ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016743	TA	6	2333	2343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016743	AT	6	30727	30737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
3	NC_016743	TG	6	33411	33422	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	37245028
4	NC_016743	AT	7	36517	36531	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37245028
5	NC_016743	AG	6	46648	46659	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
6	NC_016743	TC	6	46975	46985	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
7	NC_016743	GA	7	49905	49917	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	37245028
8	NC_016743	TC	6	68837	68847	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
9	NC_016743	AT	7	75568	75581	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
10	NC_016743	TA	7	78005	78017	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
11	NC_016743	AG	6	89986	89997	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
12	NC_016743	TA	7	98663	98675	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
13	NC_016743	TA	6	100391	100401	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
14	NC_016743	CT	8	104880	104895	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	37245028
15	NC_016743	CT	7	117902	117914	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37245028
16	NC_016743	TA	6	135571	135581	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
17	NC_016743	AG	6	136467	136478	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
18	NC_016743	TC	6	142111	142121	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
19	NC_016743	TC	6	153690	153700	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
20	NC_016743	GA	6	160850	160861	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
21	NC_016743	TG	6	170244	170254	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	37245028
22	NC_016743	AG	6	176914	176925	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
23	NC_016743	GA	6	177541	177551	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
24	NC_016743	GA	6	184009	184020	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
25	NC_016743	AT	6	184193	184203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
26	NC_016743	CT	7	191535	191547	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37245028
27	NC_016743	AT	6	196171	196182	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37245028
28	NC_016743	TA	6	197915	197925	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
29	NC_016743	TC	6	198460	198470	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
30	NC_016743	GA	6	205453	205463	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
31	NC_016743	AG	6	210783	210793	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
32	NC_016743	AG	6	215733	215744	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
33	NC_016743	AT	7	217994	218006	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
34	NC_016743	TG	6	218974	218985	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	37245028
35	NC_016743	CT	6	219291	219301	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
36	NC_016743	CT	6	220215	220226	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245028
37	NC_016743	TC	6	227053	227063	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
38	NC_016743	TA	6	228398	228408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
39	NC_016743	GA	6	237539	237550	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
40	NC_016743	AT	6	238600	238610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
41	NC_016743	AG	7	253310	253322	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	37245028
42	NC_016743	TA	6	272531	272544	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
43	NC_016743	AT	7	274762	274775	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
44	NC_016743	TA	7	277199	277211	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
45	NC_016743	AG	6	289180	289191	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
46	NC_016743	TA	6	293529	293539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
47	NC_016743	TC	6	294305	294315	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
48	NC_016743	GA	6	298763	298773	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
49	NC_016743	CT	6	303912	303923	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245028
50	NC_016743	TA	7	306099	306112	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
51	NC_016743	GA	6	316277	316288	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
52	NC_016743	TA	7	331210	331222	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
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54	NC_016743	AT	7	351217	351229	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
55	NC_016743	GA	6	354635	354645	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
56	NC_016743	GA	6	376562	376572	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

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Di-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus mitochondrion