ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016743TCTTTC395359553190 %66.67 %0 %33.33 %10 %37245028
2NC_016743AGTTGA315114151311833.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %37245028
3NC_016743ATAGTG330621306371733.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %37245028
4NC_016743TGTAAG351973519901833.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %37245028
5NC_016743ATAAGA367531675481866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %37245028
6NC_016743GACCAG388442884591833.33 %0 %33.33 %33.33 %5 %37245028
7NC_016743TTTGAT31219171219341816.67 %66.67 %16.67 %0 %0 %37245028
8NC_016743GGGAGA31523831524011933.33 %0 %66.67 %0 %10 %37245028
9NC_016743ATCATA31676411676571750 %33.33 %0 %16.67 %5 %37245028
10NC_016743GATCGG31829201829371816.67 %16.67 %50 %16.67 %5 %37245028
11NC_016743GTAAGA32045062045221750 %16.67 %33.33 %0 %5 %37245028
12NC_016743AAAGAA32493512493691983.33 %0 %16.67 %0 %10 %37245028
13NC_016743AAAAAG32512572512731783.33 %0 %16.67 %0 %5 %37245028
14NC_016743GACCAG32876362876531833.33 %0 %33.33 %33.33 %5 %37245028
15NC_016743ATTTTA33115863116041933.33 %66.67 %0 %0 %5 %37245028
16NC_016743CTTAAG33119693119851733.33 %33.33 %16.67 %16.67 %5 %37245028
17NC_016743TTTATA33133843134021933.33 %66.67 %0 %0 %10 %37245028
18NC_016743GTAGGA33753583753751833.33 %16.67 %50 %0 %5 %Non-Coding