	ATT	4	3852	3862	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016866	TTTA	3	3935	3947	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37526711
18	NC_016866	TTAA	3	4094	4105	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37526711
19	NC_016866	ATT	4	4119	4131	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37526711
20	NC_016866	TAA	4	4239	4249	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37526711
21	NC_016866	TTATCT	3	4342	4359	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	37526711
22	NC_016866	ATTT	3	4840	4851	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37526711
23	NC_016866	TAT	6	4859	4875	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37526711
24	NC_016866	T	15	4990	5004	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	37526711
25	NC_016866	ATT	5	5573	5587	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37526711
26	NC_016866	TAT	4	5638	5648	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37526711
27	NC_016866	ATTC	3	6113	6123	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016866	AT	29	6262	6318	57	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016866	ATAA	3	6399	6410	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	37526711
30	NC_016866	TAAA	3	6434	6445	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	37526711
31	NC_016866	AT	6	6499	6509	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37526711
32	NC_016866	TAT	4	6741	6752	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37526711
33	NC_016866	ATA	4	6966	6976	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37526711
34	NC_016866	TAAA	3	7184	7194	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37526711
35	NC_016866	TTA	4	7259	7270	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37526711
36	NC_016866	ATA	4	7364	7375	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37526711
37	NC_016866	TGAA	3	7452	7462	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37526711
38	NC_016866	AAT	4	7548	7560	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37526711
39	NC_016866	TAA	4	7802	7814	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37526711
40	NC_016866	ATA	4	7832	7843	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37526711
41	NC_016866	AAAT	3	7844	7854	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37526711
42	NC_016866	AAAAAT	3	8074	8091	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	37526711
43	NC_016866	TAA	5	8244	8257	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37526711
44	NC_016866	AAT	4	8359	8370	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37526711
45	NC_016866	ATC	4	8483	8494	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37526711
46	NC_016866	AAAT	3	9090	9100	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37526711
47	NC_016866	ATAAAT	3	9182	9198	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37526711
48	NC_016866	TAA	5	9234	9248	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37526711
49	NC_016866	ATT	4	9499	9510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37526711
50	NC_016866	AT	9	9638	9655	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	37526711
51	NC_016866	ATT	4	9921	9932	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016866	ATT	5	9974	9987	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37526711
53	NC_016866	T	14	10222	10235	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37526711
54	NC_016866	CTTT	3	10250	10261	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37526711
55	NC_016866	T	14	10761	10774	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37526711
56	NC_016866	ATTT	3	11190	11200	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37526711
57	NC_016866	ATT	5	11488	11501	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37526711
58	NC_016866	TAAT	3	11629	11640	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	37526711
59	NC_016866	TAAAA	3	12312	12325	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	37526712
60	NC_016866	TAA	5	12378	12392	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37526712
61	NC_016866	TAAA	3	13065	13076	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016866	TTA	4	13490	13501	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016866	TAT	4	13511	13522	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016866	AAATT	4	13538	13557	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016866	AATT	3	13985	13995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016866	ATTA	4	14081	14097	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_016866	TATT	4	14688	14704	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_016866	TTAATA	3	14766	14783	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016866	ATT	4	14829	14841	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016866	T	22	14944	14965	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
71	NC_016866	TTCTT	3	15005	15019	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016866	TTAA	5	15073	15092	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_016866	ATTA	4	15106	15121	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016866	TA	13	15126	15151	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016866	TA	13	15155	15180	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016866	ATT	8	15208	15230	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Corcyra cephalonica mitochondrion