ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016732	TA	6	10253	10264	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016732	AT	7	10311	10323	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016732	TA	8	15664	15678	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016732	TA	12	16216	16239	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016732	AT	8	16932	16947	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38393042
6	NC_016732	AT	7	17622	17635	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
7	NC_016732	TA	7	17647	17660	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
8	NC_016732	TA	6	19043	19054	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
9	NC_016732	TA	6	20374	20384	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
10	NC_016732	TA	7	27099	27111	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
11	NC_016732	AT	6	28473	28486	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	38393042
12	NC_016732	GT	6	32215	32226	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	38393042
13	NC_016732	TA	7	33407	33419	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
14	NC_016732	AT	6	35029	35039	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
15	NC_016732	AT	6	40636	40646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
16	NC_016732	AT	7	45151	45164	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
17	NC_016732	TA	8	50204	50219	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38393042
18	NC_016732	AT	7	51411	51423	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
19	NC_016732	TA	6	53464	53475	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
20	NC_016732	AT	6	53590	53600	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
21	NC_016732	TA	6	58671	58682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
22	NC_016732	AT	6	71739	71750	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
23	NC_016732	AT	6	74725	74736	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
24	NC_016732	AT	6	75341	75352	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
25	NC_016732	TA	23	79505	79548	44	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
26	NC_016732	AT	7	79985	79998	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
27	NC_016732	AT	6	80451	80461	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
28	NC_016732	AT	6	80490	80501	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
29	NC_016732	TA	6	80930	80940	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
30	NC_016732	AT	9	81308	81324	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393042
31	NC_016732	TA	6	81354	81364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
32	NC_016732	AT	13	81978	82002	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
33	NC_016732	TA	6	87833	87844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
34	NC_016732	TA	9	91048	91065	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393042
35	NC_016732	AT	6	96927	96938	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
36	NC_016732	TA	6	105857	105867	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
37	NC_016732	TA	6	105996	106007	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
38	NC_016732	AT	6	106768	106778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
39	NC_016732	CA	6	106806	106816	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	38393042
40	NC_016732	AT	7	107074	107089	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38393042
41	NC_016732	TA	9	123360	123377	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393042
42	NC_016732	AT	6	127367	127377	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
43	NC_016732	AT	7	132564	132576	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
44	NC_016732	AT	6	144961	144972	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
45	NC_016732	TA	9	146993	147010	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393042
46	NC_016732	TA	16	147979	148009	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
47	NC_016732	AT	10	149066	149084	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	38393042
48	NC_016732	TA	6	153276	153286	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
49	NC_016732	TA	6	153292	153302	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
50	NC_016732	TA	6	153307	153317	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
51	NC_016732	AT	7	160594	160607	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	38393042
52	NC_016732	CA	7	162131	162143	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	38393042
53	NC_016732	AT	6	169944	169954	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
54	NC_016732	AT	8	170212	170226	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38393042
55	NC_016732	TA	6	175379	175389	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
56	NC_016732	AT	9	176521	176537	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393042
57	NC_016732	AT	6	183650	183660	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
58	NC_016732	TA	6	201911	201924	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016732	AC	6	204405	204415	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016732	AT	8	205916	205930	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016732	TA	6	213423	213434	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016732	TA	6	213441	213452	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016732	TA	11	213457	213479	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016732	GA	6	217588	217599	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016732	TA	6	221398	221408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016732	TA	11	228962	228982	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016732	AT	8	228984	228999	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016732	TA	8	229004	229018	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016732	AT	6	230352	230362	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016732	TA	6	232802	232812	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016732	AT	9	233475	233492	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	38393042
72	NC_016732	AT	13	237724	237750	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016732	AT	7	241041	241053	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016732	AT	6	241120	241130	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016732	TA	6	242649	242660	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016732	AT	7	263808	263820	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast