ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica napus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016734	TA	6	220	230	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016734	AT	9	3789	3806	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016734	TA	14	6257	6284	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016734	CA	6	6341	6351	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016734	TA	6	7843	7854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016734	TA	6	7874	7884	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016734	TA	6	7888	7898	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016734	AT	9	7973	7989	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016734	AT	6	9412	9423	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016734	TA	6	9450	9460	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016734	TA	9	9572	9588	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016734	AT	6	13378	13391	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016734	TA	6	26545	26556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016734	TC	6	27780	27791	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	38393043
15	NC_016734	AT	7	30626	30641	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016734	AG	6	34481	34491	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016734	TA	7	35368	35381	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016734	AT	13	35406	35431	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016734	TG	6	39770	39780	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	38393047
20	NC_016734	AT	6	45081	45092	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016734	TA	6	55880	55890	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393043
22	NC_016734	AT	6	57785	57795	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016734	AT	6	60432	60442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393044
24	NC_016734	TA	6	61854	61864	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016734	TA	6	65648	65658	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016734	AT	6	70416	70426	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393050
27	NC_016734	TA	6	93370	93382	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393050
28	NC_016734	AT	6	107180	107193	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393051
29	NC_016734	TA	7	111330	111343	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393051
30	NC_016734	TA	6	117795	117805	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393051
31	NC_016734	AT	6	119986	119996	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393051
32	NC_016734	TA	6	122501	122513	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393051
33	NC_016734	TA	6	122958	122968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393051
34	NC_016734	AT	6	128702	128713	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393051
35	NC_016734	AT	6	142511	142522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Brassica napus chloroplast