ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium tomentosum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016690CAATA3462246371660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
2NC_016690ATTTT3486548781420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_016690TTTTA3493949531520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_016690CTTAT3981198261620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
5NC_016690ATTCT310011100241420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
6NC_016690TTTCT31274412757140 %80 %0 %20 %7 %37229144
7NC_016690TAATT344864448771440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_016690TATTT350721507351520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_016690AGAAT350820508341560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
10NC_016690GTTTT35134251355140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
11NC_016690TTATT351588516011420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_016690ATTCT354352543651420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
13NC_016690TAGAA354391544041460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
14NC_016690TTAAT454754547721940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
15NC_016690TTTCA358229582441620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
16NC_016690TTTTC46469264711200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
17NC_016690TTATA379578795911440 %60 %0 %0 %7 %37229143
18NC_016690CACTT384367843801420 %40 %0 %40 %7 %37229143
19NC_016690TATCA386434864491640 %40 %0 %20 %6 %37229143
20NC_016690ATATG390851908651540 %40 %20 %0 %6 %37229143
21NC_016690AACGG392435924481440 %0 %40 %20 %7 %37229143
22NC_016690GAAAG398615986301660 %0 %40 %0 %6 %37229143
23NC_016690TCCGG39948299496150 %20 %40 %40 %6 %37229143
24NC_016690TTCTA51045041045272420 %60 %0 %20 %8 %37229142
25NC_016690TAAAG51096901097142560 %20 %20 %0 %8 %37229142
26NC_016690AGAAA31144271144421680 %0 %20 %0 %6 %37229142
27NC_016690AAATA31240281240411480 %20 %0 %0 %7 %37229142
28NC_016690TTCTT3127002127016150 %80 %0 %20 %6 %37229142
29NC_016690CTATT31308371308511520 %60 %0 %20 %6 %37229142
30NC_016690ATATT31318481318621540 %60 %0 %0 %6 %37229142
31NC_016690ACTTT41396341396532020 %60 %0 %20 %5 %37229142
32NC_016690ACCGG31498471498611520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
33NC_016690CTTTC3150714150729160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
34NC_016690CATAC31511241511371440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding