ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016736	TA	6	366	376	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016736	AT	6	511	521	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016736	TA	6	5221	5232	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016736	TA	6	6362	6372	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016736	AT	6	6417	6429	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016736	TA	11	6432	6453	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016736	TA	6	10674	10684	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016736	AT	6	15580	15590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016736	AT	6	16721	16731	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016736	CT	6	17758	17769	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016736	AT	6	21430	21440	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245012
12	NC_016736	AT	6	28177	28187	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245013
13	NC_016736	TA	7	29070	29082	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016736	TA	6	33458	33469	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016736	TC	6	33647	33658	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016736	TA	8	34286	34300	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016736	TA	7	34368	34383	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016736	TA	6	34552	34562	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016736	TA	6	34584	34594	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016736	TA	7	34670	34682	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016736	TA	8	34693	34707	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016736	TA	6	36037	36047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016736	AG	6	39524	39534	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016736	TC	6	40163	40173	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245013
25	NC_016736	AT	10	40533	40552	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_016736	AT	8	40587	40601	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016736	TG	6	44996	45006	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	37245013
28	NC_016736	TA	6	50864	50874	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016736	AT	6	54633	54643	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245014
30	NC_016736	AT	6	63083	63094	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016736	TA	11	65079	65099	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016736	AT	7	66584	66597	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016736	AT	6	66814	66824	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245015
34	NC_016736	AT	6	71503	71513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016736	AT	6	71772	71782	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016736	TA	8	73066	73081	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016736	AT	7	77200	77212	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245016
38	NC_016736	TA	13	77605	77629	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37245016
39	NC_016736	AT	6	77631	77642	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37245016
40	NC_016736	TA	14	87553	87580	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245016
41	NC_016736	AT	6	88190	88200	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245016
42	NC_016736	AT	6	88954	88964	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245016
43	NC_016736	AG	6	114615	114625	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245016
44	NC_016736	AT	7	120863	120875	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245016
45	NC_016736	TA	6	121355	121365	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245016
46	NC_016736	AT	7	124748	124761	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245016
47	NC_016736	CT	6	130432	130443	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245016
48	NC_016736	AT	6	137058	137069	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37245016
49	NC_016736	CT	6	138189	138200	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245016

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Ricinus communis chloroplast