ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium tomentosum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016690ATT5488749011533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_016690TGT449544964110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016690GTT450515061110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016690TAA4667966901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016690AAT4669767081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016690TAT4842384341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_016690AAT413595136061266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_016690TTA417260172711233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_016690ATG718307183272133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229137
10NC_016690TAA424008240181166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229137
11NC_016690GTT42444024451120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229137
12NC_016690GAA427886278971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016690TAT428568285781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016690TTA437140371511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016690ATA538311383261666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_016690ATA538370383851666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016690ATA438404384161366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_016690TAA438473384831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_016690ATA444979449911366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_016690TAG446652466621133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229138
21NC_016690AAT448556485661166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_016690TAA449792498041366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016690ATT550484504971433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_016690TTA453517535281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_016690CAA454022540321166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
26NC_016690ATT562649626631533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_016690CTT46572365734120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229139
28NC_016690AAT467673676841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016690ATA467796678061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_016690TCT46933269344130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
31NC_016690ATT671661716791933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
32NC_016690ATA572236722491466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016690CTT47829378303110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229143
34NC_016690ATA488632886431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229143
35NC_016690CTT48903089041120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229143
36NC_016690GAT489502895121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229143
37NC_016690GAT490894909041133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229143
38NC_016690AGA494613946231166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229143
39NC_016690TTC4103906103917120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229142
40NC_016690TAT51039441039581533.33 %66.67 %0 %0 %6 %37229142
41NC_016690GAA51146081146221566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229142
42NC_016690AAG41192141192251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229142
43NC_016690AAT41194521194641366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229142
44NC_016690TAA41200641200751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229142
45NC_016690CAA41302101302201166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229142
46NC_016690TAT41308591308711333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229142
47NC_016690TAA51321391321541666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229142
48NC_016690GTT4133504133515120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229142
49NC_016690ATT41347341347451233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229142
50NC_016690AAT51347651347781466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229142
51NC_016690ATA71453861454092466.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229142
52NC_016690GAA41454271454381266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229142
53NC_016690ACC41539211539311133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229144
54NC_016690TTC4154720154730110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229144
55NC_016690ATC41584401584501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
56NC_016690ATC41598321598421133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229144
57NC_016690GAA51603021603161566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229144