ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Colocasia esculenta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016753	TAT	4	292	302	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016753	CAG	5	1285	1299	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	37781935
3	NC_016753	CTT	4	2423	2434	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37781935
4	NC_016753	TAA	4	9432	9443	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016753	ACA	4	9667	9677	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016753	TAA	4	12045	12055	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016753	TTA	4	17615	17626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016753	ATT	4	23205	23216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781936
9	NC_016753	GTT	4	25646	25657	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37781936
10	NC_016753	ATT	4	32247	32259	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016753	AGT	4	33088	33099	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016753	ATA	5	34134	34149	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016753	GAA	4	35641	35651	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016753	TAT	5	40037	40050	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016753	AGT	4	48999	49010	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37781938
16	NC_016753	TAT	5	49270	49286	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016753	TAT	5	50045	50060	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016753	TAT	4	50191	50201	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016753	ATA	4	52324	52335	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016753	ATA	5	61554	61569	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016753	GAA	4	63507	63518	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016753	ATA	4	70694	70706	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016753	TCT	4	72697	72708	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016753	TGA	4	75088	75099	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37781940
25	NC_016753	TAT	5	76011	76026	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37781940
26	NC_016753	TTA	4	76628	76639	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781940
27	NC_016753	ATA	4	84288	84298	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37781940
28	NC_016753	ATT	4	87279	87289	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37781940
29	NC_016753	TTA	4	89323	89333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37781940
30	NC_016753	CTT	4	89767	89778	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37781940
31	NC_016753	GAT	4	91594	91604	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37781940
32	NC_016753	GTG	4	92352	92363	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37781940
33	NC_016753	GAT	4	94654	94665	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37781940
34	NC_016753	TGA	4	96393	96404	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37781940
35	NC_016753	TAC	4	104331	104342	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37781940
36	NC_016753	TAA	5	114912	114925	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37781940
37	NC_016753	ATT	4	115345	115356	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781940
38	NC_016753	ATT	4	115672	115683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781940
39	NC_016753	TAT	5	115778	115792	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37781940
40	NC_016753	ATT	4	116684	116696	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37781940
41	NC_016753	AAG	4	117335	117346	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37781940
42	NC_016753	TTG	4	118084	118095	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37781940
43	NC_016753	TAT	4	119646	119657	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781940
44	NC_016753	TAT	4	120080	120090	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37781940
45	NC_016753	CTT	5	120874	120888	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	37781940
46	NC_016753	TAT	5	123946	123960	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37781940
47	NC_016753	ATT	4	124048	124060	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37781940
48	NC_016753	ATT	4	125700	125713	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37781940
49	NC_016753	AAT	4	127301	127311	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37781940
50	NC_016753	TAT	4	131039	131051	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37781940
51	NC_016753	TAT	4	131141	131153	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37781940
52	NC_016753	ATT	4	133375	133386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781940
53	NC_016753	TAT	4	137173	137184	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37781940
54	NC_016753	GTA	4	147753	147764	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37781940
55	NC_016753	ATC	4	157430	157441	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37781944

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Colocasia esculenta chloroplast