ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phyllostachys propinqua chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016699	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424933
2	NC_016699	AAGT	3	786	796	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37424933
3	NC_016699	TCTTT	3	2602	2616	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	37424933
4	NC_016699	A	23	3556	3578	23	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
5	NC_016699	TTTA	3	4500	4511	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016699	CTT	4	4535	4546	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424933
7	NC_016699	TCTCT	3	4684	4697	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	37424933
8	NC_016699	TTCT	3	5143	5153	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37424933
9	NC_016699	TTAT	3	5868	5878	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016699	TTTAA	3	5981	5994	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016699	A	13	6151	6163	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016699	TAA	4	6391	6401	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016699	CTT	4	6794	6804	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016699	AGT	4	6908	6919	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016699	TTGAC	3	6978	6992	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016699	GAA	4	9004	9015	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016699	AAAT	3	9308	9318	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016699	GAAA	3	10914	10925	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37424933
19	NC_016699	TTG	4	11319	11329	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424933
20	NC_016699	AG	6	12036	12046	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016699	AAGT	3	12329	12339	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016699	CGTAG	3	12921	12934	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016699	CTTT	6	13245	13268	24	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016699	AATCT	3	13841	13854	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016699	CCTT	3	14721	14732	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016699	AAGA	3	14877	14888	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016699	TAA	4	15998	16009	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016699	TAT	4	16039	16049	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016699	ATTT	3	16463	16473	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016699	GTAT	3	17395	17405	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016699	TGAAT	3	17916	17930	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016699	TAA	4	18114	18124	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016699	ACTTCT	3	18214	18231	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016699	ATAC	4	18273	18288	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016699	TTTC	3	18877	18887	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016699	AAAT	3	18917	18928	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016699	TAAGAA	3	19089	19105	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_016699	AAAG	3	19369	19379	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016699	ATCA	3	19556	19566	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016699	ATGA	3	19914	19925	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016699	ATA	4	20866	20876	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016699	CTA	4	21207	21218	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016699	ATT	4	21315	21325	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016699	TTTC	3	22294	22306	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	37424934
45	NC_016699	AGA	4	22320	22331	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424934
46	NC_016699	AAAAG	3	23089	23102	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	37424934
47	NC_016699	AAC	4	24966	24977	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424934
48	NC_016699	AAT	5	26654	26668	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37424934
49	NC_016699	AGAA	3	26882	26893	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37424934
50	NC_016699	AT	6	27953	27963	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37424934
51	NC_016699	TTCA	3	29623	29633	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37424934
52	NC_016699	AGAAAG	3	29850	29866	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	37424934
53	NC_016699	GAA	4	30148	30159	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424934
54	NC_016699	ATTT	3	31761	31772	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016699	ATTTTA	3	31810	31828	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
56	NC_016699	TTAA	3	31852	31863	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016699	ATT	4	31922	31934	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016699	A	15	31965	31979	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016699	A	17	32007	32023	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_016699	AGA	4	32413	32423	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424934
61	NC_016699	AT	6	32872	32882	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016699	GTT	5	33606	33620	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	37424934
63	NC_016699	AT	6	34073	34083	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016699	TGC	4	34579	34590	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424934
65	NC_016699	CTTT	3	34846	34856	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016699	A	13	35870	35882	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37424934
67	NC_016699	AAAAG	3	36143	36156	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	37424934
68	NC_016699	AAAT	3	36652	36663	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37424934
69	NC_016699	TTTC	3	38482	38492	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016699	AAAAC	3	39293	39306	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016699	AAGA	3	41783	41794	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37424935
72	NC_016699	TG	6	42624	42634	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	37424935
73	NC_016699	CTAG	3	42726	42738	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	37424935
74	NC_016699	T	13	44093	44105	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016699	AAG	4	44719	44730	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424935
76	NC_016699	ATCA	3	44762	44772	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37424935
77	NC_016699	AGT	4	45128	45138	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424935
78	NC_016699	TCCT	3	45177	45188	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	37424935
79	NC_016699	TTTC	3	45281	45291	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37424935
80	NC_016699	TAG	4	46030	46040	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424935
81	NC_016699	A	29	46259	46287	29	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	37424935
82	NC_016699	TAT	4	46771	46781	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016699	GGGGAA	3	47328	47346	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016699	TA	6	48157	48167	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016699	ATCTTA	3	48436	48454	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
86	NC_016699	TTTTG	3	48803	48816	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016699	A	14	48899	48912	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016699	G	16	48963	48978	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016699	TTGA	3	49224	49236	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016699	CTT	4	50368	50379	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016699	TATT	3	50497	50508	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016699	CAGA	3	50991	51001	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37424935
93	NC_016699	T	14	52102	52115	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37424935
94	NC_016699	TAGG	4	54166	54181	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016699	AATT	3	56303	56314	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016699	AATA	4	58633	58649	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_016699	TTGAA	3	60750	60764	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016699	T	13	60909	60921	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016699	TCTT	3	61758	61769	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37424936
100	NC_016699	ATTC	3	61932	61942	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016699	TTC	4	62917	62928	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424936
102	NC_016699	TGTT	3	63110	63120	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016699	TCT	4	63344	63354	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016699	ATA	4	65281	65291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016699	TTA	4	65760	65771	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016699	TAAA	3	65966	65977	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016699	TTGAA	3	66087	66101	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	37424936
108	NC_016699	AAAG	3	66690	66700	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016699	CGTT	3	67039	67050	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016699	TATT	3	67613	67623	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016699	TTC	4	67669	67680	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016699	AAAT	3	67941	67952	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37424937
113	NC_016699	AT	7	68079	68091	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016699	ATA	4	68097	68107	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016699	T	12	68181	68192	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016699	AGAA	3	70962	70973	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	37424937
117	NC_016699	T	14	70994	71007	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37424937
118	NC_016699	TTTA	3	74293	74304	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37424937
119	NC_016699	A	15	74336	74350	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	37424937
120	NC_016699	GAAA	4	74402	74417	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	37424937
121	NC_016699	T	12	74536	74547	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	37424937
122	NC_016699	TCTT	5	76145	76163	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	37424937
123	NC_016699	TTTC	3	76870	76880	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37424937
124	NC_016699	AGA	4	76901	76912	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424937
125	NC_016699	TAT	4	77959	77969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424937
126	NC_016699	AGAA	3	78828	78838	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37424937
127	NC_016699	T	14	79132	79145	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	37424937
128	NC_016699	T	12	79150	79161	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	37424937
129	NC_016699	TTTTC	3	79735	79749	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	37424937
130	NC_016699	TTC	4	81490	81502	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37424937
131	NC_016699	TCT	4	83141	83154	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37424937
132	NC_016699	T	15	83233	83247	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	37424937
133	NC_016699	AGAAT	3	83626	83639	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	37424937
134	NC_016699	AATG	3	83640	83650	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37424937
135	NC_016699	TTC	4	84255	84265	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37424937
136	NC_016699	TA	6	87543	87554	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37424937
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phyllostachys propinqua chloroplast