ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium mustelinum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016711ATT5487348871533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_016711TGT449404950110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016711GTT450375047110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016711TAA4666666771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016711AAT4668466951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016711TAT4841684271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_016711AAT413574135851266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_016711TTA417222172331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_016711ATG718269182892133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229176
10NC_016711TAA423970239801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229176
11NC_016711GTT42440224413120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229176
12NC_016711GAA427853278641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016711TAT428534285441133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016711TTA437132371431233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016711ATA538275382901666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_016711ATA538340383551666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016711TAA438424384341166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016711ATA444938449501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_016711TAG446611466211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229177
20NC_016711AAT448501485111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_016711AAT448523485331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_016711TAA449696497081366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016711ATT550388504011433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_016711TTA453422534331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_016711CAA453927539371166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
26NC_016711ATT562557625711533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_016711CTT46562965640120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229178
28NC_016711AAT467580675911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016711ATA467697677071166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_016711TCT46923369245130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
31NC_016711ATT671554715721933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
32NC_016711ATA572130721431466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016711CTT47818778197110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229183
34NC_016711TAA486658866681166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229183
35NC_016711ATA488523885341266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229183
36NC_016711CTT48892188932120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229183
37NC_016711GAT489393894031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229183
38NC_016711GAT490785907951133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229183
39NC_016711AGA494504945141166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229183
40NC_016711TTC4103797103808120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229183
41NC_016711GAA51144911145051566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229183
42NC_016711AAG41190971191081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229183
43NC_016711AAT41193351193471366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229183
44NC_016711TAA41199531199641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229183
45NC_016711CAA41301001301101166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229183
46NC_016711TAT41307491307611333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229183
47NC_016711TAA51320221320371666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229183
48NC_016711GTT4133387133398120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229183
49NC_016711ATT41346151346261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229183
50NC_016711AAT51346461346591466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229183
51NC_016711GAA41453001453111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229183
52NC_016711ACC41537941538041133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229182
53NC_016711TTC4154593154603110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229182
54NC_016711ATC41583131583231133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
55NC_016711ATC41597051597151133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229183
56NC_016711GAA51601751601891566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229183