ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016729	TAT	4	4559	4570	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016729	TTA	4	6523	6534	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016729	TTG	4	6674	6686	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016729	TCT	4	8772	8782	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016729	TTC	4	11817	11828	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016729	TAA	4	14696	14707	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016729	TTG	4	14751	14761	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016729	TTA	4	19156	19167	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424985
9	NC_016729	TCT	4	20403	20414	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424985
10	NC_016729	GTT	4	21052	21063	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424985
11	NC_016729	TCA	4	23400	23410	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424986
12	NC_016729	AAT	4	24996	25007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016729	ATT	5	25420	25433	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016729	GTA	4	26225	26235	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016729	ATA	4	26282	26294	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016729	ATA	4	28379	28390	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016729	GAA	4	33257	33267	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016729	ATG	4	33365	33377	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016729	ATG	4	35203	35213	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424986
20	NC_016729	GCA	4	37101	37112	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424986
21	NC_016729	TTA	4	39420	39430	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016729	TAT	4	43750	43761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016729	ATA	4	46818	46828	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016729	ATA	4	50364	50376	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016729	CTT	4	51936	51947	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016729	TAA	4	52256	52268	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016729	ATA	4	52275	52287	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016729	TAA	4	53049	53060	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016729	TAT	5	53216	53229	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016729	ATA	7	53763	53783	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016729	ATT	4	59734	59745	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016729	TAT	4	60135	60147	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016729	TAT	4	62745	62756	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016729	TAA	4	64870	64880	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016729	ATT	4	72276	72288	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37424989
36	NC_016729	TAT	4	78083	78094	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424989
37	NC_016729	AAT	4	79646	79656	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424989
38	NC_016729	GAT	4	80855	80865	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424989
39	NC_016729	TCT	4	84140	84151	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424989
40	NC_016729	AAG	4	95751	95763	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016729	AAT	4	100512	100523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016729	TAT	4	100922	100933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016729	ATA	4	101812	101823	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016729	ATA	4	101871	101882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016729	CAT	4	101898	101908	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016729	ATA	4	101930	101941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016729	CAT	4	101957	101967	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016729	ATT	4	102348	102359	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424991
49	NC_016729	GAA	4	102944	102954	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424991
50	NC_016729	GAA	4	102959	102969	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424991
51	NC_016729	GAA	4	102974	102984	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424991
52	NC_016729	AAT	4	104825	104835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424991
53	NC_016729	TTG	4	109091	109102	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424991
54	NC_016729	TAA	4	109707	109718	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016729	TAT	4	109792	109802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016729	ATT	4	120732	120743	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424992
57	NC_016729	TAT	4	122504	122516	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37424992
58	NC_016729	ATG	4	125371	125381	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016729	ATG	4	125430	125440	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016729	ATT	4	125516	125527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016729	TAA	5	126406	126420	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016729	ATT	4	126815	126826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016729	TAT	4	131375	131386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016729	ATC	4	146473	146483	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica chloroplast