ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016732	GTAC	3	1133	1144	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016732	CAAA	3	1510	1521	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016732	TGTT	3	3116	3126	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393034
4	NC_016732	TTTA	3	4757	4767	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393034
5	NC_016732	TTTA	3	5606	5616	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393034
6	NC_016732	CTTT	3	7098	7108	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393034
7	NC_016732	TTTG	3	7387	7398	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38393034
8	NC_016732	GTTT	3	8105	8116	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	38393034
9	NC_016732	CTAA	3	9055	9066	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	38393034
10	NC_016732	TAAA	3	10358	10368	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016732	ATTT	3	10387	10398	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016732	AATG	3	12805	12815	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016732	GGGC	3	14845	14855	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016732	ATAA	3	19027	19039	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38393042
15	NC_016732	GCCC	3	19235	19246	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	38393042
16	NC_016732	GGGC	3	20973	20983	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	38393042
17	NC_016732	TAAA	3	21087	21099	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38393042
18	NC_016732	AAAT	3	24690	24700	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
19	NC_016732	GTTT	3	26675	26685	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393042
20	NC_016732	TTTC	3	27086	27096	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393042
21	NC_016732	TAAA	5	27742	27762	21	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	38393042
22	NC_016732	TAAA	3	30252	30262	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
23	NC_016732	TTTA	3	30788	30798	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
24	NC_016732	TAGA	3	31229	31239	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38393042
25	NC_016732	GTTT	3	33255	33265	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393042
26	NC_016732	TTTG	3	33679	33690	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38393042
27	NC_016732	ATTT	3	38753	38765	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38393042
28	NC_016732	AATT	4	40406	40420	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38393042
29	NC_016732	ATTT	3	40679	40689	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
30	NC_016732	TAAA	3	40882	40893	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
31	NC_016732	TTAG	3	43951	43962	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	38393042
32	NC_016732	TTTG	3	44858	44869	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38393042
33	NC_016732	AAAT	3	46066	46077	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
34	NC_016732	TAAG	3	46826	46837	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38393042
35	NC_016732	CAAA	3	47469	47480	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38393042
36	NC_016732	ATTT	3	47498	47509	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38393042
37	NC_016732	TAAA	4	48893	48908	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38393042
38	NC_016732	TTAT	3	49905	49916	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
39	NC_016732	AAAT	3	50179	50189	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
40	NC_016732	ATGT	3	51103	51113	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38393042
41	NC_016732	CTAT	3	51431	51442	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	38393042
42	NC_016732	ATTT	3	56193	56204	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
43	NC_016732	AAAT	3	57292	57303	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
44	NC_016732	TTAA	3	57972	57982	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
45	NC_016732	AATA	3	59362	59373	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38393042
46	NC_016732	AAAT	3	59560	59571	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
47	NC_016732	AAAT	3	62556	62566	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
48	NC_016732	AATT	5	62714	62732	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	38393042
49	NC_016732	TTAA	4	63649	63663	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	38393042
50	NC_016732	TTAT	3	64337	64348	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
51	NC_016732	TAGA	3	64354	64364	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	38393042
52	NC_016732	ATTT	3	64616	64627	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
53	NC_016732	TTTA	3	65642	65652	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
54	NC_016732	TTTG	3	65689	65699	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393042
55	NC_016732	TTTA	3	66393	66403	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
56	NC_016732	TTTA	3	67635	67645	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
57	NC_016732	TTTA	3	68645	68656	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
58	NC_016732	TTAT	3	70732	70742	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
59	NC_016732	TTTA	3	71075	71085	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
60	NC_016732	ATTT	3	72600	72610	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
61	NC_016732	TTAA	3	73555	73565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	38393042
62	NC_016732	ATTT	3	73628	73639	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38393042
63	NC_016732	ATTT	3	73843	73853	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
64	NC_016732	CTTT	3	75093	75103	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393042
65	NC_016732	AAAC	3	78252	78262	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
66	NC_016732	TAAA	3	78974	78986	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	38393042
