ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ashbya gossypii FDAG1 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016756	AATT	3	2	13	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016756	TATT	4	14	29	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016756	ATTT	4	35	50	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016756	ATT	4	55	66	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016756	AAAT	3	611	622	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016756	AT	7	714	726	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37426409
7	NC_016756	AAT	4	822	833	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37426409
8	NC_016756	TAT	4	831	842	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37426409
9	NC_016756	TAT	4	924	934	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37426409
10	NC_016756	TAA	7	1440	1459	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
11	NC_016756	TAAT	3	1519	1530	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016756	ATATA	3	1580	1594	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016756	TAA	4	1634	1646	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016756	ATA	4	1723	1737	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016756	AAT	4	1738	1750	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016756	ATATTA	3	1917	1933	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016756	TTA	4	2567	2577	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37426409
18	NC_016756	GGT	4	2659	2670	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37426409
19	NC_016756	TA	6	2717	2727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37426409
20	NC_016756	AT	6	2855	2865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37426409
21	NC_016756	ATT	4	2917	2928	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37426409
22	NC_016756	TTA	4	3162	3173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37426409
23	NC_016756	ATT	4	3378	3389	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37426409
24	NC_016756	TTAAA	4	3888	3906	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_016756	TAT	5	4058	4072	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37426409
26	NC_016756	TTAC	3	4417	4427	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37426409
27	NC_016756	GAA	4	4589	4600	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37426409
28	NC_016756	ACT	4	4639	4650	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37426409
29	NC_016756	TAAA	5	4812	4831	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_016756	ATTAA	3	5055	5069	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016756	TAT	4	5295	5305	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016756	AATT	3	5521	5531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016756	TAT	4	5678	5689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016756	AATA	3	5697	5709	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016756	ATAA	3	5817	5828	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016756	ATTA	4	5883	5898	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016756	TTAA	6	5910	5934	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016756	TAA	4	5984	5995	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37426409
39	NC_016756	ATA	5	6127	6140	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37426409
40	NC_016756	ATA	5	6385	6399	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37426409
41	NC_016756	ATA	4	6514	6525	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37426409
42	NC_016756	TAA	4	6605	6615	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37426409
43	NC_016756	TAA	4	6631	6643	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37426409
44	NC_016756	ATA	4	6649	6660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37426409
45	NC_016756	ATTTA	3	6664	6677	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	37426409
46	NC_016756	ATA	6	7291	7307	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37426409
47	NC_016756	TTA	4	7392	7403	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37426409
48	NC_016756	TAA	7	7458	7479	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37426409
49	NC_016756	ATTTTT	3	7597	7615	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	37426409
50	NC_016756	TAT	4	7999	8010	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37426409
51	NC_016756	TAAT	5	8072	8090	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	37426409
52	NC_016756	GGTATT	3	8448	8465	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	37426409
53	NC_016756	TTA	4	8592	8602	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37426409
54	NC_016756	TAAAT	3	8617	8631	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016756	AAT	4	8632	8642	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016756	TAAA	3	8736	8747	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016756	ATA	4	9007	9017	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016756	AAT	4	9035	9045	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016756	TTATT	3	10013	10028	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	37426409
60	NC_016756	TTC	7	10090	10111	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37426409
61	NC_016756	ATTT	3	10188	10199	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37426409
62	NC_016756	TATTT	3	10245	10259	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	37426409
63	NC_016756	TAATAT	4	10352	10374	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016756	TA	7	10518	10530	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016756	AAAATA	3	10635	10653	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
66	NC_016756	TAA	4	10656	10667	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016756	TAT	4	10729	10740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016756	TAA	4	11287	11298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016756	AAT	4	11531	11542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016756	TAA	4	11631	11642	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016756	ATTA	4	11749	11764	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016756	AATT	3	11873	11883	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016756	TAAT	5	12067	12085	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
74	NC_016756	ATT	4	12084	12098	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016756	TA	6	12213	12223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016756	ATT	4	12416	12426	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016756	AATA	3	12449	12460	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016756	TAA	4	12475	12487	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016756	TTA	4	12559	12570	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016756	TTAA	4	12572	12587	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016756	TTA	4	12592	12604	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016756	TTA	4	12715	12726	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016756	AT	6	12736	12747	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016756	AT	6	12798	12808	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016756	TTTA	4	12985	13000	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016756	TA	6	13274	13284	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016756	TAATT	4	13378	13397	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
88	NC_016756	ATA	4	13532	13544	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016756	TAA	4	13543	13554	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016756	ATT	4	13606	13618	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016756	TA	6	13856	13866	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016756	TTA	4	14239	14250	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016756	ATT	5	14589	14604	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016756	ATA	4	14611	14622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016756	ATT	4	14650	14661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016756	AATT	3	14839	14850	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016756	TAA	4	15009	15020	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016756	ATA	5	15134	15147	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016756	TAT	4	15360	15370	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016756	ATTA	3	15574	15585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016756	AT	6	15595	15605	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016756	AT	7	15608	15620	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016756	TAA	5	15644	15659	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016756	TAA	4	15663	15673	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016756	TAA	4	15960	15971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016756	TAAA	4	16096	16111	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016756	TA	6	16617	16629	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016756	TAA	4	16638	16649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016756	AT	7	16803	16817	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016756	TTAA	3	16874	16884	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016756	AATATT	3	17075	17092	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_016756	TTAA	3	17135	17145	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016756	TAA	4	17171	17181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016756	TA	7	17267	17281	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016756	TTA	4	17284	17295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016756	TA	9	17318	17334	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
117	NC_016756	TAA	6	17380	17398	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
118	NC_016756	TA	6	17414	17424	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016756	ATA	4	17535	17547	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016756	TTA	4	17641	17651	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016756	AGTA	3	17777	17788	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016756	TAAT	3	17803	17813	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016756	TA	6	17820	17832	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016756	TAA	5	17831	17845	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016756	TAA	5	17848	17864	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_016756	ATA	4	17865	17876	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016756	ATAA	3	17980	17991	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016756	ATA	4	18029	18040	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016756	TA	6	18043	18053	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016756	TAA	5	18137	18151	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_016756	TAA	4	18192	18204	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016756	TAGTAT	5	18215	18246	32	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016756	TATT	3	18305	18316	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016756	ATA	4	18412	18422	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016756	TA	6	18442	18452	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016756	TAA	4	18456	18468	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016756	TATAGA	3	18541	18559	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
138	NC_016756	TAA	5	18621	18635	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016756	TTAA	3	18899	18909	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016756	TAA	7	18910	18929	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
141	NC_016756	TA	10	18932	18950	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
142	NC_016756	ATA	5	19008	19021	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016756	AAT	4	19028	19040	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016756	AATA	3	19047	19058	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016756	AT	10	19070	19090	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016756	TAAATA	3	19147	19165	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
147	NC_016756	TATAA	4	19501	19524	24	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_016756	ATA	5	19578	19592	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
149	NC_016756	AT	11	19689	19713	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016756	TAA	4	19776	19788	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016756	TAA	4	19863	19874	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016756	AAATAT	3	19923	19941	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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154	NC_016756	TATAGT	4	20141	20166	26	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
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165	NC_016756	TAA	4	21216	21227	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_016756	ATTT	5	21376	21395	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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168	NC_016756	AATT	3	21706	21717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016756	TAT	4	21735	21747	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
170	NC_016756	AAGAA	3	21830	21843	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
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172	NC_016756	TTAT	3	22048	22059	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
173	NC_016756	AAGAT	3	22379	22393	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
174	NC_016756	ATT	4	22901	22912	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
175	NC_016756	ATT	4	23102	23114	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ashbya gossypii FDAG1 mitochondrion