ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Millettia pinnata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016708	ATT	4	225	236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016708	AAG	4	2196	2207	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424951
3	NC_016708	TCT	5	2232	2245	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37424951
4	NC_016708	ACA	4	3344	3355	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424951
5	NC_016708	ATA	4	6712	6722	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016708	TAA	4	9164	9174	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016708	ATA	4	10193	10204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016708	ATA	4	10441	10452	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016708	TAA	4	12905	12915	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016708	AGT	4	13243	13254	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016708	AAT	4	14459	14471	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016708	AAT	4	14617	14628	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016708	AAT	4	15858	15870	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37424952
14	NC_016708	TAA	4	18531	18543	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016708	TAA	4	18940	18951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016708	ATA	4	18987	18999	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016708	CAT	4	22480	22490	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424952
18	NC_016708	AGA	4	24029	24039	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424952
19	NC_016708	TAA	5	28900	28913	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016708	ATC	4	29976	29987	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016708	GTA	4	32046	32056	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016708	AAC	4	37308	37319	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424953
23	NC_016708	GAA	4	38815	38826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424953
24	NC_016708	CAT	4	40606	40617	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424953
25	NC_016708	GTT	5	46317	46331	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	37424953
26	NC_016708	TAT	4	47363	47374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016708	ATA	4	48587	48597	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424954
28	NC_016708	TGT	4	49913	49924	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424954
29	NC_016708	AAT	4	53158	53168	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016708	ATA	6	53176	53194	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_016708	AAT	4	53655	53665	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424954
32	NC_016708	ATC	4	54531	54542	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424954
33	NC_016708	TTA	7	57592	57613	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016708	AAT	6	57614	57632	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_016708	TAT	4	59031	59042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016708	ATT	4	62977	62988	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016708	ATT	4	65451	65462	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016708	AAT	4	65460	65471	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016708	ACT	4	66956	66967	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424955
40	NC_016708	TAT	4	68594	68604	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424951
41	NC_016708	ATT	4	73266	73277	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424951
42	NC_016708	AAT	4	74198	74209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424951
43	NC_016708	ATT	6	75326	75342	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37424951
44	NC_016708	TAT	4	77858	77868	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424951
45	NC_016708	ATA	4	79796	79808	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37424951
46	NC_016708	CAA	4	80177	80188	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424951
47	NC_016708	TTA	5	80418	80432	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37424951
48	NC_016708	TAA	6	81453	81470	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37424951
49	NC_016708	TAA	6	81474	81491	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37424951
50	NC_016708	ACG	4	83465	83476	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424951
51	NC_016708	CTT	4	83508	83519	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424951
52	NC_016708	GAT	4	83976	83986	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424951
53	NC_016708	GAT	4	85366	85376	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424951
54	NC_016708	ATT	4	111301	111313	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37424956
55	NC_016708	TAA	4	111827	111838	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424956
56	NC_016708	TTA	4	112300	112310	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424956
57	NC_016708	ATT	5	112422	112435	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37424956
58	NC_016708	TAT	4	117513	117524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424956
59	NC_016708	ATA	4	118935	118945	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424956
60	NC_016708	TAT	4	119542	119556	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37424956
61	NC_016708	ATT	4	123494	123506	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37424956
62	NC_016708	TAT	4	125968	125979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424956
63	NC_016708	TAT	7	126406	126426	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	37424956
64	NC_016708	TTC	4	140379	140389	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37424959
65	NC_016708	AAT	4	145182	145193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424959
66	NC_016708	ACC	4	146193	146203	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	37424959
67	NC_016708	ATC	4	150994	151004	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016708	ATC	4	152384	152394	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424959
69	NC_016708	GAA	5	152850	152864	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37424959
70	NC_016708	TCG	4	152896	152907	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424959

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Millettia pinnata chloroplast