67	NC_016732	TTAA	3	79809	79820	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
68	NC_016732	AAAC	3	79955	79966	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38393042
69	NC_016732	ATAA	3	80647	80658	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
70	NC_016732	TTAT	3	81867	81878	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38393042
71	NC_016732	CTAA	3	82111	82121	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	38393042
72	NC_016732	AATA	3	82351	82362	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	38393042
73	NC_016732	TTTA	3	82848	82859	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
74	NC_016732	AAAG	3	84604	84614	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38393042
75	NC_016732	AACA	3	85126	85136	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
76	NC_016732	TTAT	4	87974	87988	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	38393042
77	NC_016732	CAAA	3	89332	89342	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
78	NC_016732	TATT	3	90360	90371	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
79	NC_016732	TAAA	3	91714	91725	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
80	NC_016732	GCCC	3	94397	94408	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	38393042
81	NC_016732	AATT	3	96653	96664	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	38393042
82	NC_016732	TTTA	3	97251	97262	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
83	NC_016732	TAAA	3	101017	101028	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
84	NC_016732	ATAA	3	101262	101272	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
85	NC_016732	ATAA	3	102775	102785	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
86	NC_016732	AAAT	4	105148	105162	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38393042
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89	NC_016732	AAAT	4	109169	109184	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	38393042
90	NC_016732	CTTT	4	111793	111807	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	38393042
91	NC_016732	TAAA	3	112497	112507	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
92	NC_016732	ACAG	3	113104	113114	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	38393042
93	NC_016732	AAAT	3	113757	113767	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
94	NC_016732	ATTG	3	113921	113931	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38393042
95	NC_016732	CAAA	3	115043	115054	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38393042
96	NC_016732	TTTC	3	116267	116279	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	38393042
97	NC_016732	CTTT	3	119839	119849	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393042
98	NC_016732	AGAA	3	120669	120679	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38393042
99	NC_016732	TTTA	3	121645	121657	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38393042
100	NC_016732	AAAC	3	121737	121747	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
101	NC_016732	ACAA	3	126536	126547	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38393042
102	NC_016732	TAGA	3	127316	127327	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	38393042
103	NC_016732	ACAA	3	127944	127956	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	38393042
104	NC_016732	GTTA	3	128872	128882	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	38393042
105	NC_016732	TTGT	3	129075	129085	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393042
106	NC_016732	CAAA	3	134778	134788	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
107	NC_016732	TAAA	3	134926	134936	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
108	NC_016732	TTTA	3	134975	134986	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
109	NC_016732	AAAG	3	137403	137413	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38393042
110	NC_016732	CTTT	3	142540	142550	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393042
111	NC_016732	CTTT	3	145825	145835	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	38393042
112	NC_016732	ATTT	3	146655	146665	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
113	NC_016732	ATTT	3	147631	147641	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
114	NC_016732	AAAC	3	150293	150304	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	38393042
115	NC_016732	AGAA	3	151235	151245	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38393042
116	NC_016732	TAAA	3	151471	151481	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
117	NC_016732	AAAG	3	151963	151973	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	38393042
118	NC_016732	TTAT	3	156941	156952	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	38393042
119	NC_016732	TTTA	3	158200	158212	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	38393042
120	NC_016732	AAAC	3	160906	160916	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
121	NC_016732	TTTG	3	161074	161084	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393042
122	NC_016732	ATAA	3	161379	161390	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
123	NC_016732	ATTT	4	161743	161758	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	38393042
124	NC_016732	ATAA	3	161872	161882	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	38393042
125	NC_016732	GTGC	3	165661	165671	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	38393042
126	NC_016732	TTTA	3	170517	170527	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	38393042
127	NC_016732	TTGT	3	170794	170805	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	38393042
128	NC_016732	AAAC	3	172047	172057	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	38393042
129	NC_016732	TTTC	3	172699	172710	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	38393042
130	NC_016732	TGTT	3	173225	173235	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	38393042
131	NC_016732	AATA	3	173474	173485	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	38393042
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Dunaliella salina chloroplast