ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fucus vesiculosus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016735	TCT	4	4989	4999	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016735	ATT	4	7027	7037	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640365
3	NC_016735	ATA	5	7200	7213	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016735	TAT	4	8158	8170	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016735	ATT	4	9076	9087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640366
6	NC_016735	TAA	4	9131	9143	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016735	ATT	4	9493	9503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016735	CTT	4	10486	10496	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37640366
9	NC_016735	TTA	4	10534	10545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016735	TAT	4	10621	10631	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016735	TAT	4	10813	10824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016735	ATA	4	10875	10886	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016735	TAC	4	11159	11170	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37640366
14	NC_016735	TAT	4	11663	11674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016735	TAT	4	11959	11969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640366
16	NC_016735	AAT	4	12129	12139	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016735	TAA	4	12430	12441	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640366
18	NC_016735	ATA	4	15396	15406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016735	ATG	4	17354	17365	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37640367
20	NC_016735	TAA	4	18127	18138	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	37640367
21	NC_016735	TTA	5	18994	19007	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37640367
22	NC_016735	CTA	4	21696	21706	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37640367
23	NC_016735	ATT	5	22703	22718	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37640367
24	NC_016735	TAT	4	23917	23928	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640367
25	NC_016735	ATT	4	24033	24044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640367
26	NC_016735	AAT	4	24779	24791	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37640367
27	NC_016735	ATT	4	25187	25198	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640368
28	NC_016735	TAA	4	26396	26406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37640368
29	NC_016735	TAT	4	26762	26773	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640368
30	NC_016735	ATA	4	28506	28517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016735	ATA	5	31282	31296	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37640368
32	NC_016735	AGA	5	31427	31441	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37640368
33	NC_016735	TCG	4	32773	32784	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640368
34	NC_016735	TAT	4	37644	37655	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640368
35	NC_016735	AGA	4	38701	38712	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37640368
36	NC_016735	AAG	4	43468	43479	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37640369
37	NC_016735	AAT	4	45762	45773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640369
38	NC_016735	GAA	4	46800	46810	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37640369
39	NC_016735	GCT	7	48998	49018	21	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	37640370
40	NC_016735	TGC	4	49522	49533	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37640370
41	NC_016735	ATT	5	51115	51128	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016735	CAA	4	51563	51574	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37640370
43	NC_016735	TCT	4	57595	57605	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37640370
44	NC_016735	GCT	4	57867	57878	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640370
45	NC_016735	TCT	4	59204	59215	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37640371
46	NC_016735	ATC	4	59281	59292	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37640371
47	NC_016735	GAA	4	60050	60060	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37640371
48	NC_016735	TGT	4	62506	62517	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016735	ATA	4	63212	63223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640371
50	NC_016735	ATT	4	65750	65761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640371
51	NC_016735	ATT	4	67447	67457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640371
52	NC_016735	ATA	4	68549	68560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016735	ATA	4	68697	68707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37640371
54	NC_016735	TAA	4	69295	69307	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37640372
55	NC_016735	TCT	4	70094	70105	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37640372
56	NC_016735	AAG	4	73172	73183	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37640372
57	NC_016735	TAT	4	73201	73211	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016735	ATT	4	73500	73512	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016735	TGC	4	73907	73918	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640372
60	NC_016735	AGA	4	74783	74793	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37640372
61	NC_016735	TAA	4	75176	75187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640372
62	NC_016735	ATT	4	75273	75283	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016735	TAA	4	75591	75603	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37640372
64	NC_016735	TAT	4	75878	75888	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016735	ATT	4	76216	76226	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640372
66	NC_016735	ATA	5	76721	76736	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016735	TAT	4	77598	77609	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640373
68	NC_016735	TTG	4	77779	77790	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37640373
69	NC_016735	AGA	4	79767	79777	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016735	TAT	5	84934	84948	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016735	TAT	5	85186	85199	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016735	TAA	4	85269	85280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016735	AAG	5	86857	86870	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	37640374
74	NC_016735	TAA	4	87854	87865	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640374
75	NC_016735	ATC	4	89550	89561	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37640374
76	NC_016735	TTA	4	89758	89769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640374
77	NC_016735	ATA	4	89986	90000	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016735	ATT	4	91312	91323	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640374
79	NC_016735	AAT	4	91566	91577	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640374
80	NC_016735	TAT	5	94196	94210	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37640374
81	NC_016735	ATA	4	94641	94652	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016735	TAT	4	95558	95568	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640375
83	NC_016735	CTG	5	97086	97100	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	37640375
84	NC_016735	ATA	4	99181	99192	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640375
85	NC_016735	ATT	6	99616	99632	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_016735	ATA	4	99823	99833	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016735	TTA	4	101218	101229	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640375
88	NC_016735	ATT	5	102017	102032	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37640375
89	NC_016735	TTA	4	102394	102406	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016735	ATT	4	106768	106778	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016735	TTA	4	106924	106935	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640376
92	NC_016735	AAT	4	107032	107043	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016735	ATT	4	107062	107073	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016735	CCT	4	108107	108118	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	37640376
95	NC_016735	CAA	4	108738	108749	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37640376
96	NC_016735	TAT	4	108994	109005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016735	CTT	4	109928	109938	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37640376
98	NC_016735	ATT	4	115831	115842	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640377
99	NC_016735	GCT	4	117236	117247	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640377
100	NC_016735	CTT	4	118373	118383	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37640378
101	NC_016735	AAT	4	119585	119595	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37640378
102	NC_016735	ATT	4	120538	120549	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640378
103	NC_016735	AAT	4	120966	120977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640378
104	NC_016735	TAT	4	122269	122280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640379
105	NC_016735	TTA	4	123315	123325	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640379
106	NC_016735	TAA	4	124827	124838	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640379

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fucus vesiculosus chloroplast