Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016743GAA4592359331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
2NC_016743ACT4622662361133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37245028
3NC_016743AAC410135101461266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37245028
4NC_016743ATT510703107161433.33 %66.67 %0 %0 %7 %37245028
5NC_016743AAG410982109931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
6NC_016743TTG41658416595120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37245028
7NC_016743TCT41892518937130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
8NC_016743GAA519027190411566.67 %0 %33.33 %0 %0 %37245028
9NC_016743AAG420166201761166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
10NC_016743TTC42233722348120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
11NC_016743TCA636024360421933.33 %33.33 %0 %33.33 %10 %37245028
12NC_016743ATA539073390861466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37245028
13NC_016743ATC442318423281133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37245028
14NC_016743TTC44242242433120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
15NC_016743GGC45250852518110 %0 %66.67 %33.33 %9 %37245028
16NC_016743TTC45461354625130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
17NC_016743GTC45472754738120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
18NC_016743AAT454886548981366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37245028
19NC_016743GCG45616656177120 %0 %66.67 %33.33 %8 %37245028
20NC_016743TTC45709957110120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
21NC_016743TTA457418574281133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37245028
22NC_016743AAG457441574511166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
23NC_016743CGG46058960600120 %0 %66.67 %33.33 %8 %37245028
24NC_016743AGA465314653251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
25NC_016743TAT467868678801333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37245028
26NC_016743CTT46865668668130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
27NC_016743AGA474874748851266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
28NC_016743TTG48226082271120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37245028
29NC_016743CAG485541855521233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
30NC_016743CTG48614786158120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
31NC_016743CTT48863788649130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
32NC_016743GTA589152891661533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %37245028
33NC_016743AGA489479894901266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
34NC_016743AGT492169921801233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
35NC_016743CAG493323933341233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
36NC_016743GAT493677936871133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37245028
37NC_016743CAT498457984671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37245028
38NC_016743CAC41080341080441133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37245028
39NC_016743TCT4111612111623120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
40NC_016743GTT4116086116097120 %66.67 %33.33 %0 %0 %37245028
41NC_016743CTG4116681116692120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
42NC_016743TAA41227211227311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37245028
43NC_016743AAG41256371256491366.67 %0 %33.33 %0 %7 %37245028
44NC_016743CAT41313141313241133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37245028
45NC_016743AAC61348021348181766.67 %0 %0 %33.33 %5 %37245028
46NC_016743AAG41351381351491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
47NC_016743TGC4135242135253120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
48NC_016743GGT4136025136037130 %33.33 %66.67 %0 %7 %37245028
49NC_016743CTA41365311365421233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37245028
50NC_016743TCC4136807136817110 %33.33 %0 %66.67 %9 %37245028
51NC_016743TAG41454221454321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37245028
52NC_016743CTT4147794147805120 %66.67 %0 %33.33 %0 %37245028
53NC_016743GTT4148302148313120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37245028
54NC_016743TCT4150035150046120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
55NC_016743AAG41512621512721166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
56NC_016743CTG4157592157603120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
57NC_016743CTA41589401589511233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37245028
58NC_016743ATA41602251602351166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37245028
59NC_016743AAG41622831622931166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
60NC_016743ATT41638681638791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37245028
61NC_016743AAT41661191661311366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37245028
62NC_016743CTT4167892167904130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
63NC_016743GCA41702151702261233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
64NC_016743GAC41759961760071233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
65NC_016743GGT4176051176061110 %33.33 %66.67 %0 %9 %37245028
66NC_016743TCT4180466180477120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
67NC_016743TTC4180980180990110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
68NC_016743TCT4181757181768120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
69NC_016743TCG4181860181871120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
70NC_016743TAA41836331836441266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37245028
71NC_016743CTT4192693192703110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
72NC_016743CCA41934951935061233.33 %0 %0 %66.67 %8 %37245028
73NC_016743CTT4195947195957110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
74NC_016743TGC4199602199613120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
75NC_016743GAA42030822030931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
76NC_016743CTT4216806216817120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
77NC_016743ACT42201012201121233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37245028
