ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Gossypium tomentosum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016690AAGT3113111411150 %25 %25 %0 %9 %37229136
2NC_016690ATTT3165816681125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016690AT7171617281350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_016690AAAT3206120721275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016690CAATA3462246371660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
6NC_016690ATCT3472047311225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
7NC_016690ATTTT3486548781420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_016690ATT5488749011533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_016690TTTTA3493949531520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
10NC_016690TGT449544964110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016690TTCA3498549961225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_016690GTT450515061110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_016690GAATAA3511451321966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
14NC_016690A135669568113100 %0 %0 %0 %7 %37229136
15NC_016690AAAT4650765221675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_016690TTTA3659266031225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_016690TAA4667966901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_016690AAT4669767081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016690ATAG3840084111250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016690TAT4842384341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_016690ATTT3867086811225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016690AATC3875887681150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
23NC_016690ATTT4886188751525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_016690T1294289439120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
25NC_016690CTTAT3981198261620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
26NC_016690ATTCT310011100241420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
27NC_016690T141238212395140 %100 %0 %0 %7 %37229144
28NC_016690TTTCT31274412757140 %80 %0 %20 %7 %37229144
29NC_016690TCTA313542135531225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
30NC_016690AAT413595136061266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
31NC_016690AAAT314164141751275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_016690C121472014731120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
33NC_016690TTTA414791148051525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
34NC_016690CT81711417129160 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
35NC_016690TTA417260172711233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_016690ATG718307183272133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229137
37NC_016690T151934719361150 %100 %0 %0 %6 %37229137
38NC_016690TTTA323470234811225 %75 %0 %0 %8 %37229137
39NC_016690TAA424008240181166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229137
40NC_016690GTT42444024451120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229137
41NC_016690T122706127072120 %100 %0 %0 %0 %37229137
42NC_016690GATA327304273141150 %25 %25 %0 %9 %37229137
43NC_016690GAA427886278971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
44NC_016690A13279972800913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
45NC_016690AT628125281361250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_016690TAT428568285781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016690CTAA329142291531250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
48NC_016690T143032030333140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
49NC_016690GAAA331479314901275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016690ATCA331679316891150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
51NC_016690TTCA432522325371625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
52NC_016690TG63264832659120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016690TA832951329661650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
54NC_016690ATTTTG333334333501716.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
55NC_016690AATA333577335881275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_016690TCTT33365533667130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
57NC_016690GTTT33399334004120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
58NC_016690GAAA335992360031275 %0 %25 %0 %8 %37229138
59NC_016690TTGC33639336403110 %50 %25 %25 %9 %37229138
60NC_016690TTA437140371511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_016690AG637213372231150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
62NC_016690ATCT337412374231225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
63NC_016690TA637425374361250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016690AAAT337476374871275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016690TGAA438027380411550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
66NC_016690ATAAAT338184382021966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
67NC_016690AAATAA538232382623183.33 %16.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_016690AT838286383001550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
69NC_016690ATA538311383261666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_016690TATAAA338323383411966.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
71NC_016690ATA538370383851666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
72NC_016690ATA438404384161366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_016690TAA438473384831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_016690TAAT338491385021250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_016690AAAT338521385331375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
76NC_016690GATC339119391291125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
77NC_016690AATG342466424771250 %25 %25 %0 %8 %37229138
78NC_016690TG64290842918110 %50 %50 %0 %9 %37229138
79NC_016690ATCT444190442051625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
80NC_016690AT1644577446093350 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_016690TAATT344864448771440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
82NC_016690ATA444979449911366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
83NC_016690TAG446652466621133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229138
84NC_016690AT746937469511550 %50 %0 %0 %6 %37229138
85NC_016690GTAA346975469851150 %25 %25 %0 %9 %37229138
86NC_016690TTTG34850048511120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
87NC_016690AT648546485581350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_016690AAT448556485661166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_016690AT648627486371150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_016690ATAG348641486521250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
91NC_016690TAAA448684486991675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
92NC_016690TA649260492731450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_016690TAA449792498041366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
94NC_016690ATTTTT349810498271816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
95NC_016690AAAG349886498971275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
96NC_016690ATT550484504971433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
97NC_016690TATTT350721507351520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
98NC_016690AGAAT350820508341560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
99NC_016690AT851189512031550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
100NC_016690GTTTT35134251355140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
101NC_016690ACAT351540515501150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
102NC_016690TTATT351588516011420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
103NC_016690CAAA352679526901275 %0 %0 %25 %8 %37229138
104NC_016690A12528135282412100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
105NC_016690GTCT35329053301120 %50 %25 %25 %8 %37229139
106NC_016690TTA453517535281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_016690CAA454022540321166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
108NC_016690GTTT35405554067130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
109NC_016690GATT354093541041225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
110NC_016690ATTTCG354137541531716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
111NC_016690TA654200542121350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
112NC_016690ATTCT354352543651420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
113NC_016690TAGAA354391544041460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
114NC_016690AATC554433544511950 %25 %0 %25 %10 %Non-Coding
115NC_016690TTAAT454754547721940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
116NC_016690AGAA354986549971275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
117NC_016690TTTCA358229582441620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
118NC_016690AAAG360800608101175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
119NC_016690TAGT362551625621225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
120NC_016690ATT562649626631533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
121NC_016690TTTA363052630641325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
122NC_016690TCTA363591636021225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
123NC_016690TTTTC46469264711200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
124NC_016690CTT46572365734120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229139
125NC_016690T126614666157120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
126NC_016690T176740567421170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
127NC_016690AAT467673676841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
128NC_016690ATA467796678061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
129NC_016690TCT46933269344130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
130NC_016690T166957469589160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
131NC_016690A12696486965912100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_016690T157143071444150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
133NC_016690ATT671661716791933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
134NC_016690TAAA372037720481275 %25 %0 %0 %8 %37229140
135NC_016690AT672200722111250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
136NC_016690ATA572236722491466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
137NC_016690TCAT373583735941225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
138NC_016690GAAC373926739371250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
139NC_016690TTTA374854748651225 %75 %0 %0 %8 %37229143
140NC_016690A14751107512314100 %0 %0 %0 %7 %37229143
141NC_016690TGAA376664766741150 %25 %25 %0 %9 %37229143
142NC_016690CTT47829378303110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229143
143NC_016690TTATA379578795911440 %60 %0 %0 %7 %37229143
144NC_016690A13809308094213100 %0 %0 %0 %7 %37229143
145NC_016690TTGA381714817261325 %50 %25 %0 %7 %37229143
146NC_016690A12822968230712100 %0 %0 %0 %8 %37229143
147NC_016690TTTC38264982659110 %75 %0 %25 %9 %37229143
148NC_016690CACTT384367843801420 %40 %0 %40 %7 %37229143
149NC_016690CTTT38458884598110 %75 %0 %25 %9 %37229143
150NC_016690AT686333863441250 %50 %0 %0 %8 %37229143
151NC_016690TATCA386434864491640 %40 %0 %20 %6 %37229143
152NC_016690TTAA386719867301250 %50 %0 %0 %8 %37229143
153NC_016690TTTC38697286983120 %75 %0 %25 %8 %37229143
154NC_016690AT687108871181150 %50 %0 %0 %9 %37229143
155NC_016690AATT387812878221150 %50 %0 %0 %9 %37229143
156NC_016690TTAT387949879601225 %75 %0 %0 %8 %37229143
157NC_016690AATT388591886021250 %50 %0 %0 %8 %37229143
158NC_016690ATA488632886431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229143
159NC_016690CTT48903089041120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229143
160NC_016690GAT489502895121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229143
161NC_016690ATATG390851908651540 %40 %20 %0 %6 %37229143
162NC_016690GAT490894909041133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229143
163NC_016690AACGG392435924481440 %0 %40 %20 %7 %37229143
164NC_016690TTCT39259492604110 %75 %0 %25 %9 %37229143
165NC_016690ATCG393352933641325 %25 %25 %25 %7 %37229143
166NC_016690CTTT39378193791110 %75 %0 %25 %9 %37229143
167NC_016690AGA494613946231166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229143
168NC_016690TGAT395657956691325 %50 %25 %0 %7 %37229143
169NC_016690AATA396540965521375 %25 %0 %0 %7 %37229143
170NC_016690GAAGGA397326973431850 %0 %50 %0 %5 %37229143
171NC_016690CTAATT398505985211733.33 %50 %0 %16.67 %5 %37229143
172NC_016690GAAAG398615986301660 %0 %40 %0 %6 %37229143
173NC_016690TCCGG39948299496150 %20 %40 %40 %6 %37229143
174NC_016690TTTGTT3102512102530190 %83.33 %16.67 %0 %10 %37229143
175NC_016690TTC4103906103917120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229142
176NC_016690TAT51039441039581533.33 %66.67 %0 %0 %6 %37229142
177NC_016690T17103981103997170 %100 %0 %0 %5 %37229142
178NC_016690TTCTA51045041045272420 %60 %0 %20 %8 %37229142
179NC_016690AGTATT31045381045541733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229142
180NC_016690TATTAG41045611045832333.33 %50 %16.67 %0 %4 %37229142
181NC_016690ATTAGT31045881046041733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229142
182NC_016690TCTA31082741082851225 %50 %0 %25 %8 %37229142
183NC_016690AAGG31084231084331150 %0 %50 %0 %9 %37229142
184NC_016690TAAAG51096901097142560 %20 %20 %0 %8 %37229142
185NC_016690GAGG31111641111751225 %0 %75 %0 %8 %37229142
186NC_016690AGGT31113761113871225 %25 %50 %0 %8 %37229142
187NC_016690TAAG31124961125061150 %25 %25 %0 %9 %37229142
188NC_016690AT61136031136131150 %50 %0 %0 %9 %37229142
189NC_016690AGAAA31144271144421680 %0 %20 %0 %6 %37229142
190NC_016690GAA51146081146221566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229142
191NC_016690GAGG31152771152871125 %0 %75 %0 %9 %37229142
192NC_016690A1711539411541017100 %0 %0 %0 %5 %37229142
193NC_016690A1311551611552813100 %0 %0 %0 %7 %37229142
194NC_016690A1311603911605113100 %0 %0 %0 %7 %37229142
195NC_016690TCTT3116664116675120 %75 %0 %25 %8 %37229142
196NC_016690AT61169081169181150 %50 %0 %0 %9 %37229142
197NC_016690A1911728911730719100 %0 %0 %0 %5 %37229142
198NC_016690AGTT31181141181241125 %50 %25 %0 %9 %37229142
199NC_016690GAAT31182721182831250 %25 %25 %0 %0 %37229142
200NC_016690ATTA31184351184461250 %50 %0 %0 %8 %37229142
201NC_016690AAG41192141192251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229142
202NC_016690AAT41194521194641366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229142
203NC_016690TAA41200641200751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229142
204NC_016690AAATA31240281240411480 %20 %0 %0 %7 %37229142
205NC_016690AAAG31242411242521275 %0 %25 %0 %8 %37229142
206NC_016690CAAA31250611250711175 %0 %0 %25 %9 %37229142
207NC_016690ATCA31263021263131250 %25 %0 %25 %0 %37229142
208NC_016690TTCTT3127002127016150 %80 %0 %20 %6 %37229142
209NC_016690TCTT3128529128539110 %75 %0 %25 %9 %37229142
210NC_016690TTAAGT31285431285591733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229142
211NC_016690TA81286851286991550 %50 %0 %0 %6 %37229142
212NC_016690ATTT31300821300941325 %75 %0 %0 %7 %37229142
213NC_016690CAA41302101302201166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229142
214NC_016690TGAA41303261303411650 %25 %25 %0 %6 %37229142
215NC_016690CTATT31308371308511520 %60 %0 %20 %6 %37229142
216NC_016690TAT41308591308711333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229142
217NC_016690TA71313241313361350 %50 %0 %0 %7 %37229142
218NC_016690AACA31314001314111275 %0 %0 %25 %8 %37229142
219NC_016690A1413145213146514100 %0 %0 %0 %7 %37229142
220NC_016690ATATT31318481318621540 %60 %0 %0 %6 %37229142
221NC_016690TAA51321391321541666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229142
222NC_016690ATTT31331071331171125 %75 %0 %0 %9 %37229142
223NC_016690GTT4133504133515120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229142
224NC_016690ATTT31340861340981325 %75 %0 %0 %7 %37229142
225NC_016690ATT41347341347451233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229142
226NC_016690AAT51347651347781466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229142
227NC_016690TAAAAT31347851348021866.67 %33.33 %0 %0 %5 %37229142
228NC_016690TA61357321357421150 %50 %0 %0 %9 %37229142
229NC_016690CTTA31368381368481125 %50 %0 %25 %9 %37229142
230NC_016690ACTTT41396341396532020 %60 %0 %20 %5 %37229142
231NC_016690CCTT3140911140921110 %50 %0 %50 %9 %37229142
232NC_016690GGAT31414551414661225 %25 %50 %0 %8 %37229142
233NC_016690ACTAAT31447401447561750 %33.33 %0 %16.67 %5 %37229142
234NC_016690ACTAAT41447601447822350 %33.33 %0 %16.67 %4 %37229142
235NC_016690A1614535214536716100 %0 %0 %0 %6 %37229142
236NC_016690ATA71453861454092466.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229142
237NC_016690AATA31454101454211275 %25 %0 %0 %8 %37229142
238NC_016690GAA41454271454381266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229142
239NC_016690ACCGG31498471498611520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
240NC_016690TTTC3150034150045120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
241NC_016690CTTTC3150714150729160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
242NC_016690CATAC31511241511371440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
243NC_016690CTCCTT3152000152017180 %50 %0 %50 %5 %37229144
244NC_016690ATCA31537171537291350 %25 %0 %25 %7 %37229144
245NC_016690TGAT31538121538241325 %50 %25 %0 %7 %37229144
246NC_016690ACC41539211539311133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229144
247NC_016690TTC4154720154730110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229144
248NC_016690AAAG31555531555631175 %0 %25 %0 %9 %37229144
249NC_016690CGAT31559801559921325 %25 %25 %25 %7 %37229144
250NC_016690TATT31566121566231225 %75 %0 %0 %8 %37229144
251NC_016690ATC41584401584501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
252NC_016690ATC41598321598421133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229144
253NC_016690GAA51603021603161566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229144