ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Millettia pinnata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016742	GGTG	3	2922	2933	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016742	TCAT	3	5269	5279	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245025
3	NC_016742	CTAG	4	6120	6136	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	37245025
4	NC_016742	CTTC	3	6174	6185	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245025
5	NC_016742	CATA	3	8893	8904	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37245025
6	NC_016742	TTTC	3	9143	9154	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
7	NC_016742	GACC	3	12080	12091	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	37245025
8	NC_016742	TTGC	3	12326	12337	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37245025
9	NC_016742	GGTA	3	14452	14462	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	37245025
10	NC_016742	AAAT	3	21562	21573	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37245025
11	NC_016742	ACAG	4	24589	24603	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	37245025
12	NC_016742	AGTC	3	25542	25553	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245025
13	NC_016742	TTCT	3	29059	29070	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
14	NC_016742	CGAG	3	32081	32092	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	37245025
15	NC_016742	CTTT	3	35323	35333	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245025
16	NC_016742	TAAG	3	36445	36457	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	37245025
17	NC_016742	AGGT	3	38116	38126	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	37245025
18	NC_016742	AAAG	3	38438	38449	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	37245025
19	NC_016742	AGGG	3	39444	39455	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	37245025
20	NC_016742	TCTT	3	43254	43265	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
21	NC_016742	GTTT	3	44007	44017	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37245025
22	NC_016742	TGAC	3	44477	44488	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245025
23	NC_016742	TGAA	3	45096	45107	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37245025
24	NC_016742	ATTT	3	45708	45718	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37245025
25	NC_016742	CATT	3	46964	46974	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245025
26	NC_016742	TTTG	3	48848	48859	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	37245025
27	NC_016742	CTTT	3	52843	52853	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245025
28	NC_016742	ACTC	3	52944	52955	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	37245025
29	NC_016742	ACTC	3	54523	54533	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	37245025
30	NC_016742	ATGA	3	58628	58639	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245025
31	NC_016742	AAGA	3	60027	60038	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245025
32	NC_016742	CTTG	3	60223	60233	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	37245025
33	NC_016742	AGCA	3	63792	63803	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	37245025
34	NC_016742	CCGG	3	64541	64551	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	37245025
35	NC_016742	TCGG	4	65103	65118	16	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	37245025
36	NC_016742	CAAG	3	65820	65831	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	37245025
37	NC_016742	AATC	3	66359	66369	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37245025
38	NC_016742	GAAC	3	66638	66648	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37245025
39	NC_016742	TACG	3	68168	68178	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37245025
40	NC_016742	TAGT	3	69806	69817	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37245025
41	NC_016742	AGGC	3	69830	69841	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	37245025
42	NC_016742	GAAA	3	73633	73643	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37245025
43	NC_016742	CCAT	3	75698	75709	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	37245025
44	NC_016742	ACTT	3	76275	76286	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37245025
45	NC_016742	GGGT	3	82028	82038	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	37245025
46	NC_016742	GAAA	3	83576	83587	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245025
47	NC_016742	GCCG	3	85559	85571	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	37245025
48	NC_016742	TGAG	3	89373	89384	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	37245025
49	NC_016742	GATT	3	90689	90699	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	37245025
50	NC_016742	AAAG	3	91795	91806	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245025
51	NC_016742	AAAG	3	92368	92379	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	37245025
52	NC_016742	TTCC	3	92643	92654	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245025
53	NC_016742	GTAA	3	95251	95262	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245025
54	NC_016742	AAAG	3	95922	95933	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245025
55	NC_016742	TATC	4	102565	102580	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	37245025
56	NC_016742	AAGG	3	102706	102716	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245025
57	NC_016742	TTTA	3	105300	105311	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37245025
58	NC_016742	ATCT	3	105488	105499	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37245025
59	NC_016742	TAGA	3	108308	108320	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	37245025
60	NC_016742	ATTA	4	108639	108654	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	37245025
61	NC_016742	GAAC	3	109201	109212	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	37245025
62	NC_016742	ATCA	3	113980	113991	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37245025
63	NC_016742	GCCG	3	119893	119904	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	37245025
64	NC_016742	TTGA	3	124469	124480	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	37245025
65	NC_016742	GAAA	3	124544	124555	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245025
