ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica napus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016734TATTT41992182020 %80 %0 %0 %10 %Non-Coding
2NC_016734AAAAT3412941431580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
3NC_016734GAAAA3449145051580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
4NC_016734TCTCT350985111140 %60 %0 %40 %7 %38393050
5NC_016734TACCT3632663391420 %40 %0 %40 %7 %Non-Coding
6NC_016734TAAGA325335253481460 %20 %20 %0 %7 %38393049
7NC_016734GAAAA441421414402080 %0 %20 %0 %10 %Non-Coding
8NC_016734TGAAA349774497881560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
9NC_016734TTATC350664506781520 %60 %0 %20 %0 %Non-Coding
10NC_016734TTTTA463630636492020 %80 %0 %0 %5 %Non-Coding
11NC_016734AAAAT464749647692180 %20 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_016734ATTTA370541705561640 %60 %0 %0 %6 %38393050
13NC_016734TCCGG39361593629150 %20 %40 %40 %6 %38393050
14NC_016734TTTCG39619396206140 %60 %20 %20 %7 %38393050
15NC_016734TCTAA31118171118311540 %40 %0 %20 %6 %38393051
16NC_016734TTTAA31124961125101540 %60 %0 %0 %6 %38393051
17NC_016734AAATA31141331141461480 %20 %0 %0 %7 %38393051
18NC_016734AATAA31158811158941480 %20 %0 %0 %7 %38393051
19NC_016734TGTTA31195951196091520 %60 %20 %0 %6 %38393051
20NC_016734ACCGG31422611422751520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding