ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene latifolia chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016730	TTG	4	6683	6695	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016730	ATT	5	8214	8227	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016730	TCT	4	8857	8867	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016730	ATA	4	9436	9446	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016730	ATT	4	12422	12434	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016730	TTC	4	12576	12587	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016730	TAA	4	15446	15457	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016730	TTG	4	15502	15512	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424994
9	NC_016730	TTA	4	19909	19920	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424994
10	NC_016730	TCT	4	21156	21167	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424994
11	NC_016730	GTT	4	22542	22553	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424994
12	NC_016730	TCA	4	24890	24900	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424994
13	NC_016730	AAT	4	26494	26505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016730	GTA	4	27780	27790	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016730	ATT	4	29305	29315	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016730	ATT	4	34298	34309	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016730	GAA	4	34878	34888	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016730	ATG	4	36826	36836	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424994
19	NC_016730	GCA	4	38724	38735	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424995
20	NC_016730	TAA	4	41341	41352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424995
21	NC_016730	AAT	5	42270	42284	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37424995
22	NC_016730	TAT	4	43198	43208	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016730	ATA	5	43785	43798	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016730	TTA	4	44724	44736	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016730	ATA	4	45553	45563	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016730	CAA	4	49296	49306	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016730	ATT	4	49488	49499	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016730	GCT	4	55478	55490	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	37424995
29	NC_016730	TTA	4	64580	64591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016730	TAT	4	66649	66661	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016730	TCT	4	72651	72661	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37424997
32	NC_016730	TAA	4	73950	73960	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424997
33	NC_016730	TAT	4	75614	75624	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424997
34	NC_016730	TAT	4	81368	81379	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424997
35	NC_016730	AAT	4	82938	82948	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424997
36	NC_016730	GAT	4	84147	84157	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424997
37	NC_016730	GAG	4	85079	85090	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	37424997
38	NC_016730	CTT	5	88212	88226	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	37424997
39	NC_016730	AAG	4	100709	100721	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016730	AAT	4	105462	105473	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016730	GAA	5	106887	106901	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016730	AGA	4	108506	108517	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016730	TAA	4	109212	109223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424999
44	NC_016730	TTG	4	110703	110714	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424999
45	NC_016730	TAA	4	111360	111372	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016730	TAT	4	111447	111457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016730	ATC	4	111963	111974	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016730	AAT	4	112584	112596	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016730	ATA	5	115988	116001	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016730	TAA	4	116774	116786	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37425000
51	NC_016730	ATT	4	122305	122316	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37425000
52	NC_016730	TAT	4	124614	124626	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37425000
53	NC_016730	TTC	4	125923	125934	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37425000
54	NC_016730	TTC	6	127536	127554	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	37425000
55	NC_016730	TAA	4	128559	128570	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016730	ATT	4	128968	128979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016730	TAT	4	133520	133531	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016730	AAG	5	146215	146229	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37425000
59	NC_016730	ATC	4	150284	150294	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene latifolia chloroplast