78NC_016743GAT42209782209881133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37245028
79NC_016743GAT42218862218961133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37245028
80NC_016743GCC4222101222112120 %0 %33.33 %66.67 %8 %37245028
81NC_016743ATA42236042236141166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37245028
82NC_016743TAG42241622241721133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37245028
83NC_016743CAG42264722264831233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
84NC_016743GTC4226625226636120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
85NC_016743TAC42286032286141233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %37245028
86NC_016743TTA42320682320801333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37245028
87NC_016743CTA42365762365861133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37245028
88NC_016743TTC5236930236944150 %66.67 %0 %33.33 %6 %37245028
89NC_016743CGT4238944238956130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %37245028
90NC_016743AGA42401902402001166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
91NC_016743GAG42410722410821133.33 %0 %66.67 %0 %9 %37245028
92NC_016743AGT42417602417711233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
93NC_016743GTA42421132421241233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
94NC_016743CTA42441332441441233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37245028
95NC_016743GAA42461852461961266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
96NC_016743CTT4252715252725110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
97NC_016743GCA42545312545421233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
98NC_016743CTC4255017255027110 %33.33 %0 %66.67 %9 %37245028
99NC_016743TTC4256732256743120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
100NC_016743CTT4257411257421110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
101NC_016743TCT4258380258391120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
102NC_016743AGC42590712590821233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
103NC_016743TTC4260847260859130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
104NC_016743CCA42630052630161233.33 %0 %0 %66.67 %8 %37245028
105NC_016743TAT42649822649931233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37245028
106NC_016743CTT4265190265201120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
107NC_016743CCT4265289265300120 %33.33 %0 %66.67 %8 %37245028
108NC_016743CTT4269023269033110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
109NC_016743GTA42724562724671233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
110NC_016743TTA52725032725161433.33 %66.67 %0 %0 %7 %37245028
111NC_016743TCT4273032273042110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37245028
112NC_016743AGA42740682740791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
113NC_016743TTG4281454281465120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37245028
114NC_016743CAG42847352847461233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
115NC_016743CTG4285341285352120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37245028
116NC_016743CTT4287831287843130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
117NC_016743GTA52883462883601533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %37245028
118NC_016743AGA42886732886841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
119NC_016743AGT42913632913741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
120NC_016743CAG42925172925281233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
121NC_016743CTC4294160294171120 %33.33 %0 %66.67 %8 %37245028
122NC_016743GAT43074693074801233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
123NC_016743GCA43122943123051233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37245028
124NC_016743CTT4312810312821120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
125NC_016743TCT4315395315407130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
126NC_016743CTT4317675317686120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37245028
127NC_016743ATA43196533196631166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37245028
128NC_016743AGT73222323222542333.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37245028
129NC_016743GAA43279743279851266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
130NC_016743AGG43299163299271233.33 %0 %66.67 %0 %8 %37245028
131NC_016743AAC43337973338081266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37245028
132NC_016743GAA43345553345671366.67 %0 %33.33 %0 %7 %37245028
133NC_016743TCT4335200335212130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
134NC_016743TAT43380703380801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37245028
135NC_016743GAT43394123394221133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37245028
136NC_016743AAG43411233411331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
137NC_016743GAA43452523452631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
138NC_016743GAA43454003454101166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37245028
139NC_016743AGT43474603474721333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %37245028
140NC_016743TAA43483213483321266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37245028
141NC_016743TTC4350161350173130 %66.67 %0 %33.33 %7 %37245028
142NC_016743AAG43505143505251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37245028
143NC_016743CAA43577273577381266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37245028
144NC_016743TTG4358198358208110 %66.67 %33.33 %0 %9 %37245028
145NC_016743TTG4360300360310110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
146NC_016743ATT43618153618251133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
147NC_016743AAG43620333620431166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
148NC_016743GAA43677053677161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
149NC_016743TCC4369253369263110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
150NC_016743TGT4369374369384110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
151NC_016743CTT4378790378800110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
152NC_016743ACT43792413792511133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
153NC_016743TAA43801353801461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37245032