ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium arboreum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016712CAATA3460846231660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
2NC_016712ATTTT3485148641420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_016712TTTTA3493149451520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_016712CTTAT3978297971620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
5NC_016712ATTCT39987100001420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
6NC_016712TTTCT31269912712140 %80 %0 %20 %7 %37229191
7NC_016712AAAAT337886379001580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016712TAATT344728447411440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
9NC_016712AGAAT350632506461560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
10NC_016712GTTTT35115451167140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
11NC_016712TTATT351400514131420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_016712ATTCT354163541761420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
13NC_016712TAGAA354202542151460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
14NC_016712TTAAT454565545831940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
15NC_016712TTTCA358042580571620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
16NC_016712TTTTC46449464513200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
17NC_016712TTATA379372793851440 %60 %0 %0 %7 %37229191
18NC_016712CACTT384154841671420 %40 %0 %40 %7 %37229191
19NC_016712TATCA386222862371640 %40 %0 %20 %6 %37229191
20NC_016712ATATG390645906591540 %40 %20 %0 %6 %37229191
21NC_016712AACGG392229922421440 %0 %40 %20 %7 %37229191
22NC_016712GAAAG398409984241660 %0 %40 %0 %6 %37229191
23NC_016712TCCGG39927699290150 %20 %40 %40 %6 %37229191
24NC_016712TTCTA51042921043152420 %60 %0 %20 %8 %37229192
25NC_016712AAGAA31047801047941580 %0 %20 %0 %0 %37229192
26NC_016712TAAAG41094821095012060 %20 %20 %0 %5 %37229192
27NC_016712AGAAA31142191142341680 %0 %20 %0 %6 %37229192
28NC_016712AAATA31238261238391480 %20 %0 %0 %7 %37229192
29NC_016712TTCTT3126800126814150 %80 %0 %20 %6 %37229192
30NC_016712CTATT31306361306501520 %60 %0 %20 %6 %37229192
31NC_016712ACTTT41394341394532020 %60 %0 %20 %5 %37229192
32NC_016712TTTCT3144136144150150 %80 %0 %20 %0 %37229192
33NC_016712ACCGG31496401496541520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
34NC_016712CTTTC3150507150522160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
35NC_016712CATAC31509171509301440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding