ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Gossypium mustelinum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016711AAGT3112411341150 %25 %25 %0 %9 %37229175
2NC_016711AT7170217141350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_016711AAAT3204720581275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016711CAATA3460846231660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
5NC_016711ATCT3470647171225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
6NC_016711ATTTT3485148641420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016711ATT5487348871533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016711TTTTA3492549391520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_016711TGT449404950110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016711TTCA3497149821225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
11NC_016711GTT450375047110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
12NC_016711GAATAA3510051181966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
13NC_016711GAAAAA3565456721983.33 %0 %16.67 %0 %10 %37229175
14NC_016711AAAT4649365081675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
15NC_016711TTTA3657865891225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_016711A166637665216100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016711TAA4666666771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_016711AAT4668466951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016711ATAG3839384041250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016711TAT4841684271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_016711ATTT3866386741225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016711AATC3875187611150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
23NC_016711ATTT4885488681525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_016711CTTAT3979698111620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
25NC_016711ATTCT39996100091420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
26NC_016711T141236212375140 %100 %0 %0 %7 %37229183
27NC_016711TTTCT31272412737140 %80 %0 %20 %7 %37229183
28NC_016711TCTA313522135331225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
29NC_016711AAT413574135851266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
30NC_016711AAAT314143141541275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_016711TTTA414764147781525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_016711CT81707617091160 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
33NC_016711TTA417222172331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016711ATG718269182892133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229176
35NC_016711T151930919323150 %100 %0 %0 %6 %37229176
36NC_016711TTTA323432234431225 %75 %0 %0 %8 %37229176
37NC_016711TAA423970239801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229176
38NC_016711GTT42440224413120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229176
39NC_016711T122702327034120 %100 %0 %0 %0 %37229176
40NC_016711GATA327266272761150 %25 %25 %0 %9 %37229176
41NC_016711GAA427853278641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
42NC_016711AT628091281021250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_016711TAT428534285441133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
44NC_016711CTAA329108291191250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
45NC_016711T133028730299130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
46NC_016711GAAA331450314611275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
47NC_016711ATCA331650316601150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
48NC_016711TTCA432518325331625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
49NC_016711TG63264432655120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016711TA832947329621650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
51NC_016711ATTTTG333332333481716.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
52NC_016711AATA333575335861275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016711TCTT33365333665130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
54NC_016711GTTT33399134002120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016711GAAA335984359951275 %0 %25 %0 %8 %37229176
56NC_016711TTGC33638536395110 %50 %25 %25 %9 %37229176
57NC_016711TTA437132371431233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_016711AG637205372151150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
59NC_016711ATCT337404374151225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
60NC_016711TA637417374281250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_016711AAAT337468374791275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_016711TGAA438019380331550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
63NC_016711AAATAA538196382263183.33 %16.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
64NC_016711AT838250382641550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
65NC_016711ATA538275382901666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
66NC_016711ATA538340383551666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
67NC_016711TAA438424384341166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_016711TAAT338442384531250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
69NC_016711AAAT338472384841375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_016711GATC339069390791125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
71NC_016711AATG342416424271250 %25 %25 %0 %8 %37229177
72NC_016711TG64285842868110 %50 %50 %0 %9 %37229177
73NC_016711ATCT444140441551625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
74NC_016711AT1744529445603250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
75NC_016711ATTT344761447721225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016711TAATT344823448361440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_016711ATA444938449501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_016711TAG446611466211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229177
79NC_016711AT646889469011350 %50 %0 %0 %7 %37229177
80NC_016711GTAA346925469351150 %25 %25 %0 %9 %37229177
81NC_016711TTTG34844548456120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016711AT648491485031350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
83NC_016711AAT448501485111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
84NC_016711AAT448523485331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_016711AT648567485771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_016711TA749193492081650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
87NC_016711TCATTT349678496941716.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
88NC_016711TAA449696497081366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_016711ATTTTT349714497311816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
90NC_016711AAAG349790498011275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
91NC_016711ATT550388504011433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
92NC_016711T145062750640140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_016711AGAAT350725507391560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
94NC_016711AT851094511081550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
95NC_016711CATA351151511611150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
96NC_016711GTTTT35124751260140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
97NC_016711ACAT351445514551150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
98NC_016711TTATT351493515061420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
99NC_016711CAAA352584525951275 %0 %0 %25 %8 %37229177
100NC_016711A12527185272912100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
101NC_016711GTCT35319553206120 %50 %25 %25 %8 %37229177
102NC_016711TTA453422534331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_016711CAA453927539371166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
104NC_016711GTTT35396053972130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
105NC_016711GATT353998540091225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
106NC_016711ATTTCG354042540581716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
107NC_016711TA654105541171350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
108NC_016711ATTCT354257542701420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
109NC_016711TAGAA354296543091460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
110NC_016711ATTT354310543201125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
111NC_016711AATC554338543561950 %25 %0 %25 %10 %Non-Coding
112NC_016711TTAAT454659546771940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
113NC_016711AGAA354892549031275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
114NC_016711TTTCA358135581501620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
115NC_016711ATTT362435624461225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_016711TAGT362459624701225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
117NC_016711ATT562557625711533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
118NC_016711TTTA362960629721325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
119NC_016711TCTA363499635101225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
120NC_016711TTTTC46459764616200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
121NC_016711A12651096512012100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
122NC_016711CTT46562965640120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229178
123NC_016711T126605266063120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
124NC_016711TTTC36731767327110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
125NC_016711G136734867360130 %0 %100 %0 %7 %Non-Coding
126NC_016711AAT467580675911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_016711ATA467697677071166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
128NC_016711TCT46923369245130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
129NC_016711TATTTT369476694931816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
130NC_016711A12695476955812100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
131NC_016711C127131571326120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
132NC_016711ATT671554715721933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
133NC_016711TAAA371931719421275 %25 %0 %0 %8 %37229179
134NC_016711AT672094721051250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
135NC_016711ATA572130721431466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
136NC_016711TCAT373477734881225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
137NC_016711GAAC373820738311250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
138NC_016711TTTA374748747591225 %75 %0 %0 %8 %37229183
139NC_016711TGAA376558765681150 %25 %25 %0 %9 %37229183
140NC_016711CTT47818778197110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229183
141NC_016711TTATA379472794851440 %60 %0 %0 %7 %37229183
142NC_016711A13808238083513100 %0 %0 %0 %7 %37229183
143NC_016711TTGA381607816191325 %50 %25 %0 %7 %37229183
144NC_016711A12821898220012100 %0 %0 %0 %8 %37229183
145NC_016711TTTC38254282552110 %75 %0 %25 %9 %37229183
146NC_016711CACTT384260842731420 %40 %0 %40 %7 %37229183
147NC_016711CTTT38448184491110 %75 %0 %25 %9 %37229183
148NC_016711AT686224862351250 %50 %0 %0 %8 %37229183
149NC_016711TATCA386325863401640 %40 %0 %20 %6 %37229183
150NC_016711TTAA386610866211250 %50 %0 %0 %8 %37229183
151NC_016711TAA486658866681166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229183
152NC_016711TTTC38686386874120 %75 %0 %25 %8 %37229183
153NC_016711AT686999870091150 %50 %0 %0 %9 %37229183
154NC_016711AATT387703877131150 %50 %0 %0 %9 %37229183
155NC_016711TTAT387840878511225 %75 %0 %0 %8 %37229183
156NC_016711AATT388482884931250 %50 %0 %0 %8 %37229183
157NC_016711ATA488523885341266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229183
158NC_016711CTT48892188932120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229183
159NC_016711GAT489393894031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229183
160NC_016711ATATG390742907561540 %40 %20 %0 %6 %37229183
161NC_016711GAT490785907951133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229183
162NC_016711AACGG392326923391440 %0 %40 %20 %7 %37229183
163NC_016711TTCT39248592495110 %75 %0 %25 %9 %37229183
164NC_016711ATCG393243932551325 %25 %25 %25 %7 %37229183
165NC_016711CTTT39367293682110 %75 %0 %25 %9 %37229183
166NC_016711AGA494504945141166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229183
167NC_016711TGAT395548955601325 %50 %25 %0 %7 %37229183
168NC_016711AATA396431964431375 %25 %0 %0 %7 %37229183
169NC_016711GAAGGA397217972341850 %0 %50 %0 %5 %37229183
170NC_016711CTAATT398396984121733.33 %50 %0 %16.67 %5 %37229183
171NC_016711GAAAG398506985211660 %0 %40 %0 %6 %37229183
172NC_016711TCCGG39937399387150 %20 %40 %40 %6 %37229183
173NC_016711TTTGTT3102403102421190 %83.33 %16.67 %0 %10 %37229183
174NC_016711TTC4103797103808120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229183
175NC_016711T16103866103881160 %100 %0 %0 %6 %37229183
176NC_016711TTCTA51043881044112420 %60 %0 %20 %8 %37229183
177NC_016711AGTATT31044221044381733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229183
178NC_016711TATTAG41044451044672333.33 %50 %16.67 %0 %4 %37229183
179NC_016711ATTAGT31044721044881733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229183
180NC_016711AAGAA31048761048901580 %0 %20 %0 %0 %37229183
181NC_016711TCTA31081571081681225 %50 %0 %25 %8 %37229183
182NC_016711AAGG31083061083161150 %0 %50 %0 %9 %37229183
183NC_016711TAAAG51095731095972560 %20 %20 %0 %8 %37229183
184NC_016711GAGG31110471110581225 %0 %75 %0 %8 %37229183
185NC_016711AGGT31112591112701225 %25 %50 %0 %8 %37229183
186NC_016711TAAG31123791123891150 %25 %25 %0 %9 %37229183
187NC_016711AT61134861134961150 %50 %0 %0 %9 %37229183
188NC_016711AGAAA31143101143251680 %0 %20 %0 %6 %37229183
189NC_016711GAA51144911145051566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229183
190NC_016711GAGG31151601151701125 %0 %75 %0 %9 %37229183
191NC_016711A1711527711529317100 %0 %0 %0 %5 %37229183
192NC_016711A1311539911541113100 %0 %0 %0 %7 %37229183
193NC_016711A1311592211593413100 %0 %0 %0 %7 %37229183
194NC_016711TCTT3116547116558120 %75 %0 %25 %8 %37229183
195NC_016711AT61167911168011150 %50 %0 %0 %9 %37229183
196NC_016711A1911717211719019100 %0 %0 %0 %5 %37229183
197NC_016711AGTT31179971180071125 %50 %25 %0 %9 %37229183
198NC_016711GAAT31181551181661250 %25 %25 %0 %0 %37229183
199NC_016711ATTA31183181183291250 %50 %0 %0 %8 %37229183
200NC_016711AAG41190971191081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229183
201NC_016711AAT41193351193471366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229183
202NC_016711TAA41199531199641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229183
203NC_016711AAATA31239181239311480 %20 %0 %0 %7 %37229183
204NC_016711AAAG31241311241421275 %0 %25 %0 %8 %37229183
205NC_016711CAAA31249511249611175 %0 %0 %25 %9 %37229183
206NC_016711ATCA31261921262031250 %25 %0 %25 %0 %37229183
207NC_016711TTCTT3126892126906150 %80 %0 %20 %6 %37229183
208NC_016711TCTT3128419128429110 %75 %0 %25 %9 %37229183
209NC_016711TTAAGT31284331284491733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229183
210NC_016711TA81285751285891550 %50 %0 %0 %6 %37229183
211NC_016711ATTT31299721299841325 %75 %0 %0 %7 %37229183
212NC_016711CAA41301001301101166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229183
213NC_016711TGAA41302161302311650 %25 %25 %0 %6 %37229183
214NC_016711CTATT31307271307411520 %60 %0 %20 %6 %37229183
215NC_016711TAT41307491307611333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229183
216NC_016711TA71312081312201350 %50 %0 %0 %7 %37229183
217NC_016711AACA31312841312951275 %0 %0 %25 %8 %37229183
218NC_016711A1313133613134813100 %0 %0 %0 %7 %37229183
219NC_016711ATATT31317311317451540 %60 %0 %0 %6 %37229183
220NC_016711TAA51320221320371666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229183
221NC_016711ATTT31329901330001125 %75 %0 %0 %9 %37229183
222NC_016711GTT4133387133398120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229183
223NC_016711ATTT31339631339751325 %75 %0 %0 %7 %37229183
224NC_016711ATT41346151346261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229183
225NC_016711AAT51346461346591466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229183
226NC_016711TAAAAT31346661346831866.67 %33.33 %0 %0 %5 %37229183
227NC_016711TA61356131356231150 %50 %0 %0 %9 %37229183
228NC_016711CTTA31367191367291125 %50 %0 %25 %9 %37229183
229NC_016711ACTTT41395151395342020 %60 %0 %20 %5 %37229183
230NC_016711CCTT3140792140802110 %50 %0 %50 %9 %37229183
231NC_016711GGAT31413361413471225 %25 %50 %0 %8 %37229183
232NC_016711TTTCT3144217144231150 %80 %0 %20 %0 %37229183
233NC_016711ACTAAT31446201446361750 %33.33 %0 %16.67 %5 %37229183
234NC_016711ACTAAT41446401446622350 %33.33 %0 %16.67 %4 %37229183
235NC_016711A1514523214524615100 %0 %0 %0 %6 %37229183
236NC_016711AATA41452791452941675 %25 %0 %0 %6 %37229183
237NC_016711GAA41453001453111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229183
238NC_016711ACCGG31497201497341520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
239NC_016711TTTC3149907149918120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
240NC_016711CTTTC3150587150602160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
241NC_016711CATAC31509971510101440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
242NC_016711CTCCTT3151873151890180 %50 %0 %50 %5 %37229182
243NC_016711ATCA31535901536021350 %25 %0 %25 %7 %37229182
244NC_016711TGAT31536851536971325 %50 %25 %0 %7 %37229182
245NC_016711ACC41537941538041133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229182
246NC_016711TTC4154593154603110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229182
247NC_016711AAAG31554261554361175 %0 %25 %0 %9 %37229182
248NC_016711CGAT31558531558651325 %25 %25 %25 %7 %37229182
249NC_016711TATT31564851564961225 %75 %0 %0 %8 %37229182
250NC_016711ATC41583131583231133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
251NC_016711ATC41597051597151133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229183
252NC_016711GAA51601751601891566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229183