ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhynchoryza subulata plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016718	CAG	4	675	686	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424960
2	NC_016718	AGC	4	4092	4102	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016718	TAA	4	6339	6349	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016718	GAA	4	8477	8488	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016718	GAA	4	8500	8511	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016718	TTG	4	10810	10820	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424960
7	NC_016718	TAT	4	17674	17684	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016718	CTA	4	19959	19970	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016718	ATT	4	20061	20071	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016718	AGA	4	21052	21063	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424961
11	NC_016718	AAC	4	23705	23716	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424961
12	NC_016718	GAA	7	28892	28912	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424961
13	NC_016718	AGA	4	31165	31175	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424961
14	NC_016718	GTT	5	32363	32377	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	37424961
15	NC_016718	TGC	4	33208	33219	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424961
16	NC_016718	TCC	4	37881	37892	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016718	ATG	4	39318	39328	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424961
18	NC_016718	TAT	4	48325	48335	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016718	CTT	4	48671	48682	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016718	GAA	4	59554	59566	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016718	GAA	4	59570	59580	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016718	TTC	4	61756	61767	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424963
23	NC_016718	TTA	4	64660	64671	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016718	TCT	4	66576	66587	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016718	AGA	4	75802	75813	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424964
26	NC_016718	TAT	4	76858	76868	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424964
27	NC_016718	TCT	4	81954	81967	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37424964
28	NC_016718	TTC	4	83055	83065	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37424964
29	NC_016718	TTA	4	85998	86008	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424964
30	NC_016718	ATA	4	88807	88817	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424964
31	NC_016718	TAC	4	90623	90634	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424964
32	NC_016718	AAG	4	104315	104326	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424968
33	NC_016718	ATA	4	110344	110355	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424968
34	NC_016718	TAA	4	115749	115759	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424968
35	NC_016718	GTA	4	127699	127710	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37424968
36	NC_016718	ATA	4	132324	132334	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhynchoryza subulata plastid