ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016732	TAATTC	3	1613	1630	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016732	TGCTAA	3	1676	1693	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016732	ATTAAT	3	5927	5944	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393034
4	NC_016732	TATAAA	3	27460	27477	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38393042
5	NC_016732	ACCAAC	3	32453	32470	18	50 %	0 %	0 %	50 %	5 %	38393042
6	NC_016732	TAAATG	13	37056	37132	77	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	38393042
7	NC_016732	TTATTT	3	64597	64615	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	38393042
8	NC_016732	AAATAA	3	84165	84182	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	38393042
9	NC_016732	TTTTAT	4	87845	87868	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	38393042
10	NC_016732	AATATT	3	88103	88121	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	38393042
11	NC_016732	TTCTTT	3	90970	90987	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	38393042
12	NC_016732	GTAAAA	3	107856	107873	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	38393042
13	NC_016732	TATTTT	8	131419	131466	48	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	38393042
14	NC_016732	ATATGA	4	141566	141589	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	38393042
15	NC_016732	ATATTC	3	141639	141656	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	38393042
16	NC_016732	ATAAAT	11	151253	151318	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	38393042
17	NC_016732	TAAAAA	3	162110	162127	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	38393042
18	NC_016732	AAATAA	3	162948	162965	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	38393042
19	NC_016732	AAAATA	5	163854	163882	29	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	6 %	38393042
20	NC_016732	TAAAAA	3	164617	164634	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	38393042
21	NC_016732	AAATAT	3	171950	171967	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	38393042
22	NC_016732	GTTTAT	17	189715	189816	102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	3 %	38393042
23	NC_016732	TTATAT	3	202114	202130	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_016732	TATTTT	7	202143	202184	42	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016732	ATTTAT	8	204152	204195	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016732	TATTTA	3	204201	204219	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_016732	ATATAG	3	213230	213247	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_016732	ATTTAT	3	217694	217711	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016732	TAATTG	3	219091	219108	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	38393041
30	NC_016732	AAAGAA	3	232429	232446	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_016732	TTTATA	3	232815	232833	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_016732	AAATAA	3	233120	233137	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016732	AAAATA	3	234601	234619	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016732	TTATAT	3	242563	242580	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016732	CAATAA	4	248028	248051	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	38393042
36	NC_016732	ATAAAT	3	252929	252946	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_016732	AATATG	3	254729	254746	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_016732	ATTCAT	3	254799	254821	23	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016732	AAATAA	8	264919	264966	48	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast