ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene conica chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016729TTTA41461611625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_016729AAAT32002111275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_016729TACC35315411125 %25 %0 %50 %9 %37424984
4NC_016729AAGT3101510251150 %25 %25 %0 %9 %37424984
5NC_016729TCAAT3177317861440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
6NC_016729TATTT3183118441420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016729AGCAC3206420771440 %0 %20 %40 %7 %Non-Coding
8NC_016729TCTT321442154110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
9NC_016729AAAT3273527451175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016729A122811282212100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016729ATAA3286428751275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_016729TTTG335533563110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
13NC_016729TTTA3360636161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016729AAGA3396239731275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016729TAT4455945701233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
16NC_016729TTTA3542154311125 %75 %0 %0 %9 %37424985
17NC_016729TA10626662841950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
18NC_016729AAAG3650965191175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
19NC_016729TTA4652365341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016729TTG466746686130 %66.67 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
21NC_016729AGAT3738673961150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
22NC_016729TA6743174411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_016729AAAT3747774881275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016729TA6812581351150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_016729TA6813881481150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_016729T1382168228130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_016729AAAC3870087101175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
28NC_016729TCT487728782110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
29NC_016729AT12930893312450 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016729GAAG311784117951250 %0 %50 %0 %0 %Non-Coding
31NC_016729TTC41181711828120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
32NC_016729AT711959119721450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016729ACTA312685126961250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
34NC_016729AAAT314545145551175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_016729T161463514650160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
36NC_016729TAAA414680146951675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
37NC_016729TAA414696147071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_016729TTG41475114761110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
39NC_016729A14159141592714100 %0 %0 %0 %0 %37424985
40NC_016729T141673516748140 %100 %0 %0 %7 %37424985
41NC_016729AATTGA317134171511850 %33.33 %16.67 %0 %5 %37424985
42NC_016729AT617205172151150 %50 %0 %0 %9 %37424985
43NC_016729AATT318963189741250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_016729AT619125191381450 %50 %0 %0 %7 %37424985
45NC_016729TTA419156191671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37424985
46NC_016729TCT42040320414120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37424985
47NC_016729CTAT320980209911225 %50 %0 %25 %8 %37424985
48NC_016729GTT42105221063120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37424985
49NC_016729CCTA321973219831125 %25 %0 %50 %9 %37424986
50NC_016729TCA423400234101133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37424986
51NC_016729CAAGA323695237081460 %0 %20 %20 %7 %37424986
52NC_016729AT824873248871550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
53NC_016729AAGAAA324962249791883.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
54NC_016729AAT424996250071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016729ATT525420254331433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
56NC_016729T122604226053120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
57NC_016729GTA426225262351133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
58NC_016729AATAT326266262811660 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
59NC_016729ATA426282262941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
60NC_016729AT627715277271350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_016729TA628163281741250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_016729ATA428379283901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
63NC_016729CTTT32857228583120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
64NC_016729AAAT329300293111275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016729GAAA330846308571275 %0 %25 %0 %8 %37424986
66NC_016729GGGA330966309771225 %0 %75 %0 %8 %37424986
67NC_016729TTGC33124731257110 %50 %25 %25 %9 %37424986
68NC_016729TAAT331809318201250 %50 %0 %0 %8 %37424986
69NC_016729T153192531939150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_016729AG632056320661150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
71NC_016729CCAT332258322691225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
72NC_016729TTCT33307133082120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
73NC_016729GAA433257332671166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
74NC_016729ATG433365333771333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
75NC_016729ATTG335050350601125 %50 %25 %0 %9 %37424986
76NC_016729ATG435203352131133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37424986
77NC_016729GCA437101371121233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %37424986
78NC_016729ATTA338692387041350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
79NC_016729TTA439420394301133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016729GTCC34284142852120 %25 %25 %50 %8 %37424987
81NC_016729A12431424315312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016729TGAA543683437032150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
83NC_016729TAT443750437611233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
84NC_016729A14458654587814100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
85NC_016729ATA446818468281166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_016729GTTT34683346845130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
