ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016736	CAG	4	1234	1245	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245011
2	NC_016736	CTT	4	5647	5658	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016736	TAT	5	10401	10415	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016736	TAT	4	10430	10441	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016736	TAT	6	10451	10467	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_016736	TTA	4	10769	10779	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016736	TTC	4	15662	15672	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016736	GTT	4	25157	25168	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37245013
9	NC_016736	TTA	4	30612	30624	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016736	AAT	4	34086	34097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016736	TAT	4	34325	34336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016736	TTA	5	34381	34394	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016736	TAT	4	34395	34406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016736	TAT	4	34864	34874	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016736	TAT	4	34892	34902	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016736	TTA	4	35592	35602	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016736	GGA	4	38574	38585	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	37245013
18	NC_016736	ATA	4	40703	40714	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016736	GCA	4	44959	44970	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245013
20	NC_016736	ATT	4	50746	50758	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016736	TAT	4	51753	51764	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016736	ATA	8	58149	58171	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245014
23	NC_016736	TAT	4	58584	58595	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016736	AGA	4	60834	60844	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016736	TTA	4	63392	63402	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016736	TAA	4	63582	63593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016736	ATA	10	63598	63628	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016736	AAT	4	63720	63730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016736	ATA	4	63731	63742	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016736	ATA	4	63992	64002	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016736	TAT	5	68321	68335	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016736	TCT	5	68687	68701	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016736	TAA	4	71841	71851	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016736	ATT	4	72049	72061	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016736	TTA	4	72594	72605	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016736	TAT	6	75177	75194	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37245016
37	NC_016736	CTG	4	75355	75366	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245016
38	NC_016736	ATT	5	77006	77019	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37245016
39	NC_016736	TAA	4	77541	77552	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	37245016
40	NC_016736	ATC	4	81089	81100	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37245016
41	NC_016736	TCT	4	83807	83818	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245016
42	NC_016736	ATA	4	84509	84520	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
43	NC_016736	TTA	4	87582	87593	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37245016
44	NC_016736	TAA	4	88443	88454	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
45	NC_016736	ATA	4	90011	90022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
46	NC_016736	ATA	4	90033	90044	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
47	NC_016736	CTT	4	90550	90561	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245016
48	NC_016736	GAT	4	91018	91028	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37245016
49	NC_016736	GAT	4	92402	92412	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37245016
50	NC_016736	GAT	4	95456	95467	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37245016
51	NC_016736	TAT	9	105438	105463	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37245016
52	NC_016736	GAA	5	115972	115986	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37245016
53	NC_016736	TAA	4	117984	117995	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
54	NC_016736	ATT	4	121326	121336	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37245016
55	NC_016736	ATT	4	121653	121664	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37245016
56	NC_016736	TAT	4	121861	121872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37245016
57	NC_016736	TTG	4	122414	122425	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37245016
58	NC_016736	AAT	4	126084	126095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
59	NC_016736	TTC	5	127791	127805	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	37245016
60	NC_016736	TCT	4	128895	128905	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37245016
61	NC_016736	TAA	4	131276	131287	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245016
62	NC_016736	ATA	5	131308	131323	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37245016
63	NC_016736	ATT	4	133833	133844	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37245016
64	NC_016736	TGT	4	135675	135686	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37245016
65	NC_016736	GAA	4	136123	136134	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245016
66	NC_016736	TTC	6	136823	136841	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	37245016
67	NC_016736	TCA	4	137512	137522	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37245016
68	NC_016736	ATA	9	147347	147372	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37245016
69	NC_016736	CTT	4	153991	154002	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245020
70	NC_016736	ACC	4	155870	155880	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	37245020
71	NC_016736	ATC	4	157346	157357	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37245020
72	NC_016736	ATC	4	160401	160411	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016736	ATC	4	161785	161795	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37245020
74	NC_016736	GAA	5	162251	162265	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37245020

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis chloroplast