ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Colocasia esculenta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016753	TA	15	209	239	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016753	TA	6	241	254	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016753	TA	7	1919	1932	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016753	TA	6	2077	2087	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016753	AT	7	4661	4673	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016753	AT	6	10362	10372	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016753	TA	6	16090	16100	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016753	AT	6	17339	17349	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37781936
9	NC_016753	AT	13	29808	29832	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016753	TA	6	30306	30316	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016753	TA	25	33708	33754	47	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016753	GA	7	38355	38367	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016753	TC	6	38961	38971	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37781937
14	NC_016753	AT	11	39208	39227	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_016753	TA	7	49481	49494	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016753	AT	6	50097	50107	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016753	AT	6	64146	64156	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016753	TA	7	70701	70714	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016753	AT	13	70720	70745	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016753	TA	6	77625	77635	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37781940
21	NC_016753	TA	8	100064	100079	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
22	NC_016753	TA	6	100126	100139	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
23	NC_016753	TA	6	100141	100154	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
24	NC_016753	AT	7	100155	100170	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
25	NC_016753	AT	7	115085	115097	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
26	NC_016753	AT	8	115102	115116	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
27	NC_016753	AT	8	115233	115247	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
28	NC_016753	TA	8	115863	115877	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
29	NC_016753	TA	8	115880	115894	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
30	NC_016753	TA	6	115898	115910	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
31	NC_016753	TA	6	116218	116228	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37781940
32	NC_016753	TA	8	123811	123825	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
33	NC_016753	TA	8	124003	124017	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
34	NC_016753	TA	6	124909	124921	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
35	NC_016753	TA	6	124925	124937	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
36	NC_016753	AT	6	125751	125763	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
37	NC_016753	AT	6	125765	125777	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
38	NC_016753	AT	7	125779	125791	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
39	NC_016753	TA	8	130593	130607	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
40	NC_016753	TA	8	130655	130669	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37781940
41	NC_016753	AT	10	130895	130915	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37781940
42	NC_016753	AT	7	130917	130929	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37781940
43	NC_016753	AT	6	131005	131015	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37781940
44	NC_016753	GA	6	138086	138096	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37781940
45	NC_016753	TA	6	151928	151941	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016753	TA	6	151941	151954	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016753	TA	6	151958	151971	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016753	TA	6	152022	152032	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016753	AT	8	152069	152084	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Colocasia esculenta chloroplast