87NC_016729AT846887469011550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
88NC_016729AATTTA346903469211950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
89NC_016729TGTT34965549666120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
90NC_016729TTTTA350344503581520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
91NC_016729ATA450364503761366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
92NC_016729AT650457504671150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
93NC_016729TA650850508601150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
94NC_016729A13508825089413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
95NC_016729TA651534515441150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
96NC_016729CTT45193651947120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
97NC_016729T145194651959140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_016729AT652130521401150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_016729TAA452256522681366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
100NC_016729ATA452275522871366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
101NC_016729TAA453049530601266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
102NC_016729TAT553216532291433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
103NC_016729GATTTA353620536371833.33 %50 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
104NC_016729ATA753763537832166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
105NC_016729A12550965510712100 %0 %0 %0 %8 %37424987
106NC_016729ATTT356096561071225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_016729ATTT456217562331725 %75 %0 %0 %5 %Non-Coding
108NC_016729AAAT356242562541375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
109NC_016729A19571605717819100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
110NC_016729A12575495756012100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
111NC_016729AGAA357676576871275 %0 %25 %0 %8 %37424988
112NC_016729TCTATA357703577211933.33 %50 %0 %16.67 %10 %37424988
113NC_016729T135840658418130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
114NC_016729ATT459734597451233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
115NC_016729TAT460135601471333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
116NC_016729A12618156182612100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
117NC_016729TA761899619141650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
118NC_016729A18621006211718100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
119NC_016729TAT462745627561233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
120NC_016729T126275362764120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
121NC_016729AAATG362766627801560 %20 %20 %0 %6 %37424988
122NC_016729T136342763439130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
123NC_016729CTTT36380463814110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
124NC_016729ACAA363861638711175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
125NC_016729TACA364291643021250 %25 %0 %25 %8 %37424988
126NC_016729TAAA364316643271275 %25 %0 %0 %8 %37424988
127NC_016729T166441664431160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
128NC_016729AAAT364854648641175 %25 %0 %0 %9 %37424989
129NC_016729TAA464870648801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
130NC_016729TTTA365055650661225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
131NC_016729TGAA365507655181250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
132NC_016729ATTT366243662531125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
133NC_016729TA767547675591350 %50 %0 %0 %7 %37424989
134NC_016729TA667565675761250 %50 %0 %0 %8 %37424989
135NC_016729A14700577007014100 %0 %0 %0 %7 %37424989
136NC_016729TTTC37038170392120 %75 %0 %25 %0 %37424989
137NC_016729T137069270704130 %100 %0 %0 %0 %37424989
138NC_016729TCGG37140471414110 %25 %50 %25 %9 %37424989
139NC_016729TA772250722621350 %50 %0 %0 %7 %37424989
140NC_016729ATT472276722881333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37424989
141NC_016729ATCT372696727071225 %50 %0 %25 %8 %37424989
142NC_016729TCTT37331573326120 %75 %0 %25 %8 %37424989
143NC_016729TA673348733591250 %50 %0 %0 %8 %37424989
144NC_016729TTTTAT373370733881916.67 %83.33 %0 %0 %10 %37424989
145NC_016729T147365673669140 %100 %0 %0 %7 %37424989
146NC_016729AATC373710737211250 %25 %0 %25 %8 %37424989
147NC_016729GTTA375433754441225 %50 %25 %0 %8 %37424989
148NC_016729ATTT375548755581125 %75 %0 %0 %9 %37424989
149NC_016729CTTT37604276052110 %75 %0 %25 %9 %37424989
150NC_016729AAAT376625766351175 %25 %0 %0 %9 %37424989
151NC_016729GGTTAT377015770331916.67 %50 %33.33 %0 %10 %37424989
152NC_016729TA777195772081450 %50 %0 %0 %7 %37424989
153NC_016729AATT377817778281250 %50 %0 %0 %8 %37424989
154NC_016729ATTT377961779711125 %75 %0 %0 %9 %37424989
155NC_016729TAT478083780941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37424989
156NC_016729AT679165791761250 %50 %0 %0 %8 %37424989
157NC_016729AAT479646796561166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37424989
158NC_016729GAT480855808651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37424989
159NC_016729AATA481052810671675 %25 %0 %0 %6 %37424989
160NC_016729ATAA381093811041275 %25 %0 %0 %8 %37424989
161NC_016729TTCT38198381993110 %75 %0 %25 %9 %37424989
162NC_016729ATCG382474824861325 %25 %25 %25 %7 %37424989
163NC_016729TCT48414084151120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37424989
164NC_016729TGAT384629846411325 %50 %25 %0 %7 %37424989
165NC_016729GTGACG485141851642416.67 %16.67 %50 %16.67 %8 %37424989
166NC_016729GGATAT485247852702433.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37424989
167NC_016729TGTT39030390313110 %75 %25 %0 %9 %37424989
168NC_016729GCTC39138391393110 %25 %25 %50 %9 %Non-Coding
169NC_016729ATTAGT391918919341733.33 %50 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
170NC_016729ATCC395227952381225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
171NC_016729TCTA395612956231225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
172NC_016729AAG495751957631366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
173NC_016729GAGG398511985221225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
174NC_016729AGGT398722987331225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
175NC_016729TAAG399842998521150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
176NC_016729GCCCT3100202100215140 %20 %20 %60 %7 %Non-Coding
177NC_016729AAT41005121005231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
178NC_016729TAT41009221009331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
179NC_016729AGAATG41012551012772350 %16.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
180NC_016729AT61017821017921150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
181NC_016729ATA41018121018231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
182NC_016729ATA41018711018821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
183NC_016729CAT41018981019081133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
184NC_016729ATA41019301019411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
185NC_016729CAT41019571019671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
186NC_016729ATT41023481023591233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37424991
187NC_016729AATA41026551026691575 %25 %0 %0 %6 %37424991
188NC_016729GAA41029441029541166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37424991
189NC_016729GAA41029591029691166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37424991
190NC_016729GAA41029741029841166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37424991
191NC_016729A1310326910328113100 %0 %0 %0 %7 %37424991
192NC_016729A1510344410345815100 %0 %0 %0 %0 %37424991
193NC_016729AAT41048251048351166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37424991
194NC_016729A1310490410491613100 %0 %0 %0 %7 %37424991
195NC_016729TAAA31049401049501175 %25 %0 %0 %9 %37424991
196NC_016729A1510501010502415100 %0 %0 %0 %0 %37424991
197NC_016729A1210520610521712100 %0 %0 %0 %0 %37424991
198NC_016729AAAAC31057281057421580 %0 %0 %20 %6 %37424991
199NC_016729AGAA31059591059701275 %0 %25 %0 %8 %37424991
200NC_016729AC71064771064901450 %0 %0 %50 %7 %37424991
201NC_016729A1810648910650618100 %0 %0 %0 %5 %37424991
202NC_016729A2310696210698423100 %0 %0 %0 %4 %37424991
203NC_016729TTG4109091109102120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37424991
204NC_016729ATTT31093151093261225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
205NC_016729ATTAAG31095941096101750 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
206NC_016729TAA41097071097181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
207NC_016729TAT41097921098021133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
208NC_016729A1211032411033512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
209NC_016729TA81103341103481550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
210NC_016729T14110358110371140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
211NC_016729AAGA31105951106051175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
212NC_016729TATT31106701106811225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
213NC_016729TAAAT31121301121441560 %40 %0 %0 %6 %37424991
214NC_016729GAAA31123851123961275 %0 %25 %0 %8 %37424991
215NC_016729AGAA31124271124381275 %0 %25 %0 %0 %37424991
216NC_016729TAAA31143601143701175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
217NC_016729A1511526811528215100 %0 %0 %0 %6 %37424992
218NC_016729T14115749115762140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
219NC_016729AATT51159461159652050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
220NC_016729A1311650011651213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
221NC_016729CCCA31168331168441225 %0 %0 %75 %8 %37424992
222NC_016729CTTT3117569117580120 %75 %0 %25 %8 %37424992
223NC_016729T23120354120376230 %100 %0 %0 %4 %Non-Coding
224NC_016729ATCT31204731204841225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
225NC_016729ATT41207321207431233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37424992
226NC_016729T16120836120851160 %100 %0 %0 %6 %37424992
227NC_016729GT7120850120863140 %50 %50 %0 %7 %37424992
228NC_016729ATCTT31215421215551420 %60 %0 %20 %7 %37424992
229NC_016729GTTTT3121596121610150 %80 %20 %0 %6 %37424992
230NC_016729T15122121122135150 %100 %0 %0 %6 %37424992
231NC_016729T15122314122328150 %100 %0 %0 %0 %37424992
232NC_016729T13122425122437130 %100 %0 %0 %7 %37424992
233NC_016729TAT41225041225161333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37424992
234NC_016729TTTA31237951238051125 %75 %0 %0 %9 %37424992
235NC_016729T18123880123897180 %100 %0 %0 %5 %37424992
236NC_016729T13124060124072130 %100 %0 %0 %7 %37424992
237NC_016729ATG41253711253811133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
238NC_016729TA61254031254131150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
239NC_016729ATG41254301254401133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
240NC_016729TA61254621254721150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
241NC_016729ATT41255161255271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
242NC_016729TA61255451255551150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
243NC_016729CATTCT41260611260832316.67 %50 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
244NC_016729AATT31261711261811150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
245NC_016729TAA51264061264201566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
246NC_016729ATT41268151268261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
247NC_016729CTTA31274861274961125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
248NC_016729CTAC31286031286141225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
249NC_016729TAT41313751313861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
250NC_016729CCTT3131574131584110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
251NC_016729GGAT31321001321111225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
252NC_016729AGAA31325981326101375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
253NC_016729ACTAAT31354041354201750 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
254NC_016729GAGC31359451359551125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
255NC_016729AGAT31414141414251250 %25 %25 %0 %0 %37424992
256NC_016729TCCATA41420651420882433.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %37424992
257NC_016729ATCGTC41421721421952416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %4 %37424992
258NC_016729CTTT3142638142648110 %75 %0 %25 %9 %37424992
259NC_016729ATCA31426971427091350 %25 %0 %25 %7 %37424992
260NC_016729ATCC31427361427461125 %25 %0 %50 %9 %37424992
261NC_016729CGAT31448521448641325 %25 %25 %25 %7 %37424992
262NC_016729TATT41462711462861625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
263NC_016729ATC41464731464831133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding