ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Gossypium arboreum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016712AAGT3113111411150 %25 %25 %0 %9 %37229183
2NC_016712AT7171617281350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_016712AAAT3205520661275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016712CAATA3460846231660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
5NC_016712ATCT3470647171225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
6NC_016712ATTTT3485148641420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016712ATT5487348881633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016712TTTTA3493149451520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_016712TGT449464956110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016712TTCA3497749881225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
11NC_016712GTT450435053110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
12NC_016712GAATAA3510651241966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
13NC_016712A145660567314100 %0 %0 %0 %7 %37229184
14NC_016712T1259565967120 %100 %0 %0 %8 %37229184
15NC_016712AAAT4649965141675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_016712TTTA3658465951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_016712A166643665816100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
18NC_016712TAA4667266831266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016712AAT4669067011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016712ATAG3838883991250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
21NC_016712TAT4841184221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016712ATTT3865886691225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_016712AATC3874687561150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
24NC_016712ATTT4884988631525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_016712CTTAT3978297971620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
26NC_016712ATTCT39987100001420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
27NC_016712T141233712350140 %100 %0 %0 %7 %37229191
28NC_016712TTTCT31269912712140 %80 %0 %20 %7 %37229191
29NC_016712TCTA313497135081225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
30NC_016712AAT413550135611266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
31NC_016712AAAT314119141301275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_016712C131467514687130 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
33NC_016712T121470314714120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016712TTTA414748147621525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
35NC_016712CT81707017085160 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
36NC_016712TTA417216172271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_016712ATG718263182832133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229184
38NC_016712T151930319317150 %100 %0 %0 %6 %37229184
39NC_016712TTTA323426234371225 %75 %0 %0 %8 %37229184
40NC_016712TAA423964239741166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229184
41NC_016712GTT42439624407120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229184
42NC_016712T122701727028120 %100 %0 %0 %0 %37229184
43NC_016712GATA327260272701150 %25 %25 %0 %9 %37229184
44NC_016712GAA427847278581266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
45NC_016712AT628085280961250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_016712TAT428527285371133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016712CTAA329100291111250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
48NC_016712T143027930292140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
49NC_016712GAAA331443314541275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016712ATCA331643316531150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
51NC_016712TTCA432486325011625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
52NC_016712TG63261232623120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016712TA832915329301650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
54NC_016712ATTTTG333289333051716.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
55NC_016712AATA333532335431275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_016712TCTT33360533617130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
57NC_016712GTTT33394333954120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
58NC_016712GAAA335931359421275 %0 %25 %0 %8 %37229185
59NC_016712TTGC33633236342110 %50 %25 %25 %9 %37229185
60NC_016712TTA437079370901233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_016712AG637152371621150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
62NC_016712ATCT337351373621225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
63NC_016712TA637364373751250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016712AAAT337415374261275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016712AAAAT337886379001580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
66NC_016712TGAA437965379791550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
67NC_016712ATA438096381061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_016712AAATAA338148381651883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
69NC_016712ATA538229382441666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_016712ATA438275382871366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
71NC_016712TAA438344383541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_016712TAAT338362383731250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
73NC_016712AAAT338392384041375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
74NC_016712GATC338989389991125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
75NC_016712AATG342336423471250 %25 %25 %0 %8 %37229185
76NC_016712TG64277842788110 %50 %50 %0 %9 %37229185
77NC_016712ATCT444060440751625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
78NC_016712AT1344447444712550 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_016712TAATT344728447411440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
80NC_016712ATA444843448551366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
81NC_016712TAG446516465261133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229185
82NC_016712AT646794468061350 %50 %0 %0 %7 %37229185
83NC_016712GTAA346830468401150 %25 %25 %0 %9 %37229185
84NC_016712TTTG34834448355120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
85NC_016712AT948390484061750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
86NC_016712AAT448410484211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_016712AT648469484791150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
88NC_016712TA649100491131450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_016712TAA449607496191366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
90NC_016712ATTTTT349625496421816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
91NC_016712TAA549671496851566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
92NC_016712AAAG349696497071275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
93NC_016712ATT550294503071433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
94NC_016712T155053350547150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
95NC_016712AGAAT350632506461560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
96NC_016712AT851001510151550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
97NC_016712CATA351058510681150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
98NC_016712GTTTT35115451167140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
99NC_016712ACAT351352513621150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
100NC_016712TTATT351400514131420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
101NC_016712CAAA352491525021275 %0 %0 %25 %8 %37229186
102NC_016712GTCT35310153112120 %50 %25 %25 %8 %37229186
103NC_016712TTA453328533391233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_016712CAA453833538431166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
105NC_016712GTTT35386653878130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
106NC_016712GATT353904539151225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
107NC_016712ATTTCG353948539641716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
108NC_016712TA654011540231350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
109NC_016712ATTCT354163541761420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
110NC_016712TAGAA354202542151460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
111NC_016712ATTT354216542261125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
112NC_016712AATC554244542621950 %25 %0 %25 %10 %Non-Coding
113NC_016712TTAAT454565545831940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
114NC_016712AGAA354797548081275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
115NC_016712TTTCA358042580571620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
116NC_016712AAAG360601606111175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
117NC_016712ATTT362328623391225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
118NC_016712TAGT362352623631225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
119NC_016712ATT562450624641533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
120NC_016712TTTA362853628651325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
121NC_016712TCTA363392634031225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
122NC_016712TTTTC46449464513200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
123NC_016712CTT46552065531120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229187
124NC_016712TTTC36721467224110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
125NC_016712G126724567256120 %0 %100 %0 %8 %Non-Coding
126NC_016712AAT467476674871266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_016712ATA467593676031166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
128NC_016712TCT46913069142130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
129NC_016712T176937169387170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
130NC_016712A12694466945712100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
131NC_016712ATT671455714731933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
132NC_016712TAAA371826718371275 %25 %0 %0 %8 %37229187
133NC_016712ATA572025720381466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
134NC_016712TCAT373365733761225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
135NC_016712GAAC373708737191250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
136NC_016712TTTA374641746521225 %75 %0 %0 %8 %37229191
137NC_016712A14748987491114100 %0 %0 %0 %7 %37229191
138NC_016712TGAA376458764681150 %25 %25 %0 %9 %37229191
139NC_016712CTT47808778097110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229191
140NC_016712TTATA379372793851440 %60 %0 %0 %7 %37229191
141NC_016712ACA479788797991266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37229191
142NC_016712A13807228073413100 %0 %0 %0 %7 %37229191
143NC_016712TTGA381501815131325 %50 %25 %0 %7 %37229191
144NC_016712A12820838209412100 %0 %0 %0 %8 %37229191
145NC_016712TTTC38243682446110 %75 %0 %25 %9 %37229191
146NC_016712CACTT384154841671420 %40 %0 %40 %7 %37229191
147NC_016712CTTT38437584385110 %75 %0 %25 %9 %37229191
148NC_016712A12854238543412100 %0 %0 %0 %0 %37229191
149NC_016712AT686121861321250 %50 %0 %0 %8 %37229191
150NC_016712TATCA386222862371640 %40 %0 %20 %6 %37229191
151NC_016712TTAA386502865131250 %50 %0 %0 %8 %37229191
152NC_016712TTTC38675586766120 %75 %0 %25 %8 %37229191
153NC_016712AT686891869011150 %50 %0 %0 %9 %37229191
154NC_016712AATT387601876111150 %50 %0 %0 %9 %37229191
155NC_016712TTAT387738877491225 %75 %0 %0 %8 %37229191
156NC_016712AATT388380883911250 %50 %0 %0 %8 %37229191
157NC_016712ATA488422884331266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229191
158NC_016712CTT48882088831120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229191
159NC_016712GAT489292893021133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229191
160NC_016712ATATG390645906591540 %40 %20 %0 %6 %37229191
161NC_016712GAT490688906981133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229191
162NC_016712AACGG392229922421440 %0 %40 %20 %7 %37229191
163NC_016712TTCT39238892398110 %75 %0 %25 %9 %37229191
164NC_016712ATCG393146931581325 %25 %25 %25 %7 %37229191
165NC_016712CTTT39357593585110 %75 %0 %25 %9 %37229191
166NC_016712AGA494413944231166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229191
167NC_016712TGAT395457954691325 %50 %25 %0 %7 %37229191
168NC_016712AATA396340963521375 %25 %0 %0 %7 %37229191
169NC_016712GAAGGA397126971431850 %0 %50 %0 %5 %37229191
170NC_016712CTAATT398299983151733.33 %50 %0 %16.67 %5 %37229191
171NC_016712GAAAG398409984241660 %0 %40 %0 %6 %37229191
172NC_016712TCCGG39927699290150 %20 %40 %40 %6 %37229191
173NC_016712TTTGTT3102306102324190 %83.33 %16.67 %0 %10 %37229191
174NC_016712TTC4103700103711120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229192
175NC_016712T17103769103785170 %100 %0 %0 %5 %37229192
176NC_016712TTCTA51042921043152420 %60 %0 %20 %8 %37229192
177NC_016712AGTATT31043261043421733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229192
178NC_016712TATTAG41043491043712333.33 %50 %16.67 %0 %4 %37229192
179NC_016712ATTAGT31043761043921733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229192
180NC_016712AAGAA31047801047941580 %0 %20 %0 %0 %37229192
181NC_016712TCTA31080611080721225 %50 %0 %25 %8 %37229192
182NC_016712AAGG31082101082201150 %0 %50 %0 %9 %37229192
183NC_016712TAAAG41094821095012060 %20 %20 %0 %5 %37229192
184NC_016712GAGG31109511109621225 %0 %75 %0 %8 %37229192
185NC_016712AGGT31111631111741225 %25 %50 %0 %8 %37229192
186NC_016712TAAG31122831122931150 %25 %25 %0 %9 %37229192
187NC_016712AT61133951134051150 %50 %0 %0 %9 %37229192
188NC_016712AGAAA31142191142341680 %0 %20 %0 %6 %37229192
189NC_016712GAA51144001144141566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229192
190NC_016712GAGG31150691150791125 %0 %75 %0 %9 %37229192
191NC_016712A1711519211520817100 %0 %0 %0 %5 %37229192
192NC_016712A1311531411532613100 %0 %0 %0 %7 %37229192
193NC_016712A1311583711584913100 %0 %0 %0 %7 %37229192
194NC_016712TCTT3116462116473120 %75 %0 %25 %8 %37229192
195NC_016712AT61167061167161150 %50 %0 %0 %9 %37229192
196NC_016712A1911708711710519100 %0 %0 %0 %5 %37229192
197NC_016712AGTT31179121179221125 %50 %25 %0 %9 %37229192
198NC_016712GAAT31180701180811250 %25 %25 %0 %0 %37229192
199NC_016712ATTA31182331182441250 %50 %0 %0 %8 %37229192
200NC_016712AAG41190121190231266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229192
201NC_016712AAT41192501192621366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229192
202NC_016712TAA41198621198731266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229192
203NC_016712AAATA31238261238391480 %20 %0 %0 %7 %37229192
204NC_016712AAAG31240391240501275 %0 %25 %0 %8 %37229192
205NC_016712CAAA31248591248691175 %0 %0 %25 %9 %37229192
206NC_016712ATCA31261001261111250 %25 %0 %25 %0 %37229192
207NC_016712TTCTT3126800126814150 %80 %0 %20 %6 %37229192
208NC_016712TCTT3128327128337110 %75 %0 %25 %9 %37229192
209NC_016712TTAAGT31283411283571733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229192
210NC_016712TA81284831284971550 %50 %0 %0 %6 %37229192
211NC_016712ATTT31298741298861325 %75 %0 %0 %7 %37229192
212NC_016712CAA41300081300181166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229192
213NC_016712TGAA41301241301391650 %25 %25 %0 %6 %37229192
214NC_016712CTATT31306361306501520 %60 %0 %20 %6 %37229192
215NC_016712TAT41306581306701333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229192
216NC_016712TA71311181311301350 %50 %0 %0 %7 %37229192
217NC_016712AACA31311941312051275 %0 %0 %25 %8 %37229192
218NC_016712A1313125113126313100 %0 %0 %0 %7 %37229192
219NC_016712A1313163613164813100 %0 %0 %0 %7 %37229192
220NC_016712TAT41316491316591133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37229192
221NC_016712TAA51319391319541666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229192
222NC_016712ATTT31329071329171125 %75 %0 %0 %9 %37229192
223NC_016712GTT4133304133315120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229192
224NC_016712ATTT31338801338921325 %75 %0 %0 %7 %37229192
225NC_016712ATT41345281345391233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229192
226NC_016712AAT51345591345721466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229192
227NC_016712TA61355271355371150 %50 %0 %0 %9 %37229192
228NC_016712CTTA31366381366481125 %50 %0 %25 %9 %37229192
229NC_016712ACTTT41394341394532020 %60 %0 %20 %5 %37229192
230NC_016712CCTT3140711140721110 %50 %0 %50 %9 %37229192
231NC_016712GGAT31412551412661225 %25 %50 %0 %8 %37229192
232NC_016712TTTCT3144136144150150 %80 %0 %20 %0 %37229192
233NC_016712ACTAAT31445391445551750 %33.33 %0 %16.67 %5 %37229192
234NC_016712ACTAAT41445591445812350 %33.33 %0 %16.67 %4 %37229192
235NC_016712A1614515114516616100 %0 %0 %0 %6 %37229192
236NC_016712AATA41451991452141675 %25 %0 %0 %6 %37229192
237NC_016712GAA41452201452311266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229192
238NC_016712ACCGG31496401496541520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
239NC_016712TTTC3149827149838120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
240NC_016712CTTTC3150507150522160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
241NC_016712CATAC31509171509301440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
242NC_016712CTCCTT3151787151804180 %50 %0 %50 %5 %37229191
243NC_016712ATCA31535041535161350 %25 %0 %25 %7 %37229191
244NC_016712TGAT31535991536111325 %50 %25 %0 %7 %37229191
245NC_016712ACC41537081537181133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229191
246NC_016712TTC4154507154517110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229191
247NC_016712AAAG31553461553561175 %0 %25 %0 %9 %37229191
248NC_016712CGAT31557731557851325 %25 %25 %25 %7 %37229191
249NC_016712TATT31564051564161225 %75 %0 %0 %8 %37229191
250NC_016712ATC41582331582431133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
251NC_016712ATC41596291596391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229191
252NC_016712GAA51600991601131566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229191