ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Colocasia esculenta chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016753TATAT32702831440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
2NC_016753TATTT43543742120 %80 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016753TTTCT334793492140 %80 %0 %20 %7 %37781935
4NC_016753TCTCT355355548140 %60 %0 %40 %7 %37781936
5NC_016753AAATA4578157991980 %20 %0 %0 %10 %37781936
6NC_016753TTTTA3736773821620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
7NC_016753AGATA4807080902160 %20 %20 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016753GAAAA330097301111580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
9NC_016753CATTA334091341041440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
10NC_016753AATTT335399354131540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
11NC_016753CCAAT340244402571440 %20 %0 %40 %7 %37781937
12NC_016753CTTAG348551485661620 %40 %20 %20 %6 %Non-Coding
13NC_016753TTGAT350257502721620 %60 %20 %0 %6 %Non-Coding
14NC_016753ATTAT464126641441940 %60 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_016753CTTTT36669966713150 %80 %0 %20 %6 %37781939
16NC_016753TTTGT36823768250140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
17NC_016753ATATT373030730431440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_016753TTCTA382052820651420 %60 %0 %20 %7 %37781940
19NC_016753TTTTC48542485442190 %80 %0 %20 %10 %37781940
20NC_016753TCCGG3100438100452150 %20 %40 %40 %6 %37781940
21NC_016753TTCTT3105437105451150 %80 %0 %20 %6 %37781940
22NC_016753ATTAA31238371238521660 %40 %0 %0 %6 %37781940
23NC_016753TTGTA41304321304501920 %60 %20 %0 %10 %37781940
24NC_016753AGAAA31466401466541580 %0 %20 %0 %6 %37781940
25NC_016753ACCGG31516421516561520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding