ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Liriomyza bryoniae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016713	TTAT	3	629	641	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37229192
2	NC_016713	TAATTT	4	823	846	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229192
3	NC_016713	AAT	4	1135	1145	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37229192
4	NC_016713	TAT	4	1998	2009	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229192
5	NC_016713	AGG	4	2083	2094	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	37229192
6	NC_016713	GAAA	3	2202	2213	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37229192
7	NC_016713	ATT	4	2807	2817	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37229192
8	NC_016713	TTTA	3	3159	3169	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37229192
9	NC_016713	ATT	6	3831	3848	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_016713	TTTTTG	3	4974	4992	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	37229192
11	NC_016713	TA	6	5491	5501	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016713	ATT	4	5730	5741	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229192
13	NC_016713	AAT	4	5780	5791	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37229192
14	NC_016713	TTTA	3	5832	5843	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37229192
15	NC_016713	TAAT	3	6040	6051	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016713	ATTTAT	3	6168	6185	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016713	ATT	4	6395	6405	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37229192
18	NC_016713	AGAAAA	3	6902	6920	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	37229192
19	NC_016713	AAG	4	7030	7041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37229192
20	NC_016713	TTA	4	7201	7212	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229192
21	NC_016713	ATA	5	7306	7320	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37229192
22	NC_016713	TGAA	3	7391	7401	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37229192
23	NC_016713	AAG	4	7447	7458	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37229192
24	NC_016713	TAAA	4	7541	7555	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	37229192
25	NC_016713	TAT	4	7748	7759	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229192
26	NC_016713	AATA	3	8009	8019	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37229192
27	NC_016713	ATA	4	8312	8323	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37229193
28	NC_016713	AAATT	3	9130	9143	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	37229193
29	NC_016713	ATA	8	9164	9187	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37229193
30	NC_016713	ATAA	3	9200	9211	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37229193
31	NC_016713	AATT	3	9212	9223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37229193
32	NC_016713	AT	6	9353	9363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37229193
33	NC_016713	ATAAA	3	9433	9446	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	37229193
34	NC_016713	AAAT	3	9626	9637	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37229193
35	NC_016713	AAGA	3	9823	9833	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016713	AAAT	3	10232	10242	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37229193
37	NC_016713	ATTT	3	10975	10985	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37229193
38	NC_016713	TTA	4	11006	11017	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229193
39	NC_016713	TAT	4	11111	11121	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37229193
40	NC_016713	TAA	4	11645	11656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	37229193
41	NC_016713	TCT	4	11903	11914	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37229193
42	NC_016713	AAAT	3	12038	12050	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	37229193
43	NC_016713	TAAAA	3	12242	12255	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	37229193
44	NC_016713	TAA	4	12533	12543	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37229193
45	NC_016713	TATT	3	12679	12690	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016713	TTAA	3	13008	13018	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016713	TAAA	5	13032	13052	21	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
48	NC_016713	TAAA	3	13107	13117	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016713	ATT	4	13376	13387	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016713	ATAAAA	3	13417	13435	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016713	TAA	4	13477	13489	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016713	TTTA	4	13753	13767	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016713	ATTTAA	3	14528	14546	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_016713	AATAAA	3	14728	14745	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016713	TTAAA	3	14749	14763	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016713	TAA	4	14790	14802	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016713	TTTA	3	14824	14835	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016713	AAAT	3	14890	14901	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016713	TA	9	15220	15236	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_016713	ATTTT	3	15244	15258	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016713	TTAAAT	3	15282	15299	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016713	TAAT	4	15303	15318	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016713	ATA	4	15380	15392	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016713	TAA	4	15519	15529	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016713	ATAA	3	15603	15614	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016713	A	13	15708	15720	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016713	T	36	15937	15972	36	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_016713	A	14	15973	15986	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016713	A	27	16051	16077	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Liriomyza bryoniae mitochondrion