66	NC_016742	TTCA	3	129165	129176	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	37245025
67	NC_016742	ACTG	3	129259	129270	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245025
68	NC_016742	TTTG	3	130804	130814	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37245025
69	NC_016742	AACC	3	136593	136604	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	37245025
70	NC_016742	TTCG	3	137578	137589	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37245025
71	NC_016742	TTCC	3	140773	140784	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245025
72	NC_016742	TTCT	3	140868	140878	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245025
73	NC_016742	TTAG	3	142941	142951	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	37245025
74	NC_016742	CTTT	3	143813	143823	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245025
75	NC_016742	AAGG	3	144990	145002	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	37245025
76	NC_016742	GCTC	3	145752	145764	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	37245025
77	NC_016742	TTTC	3	150425	150436	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
78	NC_016742	TTCT	3	153542	153553	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
79	NC_016742	GCAA	3	153795	153806	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	37245025
80	NC_016742	GAAG	3	154047	154058	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245025
81	NC_016742	ATTA	5	156171	156190	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	37245025
82	NC_016742	CTTC	3	158303	158315	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37245025
83	NC_016742	TTCC	3	158724	158736	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37245025
84	NC_016742	CAGC	3	158855	158866	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	37245025
85	NC_016742	GCAA	3	161169	161179	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37245025
86	NC_016742	GTAA	3	161769	161779	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37245025
87	NC_016742	AATC	3	166900	166911	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	37245025
88	NC_016742	TTCT	3	168672	168682	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245025
89	NC_016742	GGGC	3	173074	173086	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	37245025
90	NC_016742	GCTT	3	173420	173430	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	37245025
91	NC_016742	GATA	4	173570	173585	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	37245025
92	NC_016742	AATC	3	176266	176277	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37245025
93	NC_016742	GAAT	3	179397	179408	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37245025
94	NC_016742	TTCT	3	180849	180860	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
95	NC_016742	TGAA	3	182607	182617	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37245025
96	NC_016742	ATCG	3	183449	183460	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	37245025
97	NC_016742	TAGT	3	190467	190479	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	37245025
98	NC_016742	CTTA	3	192562	192572	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245025
99	NC_016742	TGGT	3	192777	192788	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	37245025
100	NC_016742	CTGG	3	194453	194463	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	37245025
101	NC_016742	CTTC	3	202073	202085	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37245025
102	NC_016742	CCTT	3	204983	204993	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245025
103	NC_016742	GAAA	3	211339	211349	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37245025
104	NC_016742	ATGC	3	211720	211732	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	37245025
105	NC_016742	ATTG	3	211780	211791	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37245025
106	NC_016742	CTTG	3	212345	212356	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37245025
107	NC_016742	AGTA	3	213799	213810	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245025
108	NC_016742	TCCA	3	215190	215200	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	37245025
109	NC_016742	TGTT	6	216364	216387	24	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	37245025
110	NC_016742	TGCT	3	218583	218595	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	37245025
111	NC_016742	TTTA	3	222003	222013	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37245025
112	NC_016742	TGTT	3	222620	222631	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	37245025
113	NC_016742	CTTG	3	228129	228140	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37245025
114	NC_016742	CTCC	3	228530	228541	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	37245025
115	NC_016742	TGAA	3	234682	234693	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245025
116	NC_016742	GATC	3	235383	235394	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245025
117	NC_016742	GTCA	3	236953	236964	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	37245025
118	NC_016742	GTGG	3	237021	237033	13	0 %	25 %	75 %	0 %	7 %	37245025
119	NC_016742	ATTT	3	238294	238305	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37245025
120	NC_016742	TTAA	3	240116	240127	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	37245025
121	NC_016742	CTTG	3	244097	244108	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37245025
122	NC_016742	ATCT	3	244557	244568	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37245025
123	NC_016742	ACTG	3	245971	245982	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245025
124	NC_016742	AGTT	3	246912	246923	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37245025
125	NC_016742	TCAA	3	250314	250325	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	37245025
126	NC_016742	CGAA	3	256482	256492	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37245025
127	NC_016742	CTAA	3	260417	260428	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	37245025
128	NC_016742	TCTT	3	265554	265565	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245025
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Millettia pinnata mitochondrion