ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Phoenix dactylifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016740	GCCAAA	3	4210	4227	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016740	CACCTA	3	20805	20822	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016740	GGGAGA	3	52571	52589	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_016740	TTTCTT	3	98948	98964	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016740	ATTCTA	4	110364	110386	23	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016740	CAGGAA	3	129828	129844	17	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
7	NC_016740	GACTGA	3	139955	139972	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	37245021
8	NC_016740	TTCTGG	3	168317	168334	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	5 %	37245021
9	NC_016740	GAAAGA	3	173444	173462	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	37245021
10	NC_016740	AAAAGA	3	199154	199172	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	37245021
11	NC_016740	GGATCG	3	209662	209679	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	37245021
12	NC_016740	AAGGCG	3	214173	214191	19	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	10 %	37245021
13	NC_016740	TGCTAC	3	229798	229815	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	37245021
14	NC_016740	TGGAGC	3	278702	278719	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	37245021
15	NC_016740	TTTATT	4	294274	294297	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	37245021
16	NC_016740	ACTAGA	3	300039	300055	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	37245021
17	NC_016740	GCCTTA	3	337450	337466	17	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	37245021
18	NC_016740	AGGATC	3	373435	373452	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	37245021
19	NC_016740	TTTATT	4	403544	403567	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	37245021
20	NC_016740	TCCCCT	4	470357	470386	30	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	37245021
21	NC_016740	ATCAAA	3	478961	478978	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	37245021
22	NC_016740	AGAAAG	3	492051	492068	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	37245021
23	NC_016740	AGAAAG	3	512416	512433	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	37245021
24	NC_016740	AGACAG	3	543359	543377	19	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10 %	37245021
25	NC_016740	CCCTAA	3	545651	545669	19	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	37245021
26	NC_016740	AGGGAA	3	575711	575728	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	37245021
27	NC_016740	ACAACT	3	602050	602066	17	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	37245021
28	NC_016740	ATACTA	3	632445	632462	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016740	TGGATA	3	639467	639484	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_016740	AATTCC	3	641440	641458	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
31	NC_016740	CTACTG	3	647185	647202	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
32	NC_016740	GCTCTA	3	652500	652518	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
33	NC_016740	GACAGG	3	653819	653836	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016740	TTTCTT	3	654404	654422	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
35	NC_016740	ATCCGA	3	671910	671927	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016740	ACAATG	3	683300	683317	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
37	NC_016740	TTTTCC	3	683727	683745	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
38	NC_016740	AAAGAA	3	697962	697980	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
39	NC_016740	CAACTG	3	702271	702288	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016740	AGCAAA	3	711270	711288	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Phoenix dactylifera mitochondrion