ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pedinomonas minor chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016733	AGC	4	2544	2555	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640357
2	NC_016733	TGT	4	5254	5264	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37640362
3	NC_016733	AGA	4	6718	6730	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	37640362
4	NC_016733	TAA	4	7041	7052	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640362
5	NC_016733	TTA	4	18616	18626	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016733	CAG	5	19778	19792	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	37640361
7	NC_016733	CAC	4	19793	19804	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37640361
8	NC_016733	ATA	5	19966	19979	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016733	TAA	4	24120	24131	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640361
10	NC_016733	TAA	5	24507	24522	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016733	CAC	4	26623	26634	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37640362
12	NC_016733	CAC	4	26872	26883	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37640362
13	NC_016733	CAC	4	32628	32639	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37640364
14	NC_016733	TAA	4	34660	34670	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37640363
15	NC_016733	AGT	4	37476	37486	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37640359
16	NC_016733	GTT	4	37557	37568	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37640359
17	NC_016733	GTT	4	39168	39180	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016733	ACC	4	39974	39985	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37640359
19	NC_016733	AGT	4	41579	41590	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37640359
20	NC_016733	TAA	4	42271	42282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016733	TTA	4	44813	44824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640358
22	NC_016733	AAG	4	48348	48358	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37640361
23	NC_016733	CAA	4	52529	52539	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	37640358
24	NC_016733	TAA	5	54159	54173	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016733	ATT	4	54629	54641	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016733	GAA	4	59506	59517	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37640361
27	NC_016733	GCT	4	60204	60215	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640361
28	NC_016733	TAT	4	67194	67205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640360
29	NC_016733	GGT	4	68589	68600	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37640360
30	NC_016733	TCT	4	69238	69249	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37640360
31	NC_016733	CAG	4	71715	71726	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640364
32	NC_016733	CAG	4	72045	72056	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640364
33	NC_016733	TAT	4	72667	72678	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640361
34	NC_016733	AGA	5	78278	78292	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016733	ATT	4	81882	81892	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640358
36	NC_016733	CAA	4	83600	83612	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	37640365
37	NC_016733	CAA	4	84999	85009	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	37640358
38	NC_016733	TAA	4	86569	86579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016733	ATT	4	87091	87101	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640365
40	NC_016733	ATA	4	87603	87613	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016733	TAT	4	87633	87643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016733	TCT	5	90447	90461	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016733	CTG	4	96683	96694	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640360

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pedinomonas minor chloroplast