Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium herbaceum subsp. africanum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016692ATT5487348881633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_016692TGT449464956110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016692GTT450435053110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016692TAA4667166821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016692AAT4668967001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016692TAT4841084211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_016692AAT413549135601266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_016692TTA417216172271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_016692ATG718263182832133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229147
10NC_016692TAA423964239741166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229147
11NC_016692GTT42439624407120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229147
12NC_016692GAA427847278581266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016692TAT428527285371133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016692TTA437105371161233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016692ATA438123381331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_016692ATA538256382711666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016692ATA438302383141366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_016692TAA438371383811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_016692ATA444870448821366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_016692TAG446556465661133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229148
21NC_016692AAT448450484611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016692TAA449647496591366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016692TAA549711497251566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_016692ATT550334503471433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_016692TTA453368533791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_016692CAA453873538831166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
27NC_016692ATT562514625281533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
28NC_016692CTT46558465595120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229149
29NC_016692AAT467540675511266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016692ATA467657676671166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_016692TCT46919469206130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
32NC_016692ATT671518715361933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
33NC_016692ATA572088721011466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
34NC_016692CTT47815078160110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229153
35NC_016692ACA479857798681266.67 %0 %0 %33.33 %8 %37229153
36NC_016692ATA488490885011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229153
37NC_016692CTT48888888899120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229153
38NC_016692GAT489360893701133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229153
39NC_016692GAT490756907661133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229153
40NC_016692AGA494481944911166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229153
41NC_016692TTC4103768103779120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229152
42NC_016692GAA51144711144851566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229152
43NC_016692AAG41190831190941266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229152
44NC_016692AAT41193211193331366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229152
45NC_016692TAA41199331199441266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229152
46NC_016692CAA41300901301001166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229152
47NC_016692TAT41307401307521333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229152
48NC_016692TAT41317311317411133.33 %66.67 %0 %0 %9 %37229152
49NC_016692TAA51320211320361666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229152
50NC_016692GTT4133386133397120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229152
51NC_016692ATT41346101346211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229152
52NC_016692AAT51346411346541466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229152
53NC_016692GAA41453051453161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229152
54NC_016692ACC41537931538031133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229154
55NC_016692TTC4154592154602110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229154
56NC_016692ATC41583181583281133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
57NC_016692ATC41597141597241133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229154
58NC_016692GAA51601841601981566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229154