ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Liriomyza huidobrensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016716	ATTTTT	3	802	819	18	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	37229196
2	NC_016716	ATTA	3	870	881	12	50 %	50 %	0 %	8 %	37229196
3	NC_016716	TATT	3	1157	1168	12	25 %	75 %	0 %	0 %	37229196
4	NC_016716	ATT	4	2805	2815	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	37229196
5	NC_016716	TAA	4	3363	3374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37229196
6	NC_016716	ATA	7	3830	3850	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016716	TTTTTG	3	4970	4988	19	0 %	83.33 %	16.67 %	10 %	37229196
8	NC_016716	TA	6	5487	5497	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016716	AAT	4	5776	5787	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37229197
10	NC_016716	TTTA	3	5828	5839	12	25 %	75 %	0 %	8 %	37229197
11	NC_016716	AAATAA	4	6322	6345	24	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	37229197
12	NC_016716	ATT	4	6386	6396	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	37229197
13	NC_016716	AAG	4	7021	7032	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37229197
14	NC_016716	TTA	4	7192	7203	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37229197
15	NC_016716	ATA	6	7297	7313	17	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	37229197
16	NC_016716	TGAA	3	7382	7392	11	50 %	25 %	25 %	9 %	37229197
17	NC_016716	TAAA	4	7532	7546	15	75 %	25 %	0 %	6 %	37229197
18	NC_016716	TAT	4	7739	7750	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37229197
19	NC_016716	ATAA	4	8916	8931	16	75 %	25 %	0 %	6 %	37229197
20	NC_016716	TAAAAA	4	9150	9173	24	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	37229197
21	NC_016716	TA	6	9587	9597	11	50 %	50 %	0 %	9 %	37229197
22	NC_016716	AAGA	3	9814	9824	11	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016716	ATTTT	4	10026	10045	20	20 %	80 %	0 %	10 %	37229197
24	NC_016716	TTTA	3	10071	10082	12	25 %	75 %	0 %	0 %	37229197
25	NC_016716	AAAT	3	10223	10233	11	75 %	25 %	0 %	9 %	37229197
26	NC_016716	TTA	4	10997	11008	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	37229197
27	NC_016716	TTA	4	11115	11125	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	37229197
28	NC_016716	AAT	4	11637	11648	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37229197
29	NC_016716	ATA	4	11792	11802	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37229197
30	NC_016716	TAA	4	12524	12534	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37229197
31	NC_016716	AATT	3	13011	13022	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016716	TAAAT	3	13024	13037	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016716	TAAA	3	13099	13109	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016716	ATT	4	13367	13378	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016716	TTAAAA	3	13384	13402	19	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016716	ATAAAA	3	13408	13426	19	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_016716	AATT	5	13564	13583	20	50 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_016716	TTAA	3	13912	13923	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016716	ATTT	4	14610	14626	17	25 %	75 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016716	TAA	4	14781	14793	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016716	ATAA	4	14883	14899	17	75 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016716	TATAAA	3	14948	14965	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_016716	TTTAAA	3	15025	15043	19	50 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
44	NC_016716	ATTA	4	15045	15061	17	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_016716	TAAA	3	15315	15325	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016716	T	19	15431	15449	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016716	TA	7	15558	15571	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016716	TA	9	15619	15636	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_016716	TA	8	15649	15666	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_016716	AT	9	15682	15699	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016716	AT	6	15738	15749	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016716	TTAT	3	15757	15768	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016716	TA	9	15824	15840	17	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016716	TATAA	3	15843	15857	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016716	AT	6	15872	15882	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016716	TA	7	15934	15948	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016716	ATAA	4	15949	15964	16	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016716	TAT	4	16013	16024	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016716	TTTA	3	16062	16073	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016716	A	26	16103	16128	26	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Liriomyza huidobrensis mitochondrion