ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phaeocystis antarctica strain CCMP1374 plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016703	ATG	4	1768	1780	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	52342061
2	NC_016703	ACA	4	3215	3226	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424941
3	NC_016703	ATC	4	5468	5479	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424942
4	NC_016703	TAA	4	9054	9066	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016703	TTG	4	11986	11996	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424942
6	NC_016703	TAT	4	13999	14011	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37424942
7	NC_016703	AAT	4	18513	18524	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016703	TCT	4	18978	18988	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37424943
9	NC_016703	CTG	4	19242	19253	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424943
10	NC_016703	TAT	4	19905	19916	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016703	ACC	4	20063	20073	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	37424943
12	NC_016703	ATA	4	21648	21658	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52342061
13	NC_016703	TAG	4	29979	29990	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37424944
14	NC_016703	CGT	4	32627	32638	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424945
15	NC_016703	CGT	4	32994	33005	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424945
16	NC_016703	ATT	4	33222	33233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37424945
17	NC_016703	ATT	4	33544	33555	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016703	ACA	4	45080	45091	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424946
19	NC_016703	CAT	4	45834	45844	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424946
20	NC_016703	CAA	4	49921	49932	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424946
21	NC_016703	TAA	4	51677	51688	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016703	TTG	4	52332	52343	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424946
23	NC_016703	GGC	4	54134	54145	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	37424946
24	NC_016703	CCA	4	56051	56062	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37424947
25	NC_016703	CAT	4	58629	58639	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424947
26	NC_016703	AAG	4	61823	61834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424947
27	NC_016703	TAT	4	61904	61914	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016703	TGT	4	62844	62854	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424947
29	NC_016703	ATA	5	64162	64175	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016703	CAT	4	65825	65835	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37424948
31	NC_016703	GTT	4	66321	66332	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424948
32	NC_016703	ATT	4	66625	66636	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016703	ATT	4	70871	70881	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424948
34	NC_016703	GTT	4	71265	71275	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424949
35	NC_016703	AGC	5	74594	74607	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	37424949
36	NC_016703	CAT	5	74837	74850	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016703	TGT	4	78190	78201	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37424949
38	NC_016703	TGT	4	78605	78615	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424949
39	NC_016703	AGA	4	79805	79817	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	37424949
40	NC_016703	TGC	4	79872	79882	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	37424949
41	NC_016703	TAA	4	80374	80385	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37424949
42	NC_016703	ATA	5	82929	82943	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52342061
43	NC_016703	ATT	4	85371	85382	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52342061
44	NC_016703	CTT	4	85808	85818	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52342061
45	NC_016703	TAT	4	90671	90681	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424950
46	NC_016703	AAC	4	91495	91506	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424950
47	NC_016703	TAA	4	93033	93043	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phaeocystis antarctica strain CCMP1374 plastid