ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Millettia pinnata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016708	TATATT	3	7	25	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016708	AT	8	50	65	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016708	TTATA	4	147	165	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_016708	TA	7	162	174	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016708	TA	8	180	194	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016708	ATT	4	225	236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016708	TTTA	3	241	251	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016708	AAGT	3	1122	1132	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37424951
9	NC_016708	AAAT	3	2027	2038	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016708	AAG	4	2196	2207	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424951
11	NC_016708	TCT	5	2232	2245	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37424951
12	NC_016708	ATAA	4	2730	2746	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	37424951
13	NC_016708	CATT	3	2753	2764	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37424951
14	NC_016708	ACA	4	3344	3355	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424951
15	NC_016708	TA	6	3739	3749	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016708	TC	6	3839	3849	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016708	TA	6	4743	4754	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016708	T	12	6644	6655	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016708	T	17	6674	6690	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_016708	ATA	4	6712	6722	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016708	TTGG	3	7069	7081	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016708	A	15	9148	9162	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016708	TAA	4	9164	9174	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016708	T	13	9561	9573	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016708	AAGA	3	10015	10025	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016708	ATA	4	10193	10204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016708	ATTAT	3	10422	10435	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016708	ATA	4	10441	10452	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016708	A	12	10911	10922	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016708	A	12	11716	11727	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016708	GAAA	3	12553	12564	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016708	A	14	12784	12797	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016708	TA	6	12823	12833	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016708	TAA	4	12905	12915	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016708	CAAA	3	13194	13204	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016708	AGT	4	13243	13254	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016708	T	14	14202	14215	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016708	T	19	14296	14314	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_016708	TAAA	3	14411	14421	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016708	AAT	4	14459	14471	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016708	AT	6	14501	14511	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016708	AAT	4	14617	14628	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016708	TA	6	14629	14640	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016708	A	16	14659	14674	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016708	TATTAA	3	14751	14769	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_016708	AAT	4	15858	15870	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37424952
47	NC_016708	T	13	16656	16668	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	37424952
48	NC_016708	TCTT	3	18199	18210	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37424952
49	NC_016708	TTTCTT	3	18485	18503	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
50	NC_016708	TAA	4	18531	18543	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016708	ATTT	3	18610	18622	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016708	TA	6	18673	18684	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016708	TAA	4	18940	18951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016708	ATA	4	18987	18999	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016708	TCTT	3	21385	21396	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37424952
56	NC_016708	CAT	4	22480	22490	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424952
57	NC_016708	AGA	4	24029	24039	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424952
58	NC_016708	TAAA	3	24634	24645	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016708	AT	7	24743	24755	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016708	ATTT	3	24904	24915	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016708	AT	7	25032	25044	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016708	A	12	25109	25120	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016708	AT	9	25672	25688	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016708	CT	6	25819	25829	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016708	TTTGA	3	25866	25879	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016708	AT	6	26011	26022	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016708	AAGC	3	26618	26628	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37424953
68	NC_016708	TTTC	3	28766	28776	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016708	TAA	5	28900	28913	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016708	TCTATT	3	29014	29031	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016708	AAATA	3	29190	29204	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016708	AAAT	3	29294	29305	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016708	TA	6	29792	29802	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016708	A	13	29900	29912	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016708	ATC	4	29976	29987	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016708	CTTA	3	30117	30127	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016708	TA	6	30182	30192	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016708	TCTT	3	30303	30315	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016708	T	13	30335	30347	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016708	CCAT	3	30764	30774	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016708	AT	6	30922	30932	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016708	AAAC	3	30979	30990	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016708	TCTT	3	30991	31001	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016708	AGAAA	3	31165	31179	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016708	AT	7	31614	31629	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016708	GTA	4	32046	32056	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016708	AATT	3	32385	32397	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016708	T	13	33291	33303	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016708	AAAT	3	33333	33343	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016708	AT	9	33401	33418	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_016708	ATGA	3	33976	33986	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016708	AAC	4	37308	37319	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424953
93	NC_016708	CAAA	3	37868	37879	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	37424953
94	NC_016708	GAA	4	38815	38826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424953
95	NC_016708	CAT	4	40606	40617	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424953
96	NC_016708	ATTT	3	42278	42288	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37424953
97	NC_016708	A	13	42484	42496	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37424953
98	NC_016708	A	12	42591	42602	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	37424953
99	NC_016708	AATA	3	43365	43375	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37424953
100	NC_016708	ATTT	3	44660	44670	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016708	A	14	44716	44729	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016708	TTACTA	3	45522	45538	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016708	A	12	45617	45628	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016708	ACTT	3	45833	45843	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37424953
105	NC_016708	GTT	5	46317	46331	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	37424953
106	NC_016708	AT	6	46544	46554	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016708	A	14	46613	46626	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016708	TA	6	46792	46804	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016708	CATTCA	3	46884	46900	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
110	NC_016708	AT	6	47095	47105	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016708	TAT	4	47363	47374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016708	A	15	47757	47771	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016708	ATTT	3	47965	47976	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016708	AT	6	48103	48113	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016708	ATA	4	48587	48597	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424954
116	NC_016708	A	15	48931	48945	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	37424954
117	NC_016708	AATT	3	49393	49405	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37424954
118	NC_016708	TGT	4	49913	49924	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424954
119	NC_016708	TTTA	3	50471	50482	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37424954
120	NC_016708	AAAG	3	51673	51684	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016708	T	12	52002	52013	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016708	ATTT	3	52651	52662	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016708	T	12	52665	52676	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016708	A	15	52698	52712	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016708	TTCT	3	52741	52752	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016708	TA	7	52995	53007	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016708	AAT	4	53158	53168	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016708	ATA	6	53176	53194	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
129	NC_016708	ATTT	3	53384	53395	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016708	AACT	3	53482	53494	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	37424954
131	NC_016708	AAT	4	53655	53665	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424954
132	NC_016708	ATC	4	54531	54542	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424954
133	NC_016708	AT	7	55054	55067	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016708	T	13	55183	55195	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016708	TAAA	3	55257	55267	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016708	ATTTTG	3	55429	55445	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_016708	T	15	55607	55621	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016708	A	13	56049	56061	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37424954
139	NC_016708	TAAT	3	56508	56519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37424954
140	NC_016708	A	14	57006	57019	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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270	NC_016708	CTTTT	3	124740	124754	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	37424956
271	NC_016708	T	13	124813	124825	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37424956
272	NC_016708	T	18	124982	124999	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	37424956
273	NC_016708	T	15	125238	125252	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	37424956
274	NC_016708	TC	6	125956	125967	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37424956
275	NC_016708	TAT	4	125968	125979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424956
276	NC_016708	TCTATT	3	126155	126173	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	37424956
277	NC_016708	A	12	126335	126346	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	37424956
278	NC_016708	TAT	7	126406	126426	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	37424956
279	NC_016708	TAAA	3	127184	127196	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	37424956
280	NC_016708	TA	9	127985	128002	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	37424956
281	NC_016708	T	14	128821	128834	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	37424956
282	NC_016708	CTTA	3	129883	129893	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37424956
283	NC_016708	CCTT	3	133948	133958	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37424956
284	NC_016708	AGAT	4	134083	134098	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	37424956
285	NC_016708	CCCT	3	136710	136721	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	37424956
286	NC_016708	ACTAAT	4	137765	137787	23	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	4 %	37424956
287	NC_016708	AATAGA	3	137798	137814	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	37424956
288	NC_016708	AAAT	3	138324	138335	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37424956
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290	NC_016708	ATCT	3	143257	143269	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
291	NC_016708	T	12	143621	143632	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016708	AAT	4	145182	145193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424959
293	NC_016708	ATCA	3	146004	146016	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	37424959
294	NC_016708	ACC	4	146193	146203	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	37424959
295	NC_016708	AT	6	146667	146677	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37424959
296	NC_016708	AAAG	3	147846	147856	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37424959
297	NC_016708	CGAT	3	148252	148264	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	37424959
298	NC_016708	TATT	3	148884	148895	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37424959
299	NC_016708	TATT	3	150833	150844	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
300	NC_016708	ATC	4	150994	151004	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
301	NC_016708	ATC	4	152384	152394	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424959
302	NC_016708	GAA	5	152850	152864	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37424959
303	NC_016708	TCG	4	152896	152907	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424959

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Millettia pinnata chloroplast