ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ctenoptilum vasava mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016704	TAAA	3	208	218	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016704	T	17	284	300	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	37229167
3	NC_016704	ATTT	3	468	478	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37229167
4	NC_016704	TCT	4	779	790	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37229167
5	NC_016704	T	14	853	866	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37229167
6	NC_016704	TTAT	3	1109	1120	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37229167
7	NC_016704	T	15	1143	1157	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	37229167
8	NC_016704	T	14	1255	1268	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	37229167
9	NC_016704	TAT	4	1951	1962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229167
10	NC_016704	GAAA	3	2238	2249	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37229167
11	NC_016704	ATA	8	2843	2866	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37229167
12	NC_016704	ATCA	3	2872	2882	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37229167
13	NC_016704	ATT	4	2891	2901	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37229167
14	NC_016704	ATA	4	3174	3186	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37229167
15	NC_016704	ATT	4	3303	3313	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37229167
16	NC_016704	ATT	4	3857	3868	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016704	TAT	5	4601	4614	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37229167
18	NC_016704	TTA	4	4846	4857	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	37229167
19	NC_016704	ATT	5	4862	4875	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37229167
20	NC_016704	T	15	4994	5008	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	37229167
21	NC_016704	CAAA	3	5194	5206	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	37229167
22	NC_016704	TATTTA	3	5507	5525	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_016704	TAT	9	5591	5617	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37229167
24	NC_016704	TAT	6	5622	5638	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37229167
25	NC_016704	ATTTT	3	5854	5867	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	37229167
26	NC_016704	TAA	4	6317	6327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016704	TA	6	6462	6473	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37229167
28	NC_016704	ATAA	3	6790	6802	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	37229167
29	NC_016704	TTA	4	7284	7295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37229167
30	NC_016704	ATA	4	7389	7403	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37229167
31	NC_016704	TAA	4	7827	7839	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37229167
32	NC_016704	ATA	4	7853	7865	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37229167
33	NC_016704	A	21	8095	8115	21	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	37229167
34	NC_016704	ATTT	3	8137	8147	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37229167
35	NC_016704	ATA	4	8293	8305	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37229167
36	NC_016704	ATTAAT	3	8409	8426	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	37229167
37	NC_016704	TAAT	5	8446	8465	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	37229167
38	NC_016704	TAAA	3	9050	9060	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37229167
39	NC_016704	AAAAT	3	9084	9097	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	37229167
40	NC_016704	AAAAT	3	9223	9236	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	37229167
41	NC_016704	TAAATA	3	9263	9279	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37229167
42	NC_016704	A	17	9461	9477	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	37229167
43	NC_016704	ATT	4	9543	9554	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	37229167
44	NC_016704	TA	6	9685	9695	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37229167
45	NC_016704	TAATA	3	9769	9782	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	37229167
46	NC_016704	T	16	9859	9874	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016704	ATT	5	9971	9985	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016704	AAAT	3	9999	10010	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37229168
49	NC_016704	ATT	5	10183	10197	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37229168
50	NC_016704	TAA	8	10381	10404	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37229168
51	NC_016704	ATTT	4	10457	10472	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	37229168
52	NC_016704	GTA	4	10478	10489	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37229168
53	NC_016704	AATT	3	10588	10599	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37229168
54	NC_016704	ATT	4	10891	10904	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37229168
55	NC_016704	TAAT	3	11258	11270	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37229168
56	NC_016704	TAAA	3	12150	12161	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37229168
57	NC_016704	TTAA	3	12191	12202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37229168
58	NC_016704	ATTAAA	3	12229	12246	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	37229168
59	NC_016704	TAA	4	12291	12303	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37229168
60	NC_016704	A	13	12362	12374	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37229168
61	NC_016704	TAA	5	12809	12822	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016704	ATT	4	12840	12851	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016704	T	14	13053	13066	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016704	TTTTTA	3	13215	13233	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
65	NC_016704	TAAAT	5	13542	13566	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016704	T	13	13661	13673	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016704	TTAA	3	13726	13736	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016704	T	13	14171	14183	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016704	AAATT	3	14198	14211	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016704	TTTA	3	14403	14414	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016704	TAATTT	3	14493	14511	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_016704	AATT	4	14655	14670	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016704	TTTA	3	14678	14689	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016704	ATTT	3	14812	14822	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016704	TA	6	15037	15048	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016704	T	23	15066	15088	23	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
77	NC_016704	AT	7	15271	15283	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016704	TA	14	15309	15335	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ctenoptilum vasava mitochondrion