Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Synedra acus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016731CAA41711821266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37882446
2NC_016731CAT49279371133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37882446
3NC_016731ATT4120412151233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882446
4NC_016731AAT5130413181566.67 %33.33 %0 %0 %6 %37882446
5NC_016731GGT417781789120 %33.33 %66.67 %0 %8 %37882446
6NC_016731TTA4282928401233.33 %66.67 %0 %0 %0 %37882446
7NC_016731AAT4534253521166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882447
8NC_016731TAA4777877891266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882447
9NC_016731ATT4794279521133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016731TAA4847784871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016731AGA4923092411266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37882447
12NC_016731AAT410520105311266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882448
13NC_016731TAA410688106981166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882448
14NC_016731AAT411213112241266.67 %33.33 %0 %0 %0 %37882448
15NC_016731TAA411538115491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_016731ATT412475124861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_016731ATA412907129191366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_016731TAA413202132121166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882448
19NC_016731TAT413630136401133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37882448
20NC_016731TAT513790138031433.33 %66.67 %0 %0 %7 %37882448
21NC_016731TAT413993140041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882448
22NC_016731GGT41510015111120 %33.33 %66.67 %0 %8 %37882448
23NC_016731TGC51587315887150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %37882448
24NC_016731TAA416479164901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882448
25NC_016731ATA416559165691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882448
26NC_016731TAA517435174491566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_016731TAT417452174631233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_016731TAT418141181521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882449
29NC_016731TAA419977199881266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016731AAC421624216351266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37882449
31NC_016731TAT522241222551533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_016731GAA422502225131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37882450
33NC_016731ATA424190242011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016731TTC52444124455150 %66.67 %0 %33.33 %6 %37882450
35NC_016731GCA424496245071233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37882450
36NC_016731TGG42573525746120 %33.33 %66.67 %0 %8 %37882450
37NC_016731TGG42888928899110 %33.33 %66.67 %0 %9 %37882451
38NC_016731TAA429166291771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
39NC_016731CTA430949309601233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37882451
40NC_016731ATA431489315001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882451
41NC_016731TAT435084350951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882451
42NC_016731GTT43516235173120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37882451
43NC_016731ATA435512355231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882451
44NC_016731ATT437322373331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882452
45NC_016731TGT44154241553120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37882452
46NC_016731ACA443148431591266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37882452
47NC_016731ATA443708437181166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882452
48NC_016731ATA544170441841566.67 %33.33 %0 %0 %6 %37882452
49NC_016731ATA444203442141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882452
50NC_016731ATG447387473981233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37882452
51NC_016731TTA447512475221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
52NC_016731TAG447689477001233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37882452
53NC_016731ACC448188481991233.33 %0 %0 %66.67 %8 %37882452
54NC_016731TAA551794518071466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37882453
55NC_016731ATT554252542671633.33 %66.67 %0 %0 %6 %37882453
56NC_016731GCT45473554748140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %37882453
57NC_016731TAA469546695571266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882454
58NC_016731ATA473797738081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882454
59NC_016731ATA478087780981266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882455
60NC_016731TAA481332813431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882455
61NC_016731ATT481983819941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_016731TTG48205382065130 %66.67 %33.33 %0 %7 %37882456
63NC_016731CAA482386823971266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37882456
64NC_016731CTT48394283952110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37882456
65NC_016731CAT484331843421233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37882456
66NC_016731TAT486387863981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
67NC_016731TTG49067190682120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37882457
68NC_016731TAA791771917902066.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
69NC_016731AAT492081920911166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882457
70NC_016731ATT492945929551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37882457
71NC_016731TTG49385893869120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37882457
72NC_016731TGC49495394964120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37882457
73NC_016731TAT495412954221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_016731ATA496670966801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882458
75NC_016731ATA498811988221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37882458
76NC_016731ATT499611996221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
77NC_016731AAT499645996561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_016731ATA499704997151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_016731AAT499759997691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016731TCT4100800100810110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37882458
81NC_016731GCT4101072101083120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %37882458
82NC_016731AAG41017611017721266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37882458
83NC_016731TAT41026481026591233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882458
84NC_016731TCT4103952103962110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37882458
85NC_016731AAT41040311040421266.67 %33.33 %0 %0 %0 %37882458
86NC_016731TTA41073991074101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37882459
87NC_016731ATA41074441074541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37882459