ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016732	GTTT	3	8105	8116	12	0 %	75 %	25 %	0 %	38393034
2	NC_016732	T	12	11383	11394	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016732	T	15	11506	11520	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016732	A	12	13669	13680	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016732	TA	7	16218	16231	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016732	T	13	16959	16971	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
7	NC_016732	A	17	17190	17206	17	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
8	NC_016732	A	12	17430	17441	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
9	NC_016732	T	15	17696	17710	15	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
10	NC_016732	A	14	18298	18311	14	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
11	NC_016732	T	13	18621	18633	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
12	NC_016732	T	25	19063	19087	25	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
13	NC_016732	GCCC	3	19235	19246	12	0 %	0 %	25 %	75 %	38393042
14	NC_016732	T	14	27169	27182	14	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
15	NC_016732	TAAA	3	27742	27753	12	75 %	25 %	0 %	0 %	38393042
16	NC_016732	AT	7	28473	28486	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
17	NC_016732	T	15	30899	30913	15	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
18	NC_016732	T	14	34651	34664	14	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
19	NC_016732	T	13	34666	34678	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
20	NC_016732	T	15	35211	35225	15	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
21	NC_016732	A	19	35426	35444	19	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
22	NC_016732	TAAATG	10	37067	37126	60	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	38393042
23	NC_016732	T	12	37480	37491	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
24	NC_016732	T	17	37501	37517	17	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
25	NC_016732	T	15	38036	38050	15	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
26	NC_016732	ATT	4	38630	38641	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38393042
27	NC_016732	T	12	39941	39952	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
28	NC_016732	TTAG	3	43951	43962	12	25 %	50 %	25 %	0 %	38393042
29	NC_016732	T	14	44762	44775	14	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
30	NC_016732	T	16	45451	45466	16	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
31	NC_016732	ATTT	3	47498	47509	12	25 %	75 %	0 %	0 %	38393042
32	NC_016732	A	14	47846	47859	14	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
33	NC_016732	T	14	48783	48796	14	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
34	NC_016732	T	19	48841	48859	19	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
35	NC_016732	TAAA	3	48897	48908	12	75 %	25 %	0 %	0 %	38393042
36	NC_016732	T	13	48997	49009	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
37	NC_016732	A	16	49389	49404	16	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
38	NC_016732	A	13	50256	50268	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
39	NC_016732	A	19	50462	50480	19	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
40	NC_016732	AATA	3	59362	59373	12	75 %	25 %	0 %	0 %	38393042
41	NC_016732	A	12	61540	61551	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
42	NC_016732	TAT	4	62414	62425	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38393042
43	NC_016732	G	13	63287	63299	13	0 %	0 %	100 %	0 %	38393042
44	NC_016732	A	12	64505	64516	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
45	NC_016732	A	12	64585	64596	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
46	NC_016732	TAA	4	67429	67440	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38393042
47	NC_016732	T	21	67658	67678	21	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
48	NC_016732	T	13	67691	67703	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
49	NC_016732	A	21	67786	67806	21	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
50	NC_016732	A	17	67809	67825	17	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
51	NC_016732	T	13	68286	68298	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
52	NC_016732	ATTT	3	73628	73639	12	25 %	75 %	0 %	0 %	38393042
53	NC_016732	TA	6	79523	79534	12	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
54	NC_016732	A	20	81109	81128	20	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
55	NC_016732	AT	6	81308	81319	12	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
56	NC_016732	AT	7	81980	81993	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
57	NC_016732	AATA	3	82351	82362	12	75 %	25 %	0 %	0 %	38393042
58	NC_016732	A	13	83188	83200	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
59	NC_016732	A	12	83873	83884	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
60	NC_016732	T	17	84100	84116	17	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
61	NC_016732	A	12	84175	84186	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
62	NC_016732	TAA	4	85104	85115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38393042
63	NC_016732	A	14	86501	86514	14	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
64	NC_016732	TATTTT	3	87848	87865	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	38393042
65	NC_016732	A	16	88062	88077	16	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
66	NC_016732	TA	7	91048	91061	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
67	NC_016732	T	12	91377	91388	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
68	NC_016732	A	13	91758	91770	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
69	NC_016732	T	21	92919	92939	21	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
70	NC_016732	T	14	93523	93536	14	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
71	NC_016732	T	12	93948	93959	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
72	NC_016732	GCCC	3	94397	94408	12	0 %	0 %	25 %	75 %	38393042
73	NC_016732	A	13	95738	95750	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
74	NC_016732	A	13	96184	96196	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
75	NC_016732	A	22	97581	97602	22	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
76	NC_016732	A	12	102117	102128	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
77	NC_016732	A	12	105052	105063	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
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79	NC_016732	AT	7	107074	107087	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
80	NC_016732	T	12	107102	107113	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
81	NC_016732	TAT	4	107501	107512	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38393042
82	NC_016732	T	25	118389	118413	25	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
83	NC_016732	TTC	4	122817	122828	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38393042
84	NC_016732	TGC	4	122861	122872	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38393042
85	NC_016732	A	15	123249	123263	15	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
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97	NC_016732	TA	7	147981	147994	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
98	NC_016732	AT	7	147995	148008	14	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
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100	NC_016732	ATAAAT	9	151258	151311	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38393042
101	NC_016732	A	17	151804	151820	17	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
102	NC_016732	A	12	156163	156174	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
103	NC_016732	A	15	156195	156209	15	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
104	NC_016732	A	12	158960	158971	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
105	NC_016732	A	12	159587	159598	12	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
106	NC_016732	AT	6	160594	160605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	38393042
107	NC_016732	A	17	160964	160980	17	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
108	NC_016732	ATTT	4	161743	161758	16	25 %	75 %	0 %	0 %	38393042
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110	NC_016732	A	14	162117	162130	14	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
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113	NC_016732	AAAATA	4	163859	163882	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	38393042
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115	NC_016732	A	13	167835	167847	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
116	NC_016732	TTTCT	3	170009	170023	15	0 %	80 %	0 %	20 %	38393042
117	NC_016732	A	16	170530	170545	16	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
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119	NC_016732	A	13	170958	170970	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
120	NC_016732	T	16	173280	173295	16	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
121	NC_016732	T	12	182614	182625	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
122	NC_016732	A	13	182626	182638	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
123	NC_016732	A	13	182640	182652	13	100 %	0 %	0 %	0 %	38393042
124	NC_016732	T	12	188014	188025	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
125	NC_016732	GCCC	3	188534	188545	12	0 %	0 %	25 %	75 %	38393042
126	NC_016732	TATGTT	14	189730	189813	84	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	38393042
127	NC_016732	T	12	196529	196540	12	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
128	NC_016732	T	18	197611	197628	18	0 %	100 %	0 %	0 %	38393042
129	NC_016732	TAT	4	199182	199193	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38393042
130	NC_016732	TA	6	201911	201922	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016732	TATTTT	5	202143	202172	30	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016732	A	14	205795	205808	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016732	T	13	210763	210775	13	0 %	100 %	0 %	0 %	38393040
134	NC_016732	TA	8	213459	213474	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016732	T	13	220418	220430	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016732	T	23	220436	220458	23	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016732	T	13	221368	221380	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016732	CGGG	3	221602	221613	12	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016732	A	13	221653	221665	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016732	T	14	225369	225382	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016732	T	13	228489	228501	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016732	TA	8	228962	228977	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016732	T	17	229463	229479	17	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016732	TTA	4	230211	230222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016732	A	22	230937	230958	22	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016732	A	21	232454	232474	21	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016732	A	15	232529	232543	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016732	A	13	232940	232952	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016732	AAATAA	3	233120	233137	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016732	A	15	233178	233192	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016732	AT	6	233475	233486	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_016732	TATGT	3	234271	234285	15	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016732	A	15	234295	234309	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_016732	ATTT	3	243216	243227	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016732	T	21	244061	244081	21	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_016732	T	12	252761	252772	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016732	ATTCAT	3	254799	254816	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_016732	AAATAA	7	264919	264960	42	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016732	ATT	4	266361	266372	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016732	T	12	267173	267184	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016732	T	14	268383	268396	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast